Elucidation of the mechanism and pathway for duodenal carcinogenesis related to dysbiosis of duodenal mucosa-related microbiota

阐明与十二指肠粘膜相关菌群失调相关的十二指肠癌发生的机制和途径

基本信息

批准号：
21K07947
负责人：
土肥統
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Kyoto Prefectural University of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では十二指腸癌と関連する十二指腸粘膜由来細菌叢（duodenal mucosa-associated microbiota: D-MAM）から産生される腸内細菌叢由来発癌関連因子による十二指腸粘膜の遺伝子・分子異常について、腸管オルガノイド技術を駆使して解析し、十二指腸癌の早期発見や予防につながる先制医療の戦略開拓を行う予定である。十二指腸内視鏡検査において十二指腸癌患者および非癌患者を選定し、内視鏡下の粘膜ブラシ検体サンプリングを行った。回収した粘膜ブラシ検体から次世代シークエンサーを用いて16S rRNAメタゲノム解析を行い、大量の配列を取得し、相同性検索および系統分類解析を実施した。腫瘍群：健常群=30：24例であった。腫瘍群において、多様性を比較したところ、α多様性は部位による差を認めず、β多様性はWeighted, Unweightedともに口腔粘膜と十二指腸粘膜で有意差を認めた。腫瘍表面と周辺粘膜のMAMを比較したところ、門レベル、属レベルで占有率に有意差のあるものは認めなかった。十二指腸粘膜において腫瘍群と健常群を比較すると、門レベルでは、p__Firmicutes、p__Bacteroidetesが腫瘍群で減少していた。属レベルではg__Lactobacillus、g__Prevotella、g__Neisseriaが腫瘍群で減少しており、g__Pseudomonasやg__Faecalibacteriumが腫瘍群で増加していた。さらに、腫瘍群と健常群の口腔粘膜を比較すると、属レベルではg__Actinomyces、g__Granulicatellaが腫瘍群で増加していた。今後、メタボローム解析を行い、十二指腸粘膜由来細菌叢における代謝経路、MAM新規代謝物を同定する。また、サンプルよりサイトカイン、mRNA発現による遺伝子発現解析を行い、十二指腸癌発癌に繋がる新規候補代謝物・遺伝子産物の同定を行う予定である。

在这项研究中，我们计划分析由肠道菌群（D-MAM）与十二指肠粘膜相关的菌Microbiota（D-MAM）（D-MAM）产生的肠道微生物群（D-MAM）引起的十二指肠粘膜中的基因和分子异常，该基因生成因素（D-MAM）与十二指肠和开发策略相关的十二指肠菌群（D-MAM），该策略是对十二指肠癌的预测，并使用了Duododenal Carterive，并进行了对十二指肠的策略，并将其引导性策略protiention Duodenal Carterion与Duodenal Cartive du Dulederion Duleder。癌症。选择十二指肠癌患者和非癌症患者进行十二指肠内窥镜检查，并进行内窥镜粘膜样品样本。使用下一代测序仪从回收的粘膜刷标本中进行了16S rRNA宏基因组分析，并获得了大量序列，并进行了同源搜索和系统发育分类分析。肿瘤组：健康组= 30：24病例。在比较肿瘤组的多样性时，α多样性没有差异，具体取决于该地点，而口腔粘膜和十二指肠粘膜之间的β多样性在加权和未加权方面都显着差异。当比较肿瘤表面和周围粘膜的MAM时，在门或属水平上没有发现占用率的显着差异。在比较十二指肠粘膜中的肿瘤组和健康组时，肿瘤组的肿瘤组减少了p__firmicutes和p_Acteroidetetes。在肿瘤组中，在属水平上，肿瘤组降低了g__乳杆菌，G__prevotella和g__neisseria，而肿瘤组的G__pseudomonas和G__faecalibacterium增加了。此外，当比较肿瘤组和健康组的口服粘膜时，在该属水平的肿瘤组中，g__ accactinomyces和g__粒状会增加。代谢组学分析将来将在十二指肠粘膜衍生的细菌菌群中鉴定代谢途径和新的MAM代谢产物。此外，将使用细胞因子和样品中的细胞因子和mRNA表达进行基因表达分析，以鉴定导致十二指肠癌致癌作用的新候选代谢产物和基因产物。