遺伝性胆汁うっ滞疾患に対する全ゲノム解析による新規分子病態の発見と診断率の向上

通过遗传性胆汁淤积性疾病的全基因组分析发现新的分子病理学并提高诊断率

基本信息

批准号：
21K07854
负责人：
戸川貴夫
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

我々は2013年から胆汁うっ滞患者約700例に61遺伝子のエクソン領域について網羅的解析を行い，33％で分子遺伝学的診断を確定した．一方で，新生児乳児の未診断例において20％の患者は病原性バリアントを片アレルにだけもつ事を見出した．これは遺伝性胆汁うっ滞疾患に，遺伝子のエクソン領域の異常では説明できない病態がある事を示唆する．本研究はゲノム解析により，エンハンサー，プロモーターなどの発現調節領域，深いイントロンの異常，染色体構造異常に遺伝性胆汁うっ滞の新しい分子遺伝学的病態を求める．新たな責任遺伝子，病態の発見により遺伝性胆汁うっ滞の診断率向上と，将来の創薬開発へ研究の展開を目指すものである．2021年度から2022年度は全エクソン解析，全ゲノム解析により病原性バリアントの抽出を行った．先行して解析を行った対象は以下のように選定した．我々が過去に胆汁うっ滞遺伝子パネル（61遺伝子）を用いて網羅的遺伝子解析を行ったが，分子遺伝学的に診断確定に至らない患者で，かつ血清直接ビリルビンが5.0mg/dL以上の高度の胆汁うっ滞症例を選定した．先ず3例について全ゲノム解析の塩基配列決定実験を行った．候補バリアントについて，バイオインフォマティクス，知識データベースを活用して，分子遺伝学的病態解析に妥当なものを選択する作業をした．遺伝子コーディング領域やスプライスサイトで明らかな病原性のバリアントは同定されていない．しかし，深いイントロン領域やゲノム構造異常について引き続いてバイオインフォマティクスを活用して解析に取り組んでいる．また並行して17家系に全エクソン解析を行っており，こちらも新たな病的バリアントの探索を行っている．一部の家系で病原性変異の同定が得られている可能性があり，現在病原性について検討中である．

自2013年以来，我们对大约700例胆汁淤积患者的61例外显子区域进行了全面分析，并证实了33％的分子遗传诊断。另一方面，有20％的患者发现在未诊断的新生儿婴儿中，只有一个等位基因存在致病性变异。这表明，遗传性胆汁淤积存在一种病理学，无法通过基因外显子区域的异常来解释。这项研究研究了遗传性胆汁淤积的新分子遗传病理，包括表达调节区域，例如增强子和启动子，深层内含子的异常以及染色体结构异常。目的是通过发现新的负责基因和病理学来提高遗传性胆汁淤积的诊断率，并发展对未来药物发现发展的研究。使用整个外显子分析和整个基因组分析从2021年到2022年提取致病变异。先前分析的受试者如下选择。我们已经使用胆汁淤积基因面板（61个基因）进行了全面的遗传分析，并选择了高胆固醇高的患者，直接血清胆红素直接为5.0 mg/dl或更高的患者，在分子遗传上无法确认该诊断。首先，三个病例是用于整个基因组分析的测序实验。我们使用生物信息学和知识数据库选择适合分子遗传病理学分析的候选变异的数据库。在基因编码区或剪接位点尚未鉴定出明显的致病变异。但是，我们正在继续使用生物信息学来分析深层内含子区域和基因组结构异常。同时，所有外显子分析均已对17个家庭进行，这也正在寻找新的病理变体。某些家族中可能已经发现了致病性突变，并且正在研究致病性。