PDZRN3による核内のパラスペックルを介した新たな心筋分化制御機構の解明

阐明PDZRN3核副斑介导的心肌分化新控制机制

基本信息

批准号：
21K06803
负责人：
本田健
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yamaguchi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06803/
关键词：
液液相分離体細胞分化心筋細胞パラスペックル PDZRN3 液液相分離

项目摘要

本研究では、PDZRN3の心筋分化における役割の解明を目的としている。前年度では、iPS細胞から心筋細胞への分化過程におけるPDZRN3の発現挙動を明らかにしてきた。今年度は、iPS心筋細胞の分化過程におけるパラスペックル形成時期を調べ、パラスペックル形成とPDZRN3の発現時期の重なる分化ステージにあるiPS心筋細胞を用いて、パラスペックル構成因子も含めてPDZRN3と相互作用しうるタンパク質の探索を試みた。前年度、複数のパラスペックル構成タンパク質において、抗体が入手可能だったものに関しては、共免疫沈降法によるPDZRN3との結合を解析した。PDZRN3抗体を用いた共沈降では結合を確認できたものの、相手タンパク質に対する抗体では共沈降が確認されず、真に両者が結合するか慎重に見極める必要があると判断した。またパラスペックルをはじめとする液-液相分離体の構築や機能において、それらに関わる様々な制御因子についての新たな情報が出てきている。そのため、PDZRN3の作用標的がパラスペックル形成に関わる周辺制御因子である可能性も見据えた解析が必要であると考えた。そこで狙いを絞った個別解析から、プロテオミクス解析に切り替えて、心筋分化時におけるPDZRN3の相互作用相手を探索し、パラスペックルに直接または間接的関与を持つ因子（あるいは関与不明な未知因子）を一次情報として網羅的に獲得した。PDZRN3はタンパク質相互作用に関わるドメインやモチーフを複数持つため、相互作用相手タンパク質には、それらに対応するような構造要因を持つ可能性が高い。そのような構造情報も加味して、結合可能性の高さをスコア化したリストを作成し、順次詳細な解析を行おうとする段階まで進捗している。

这项研究旨在阐明PDZRN3在心肌分化中的作用。在上一个财政年度，PDZRN3在从IPS细胞到心脏肌肉细胞的分化过程中的表达得到了揭示。今年，我们在IPS心肌细胞的分化过程中检查了Pallaspecle的形成时间，并在PDZRN3的PDZRN3表达的重叠阶段使用IPS心肌细胞，包括我尝试搜索可能相互作用的蛋白质。在上一个财政年度，分析了通过多种par夹构型蛋白中获得的抗体与CO免疫沉积法与PDZRN3与PDZRN3的结合。尽管使用PDZRN3抗体在沉积物中证实了结合，但针对对手蛋白质的抗体尚未确认沉积物，并且判断两者是真正结合或仔细确定的。此外，有关它们所涉及的各种控制因素的新信息已经出现在液相分离的构建和功能中，包括par夹。因此，我们认为有必要预测PDZRN3动作靶标的可能性可能是Peruspecle的形成。因此，通过将蛋白质组学分析切换到蛋白质组学分析，在心肌噬菌体期间搜索PDZRN3的相互作用，主要因素（或涉及的未知因素）与帕斯皮克的直接或间接介入。由于PDZRN3具有与蛋白质相互作用相关的多个域和基序，因此相互作用对手蛋白的结构因子很有可能与它们相对应。此外，考虑到此类结构信息，对高键的可能性进行了评分，并且正在逐步进行详细分析的阶段。

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Synthetic retinoid bexarotene inhibits differentiation of inflammatory osteoclasts.

合成类视黄醇贝沙罗汀抑制炎症破骨细胞的分化。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hina Takegami;Hiyori Nakamura;Ayano Takeda;Mayu Matsuo;Hiroki Sakai;Takeshi Honda;Masataka Asagiri
通讯作者：
Masataka Asagiri

Dantrolene, a stabilizer of the ryanodine receptor, prevents collagen-induced arthritis.

Dantrolene 是兰尼碱受体的稳定剂，可预防胶原诱导的关节炎。

DOI：
10.1016/j.bbrc.2022.07.111
发表时间：
2022
期刊：
Biochem Biophys Res Commun.
影响因子：
0
作者：
58)Nawata T;Sakai H;Honda T;Otsuka M;Fujita H;Uchinoumi H;Kobayashi S;Yamamoto T;Asagiri M;Yano M.
通讯作者：
Yano M.

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