PDZRN3による核内のパラスペックルを介した新たな心筋分化制御機構の解明

阐明PDZRN3核副斑介导的心肌分化新控制机制

基本信息

批准号：
21K06803
负责人：
本田健
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yamaguchi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06803/
关键词：
液液相分離体細胞分化心筋細胞パラスペックル PDZRN3 液液相分離

项目摘要

本研究では、PDZRN3の心筋分化における役割の解明を目的としている。前年度では、iPS細胞から心筋細胞への分化過程におけるPDZRN3の発現挙動を明らかにしてきた。今年度は、iPS心筋細胞の分化過程におけるパラスペックル形成時期を調べ、パラスペックル形成とPDZRN3の発現時期の重なる分化ステージにあるiPS心筋細胞を用いて、パラスペックル構成因子も含めてPDZRN3と相互作用しうるタンパク質の探索を試みた。前年度、複数のパラスペックル構成タンパク質において、抗体が入手可能だったものに関しては、共免疫沈降法によるPDZRN3との結合を解析した。PDZRN3抗体を用いた共沈降では結合を確認できたものの、相手タンパク質に対する抗体では共沈降が確認されず、真に両者が結合するか慎重に見極める必要があると判断した。またパラスペックルをはじめとする液-液相分離体の構築や機能において、それらに関わる様々な制御因子についての新たな情報が出てきている。そのため、PDZRN3の作用標的がパラスペックル形成に関わる周辺制御因子である可能性も見据えた解析が必要であると考えた。そこで狙いを絞った個別解析から、プロテオミクス解析に切り替えて、心筋分化時におけるPDZRN3の相互作用相手を探索し、パラスペックルに直接または間接的関与を持つ因子（あるいは関与不明な未知因子）を一次情報として網羅的に獲得した。PDZRN3はタンパク質相互作用に関わるドメインやモチーフを複数持つため、相互作用相手タンパク質には、それらに対応するような構造要因を持つ可能性が高い。そのような構造情報も加味して、結合可能性の高さをスコア化したリストを作成し、順次詳細な解析を行おうとする段階まで進捗している。

这项研究旨在阐明PDZRN3在心肌分化中的作用。在上一年，已经阐明了从IPS细胞到心肌细胞的分化过程中PDZRN3的表达行为。今年，我们研究了IPS心肌细胞分化过程中拼接形成的时间，并试图寻找可以与PDZRN3相互作用的蛋白质，包括使用IPS型心肌细胞，包括拼贴构成因素，这些因素是在差异阶段，在哪些拼接阶段是拼接式形成和Pdzrn3表达的阶段。在上一年，对于可获得抗体的几种拼贴组成蛋白，通过共免疫沉淀分析与PDZRN3的结合。尽管使用PDZRN3抗体的共沉淀证实了结合，但对伴侣蛋白的抗体未证实共沉淀，并且确定有必要仔细确定两者是否真正结合。此外，已经出现了有关与液态液相分离器（包括拼贴器）的构建和功能有关的各种调节因素的新信息。因此，我们认为有必要考虑PDZRN3的作用靶标的可能性是参与拼接形成的外围调节剂的可能性。因此，我们从靶向的个体分析转换为蛋白质组学分析，在心肌分化过程中搜索PDZRN3的相互作用伙伴，并全面获得的因素直接或间接参与拼叠（或未知因素未知因素）作为主要信息。 PDZRN3具有蛋白质相互作用的多个域和基序，因此相互作用的伴侣蛋白可能具有相应的结构因子。考虑到这些结构信息，创建了高可能性分数的列表，并且进步已取得了依次执行详细分析的阶段。

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Synthetic retinoid bexarotene inhibits differentiation of inflammatory osteoclasts.

合成类视黄醇贝沙罗汀抑制炎症破骨细胞的分化。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hina Takegami;Hiyori Nakamura;Ayano Takeda;Mayu Matsuo;Hiroki Sakai;Takeshi Honda;Masataka Asagiri
通讯作者：
Masataka Asagiri

Dantrolene, a stabilizer of the ryanodine receptor, prevents collagen-induced arthritis.

Dantrolene 是兰尼碱受体的稳定剂，可预防胶原诱导的关节炎。

DOI：
10.1016/j.bbrc.2022.07.111
发表时间：
2022
期刊：
Biochem Biophys Res Commun.
影响因子：
0
作者：
58)Nawata T;Sakai H;Honda T;Otsuka M;Fujita H;Uchinoumi H;Kobayashi S;Yamamoto T;Asagiri M;Yano M.
通讯作者：
Yano M.

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