DISSERTATION RESEARCH: Elucidating the genomic signature of mate competition in a pipefish using a population genomics approach

论文研究:利用群体基因组学方法阐明海龙交配竞争的基因组特征

基本信息

  • 批准号:
    1401688
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.89万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Standard Grant
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2014-06-01 至 2017-05-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This study aims to understand how adult behavior can determine which genes are passed from parents to offspring and how these processes vary among populations within a species. These goals will be addressed by comparing the natural genetic variation in adults and their offspring within a single population of pipefish. This study will also quantify genetic variation in multiple populations across a broad geographic range, which will provide data regarding how reproductive patterns vary among populations. The focal organism is the straight-nosed pipefish, Nerophis ophidion, which is found in Sweden, and the project takes advantage of recent advances in DNA sequencing technology to analyze the genetic variation at the scale of the entire genome. This species is of interest because females compete intensely for access to mates and the males provide all care for the developing offspring. This project addresses a major subject in biology and genetics, namely how behaviors at different stages during the life cycle affect how genes are passed on from one generation to the next. Additionally, the analytical approach of comparing genetic variation between adults and offspring using new sequencing technologies is a novel combination of a mathematical model from the 1970's and new statistical methods. This approach could have broad applications in many fields and for many species, including as a diagnostic tool for understanding what pressures are affecting threatened and endangered species and for understanding multi-generational effects of human diseases.
这项研究旨在了解成年行为如何决定哪些基因从父母传递给后代,以及这些过程如何在一个物种内的种群之间发生变化。这些目标将通过比较单个海龙种群中成体及其后代的自然遗传变异来实现。这项研究还将量化广泛地理范围内多个人群的遗传变异,这将提供有关人群之间生殖模式如何变化的数据。焦点生物是在瑞典发现的直鼻海龙 Nerophis ophidion,该项目利用 DNA 测序技术的最新进展来分析整个基因组规模的遗传变异。这个物种之所以引起人们的兴趣,是因为雌性为了获得交配而激烈竞争,而雄性则为发育中的后代提供一切照顾。该项目解决了生物学和遗传学的一个主要课题,即生命周期中不同阶段的行为如何影响基因从一代传递到下一代的方式。此外,使用新测序技术比较成人和后代之间遗传变异的分析方法是 20 世纪 70 年代数学模型和新统计方法的新颖结合。这种方法可以在许多领域和许多物种中得到广泛的应用,包括作为一种诊断工具,用于了解哪些压力正在影响受威胁和濒危物种,以及了解人类疾病的多代影响。

项目成果

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    Standard Grant
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