Funktionelle und strukturelle Charakterisierung von Interaktionen zwischen nicht-kodierenden RNAs und Polycomb repressive complex 2

非编码 RNA 与 Polycomb 抑制复合物 2 之间相互作用的功能和结构表征

• 批准号: 192921366
• 负责人: Dr. Verena Maier
• 金额: --
• 依托单位: Department of Molecular Biology
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/192921366?language=en
• 关键词: Funktionelle; und; strukturelle; Charakterisierung; von

Die Aktivität von Genen muss während der Embryonalentwicklung genau abgestimmt werden, um die Differenzierung in verschiedenste Zelltypen zu kontrollieren. Dabei spielt Polycomb repressive complex 2 (PRC2) eine essentielle Rolle. In embryonalen Stammzellen bindet PRC2 an die Promotoren wichtiger Entwicklungsregulatoren. Durch Trimethylierung von H3K27 - eine repressive Histonmodifikation - werden diese Gene stillgelegt, können aber im Laufe der Differenzierung aktiviert werden. Wie PRC2 seine Zielgenen findet ist nicht genau bekannt. Allerdings können einige lange, nicht-kodierende RNAs die Bindung von PRC2 an bestimmte Promotoren bewirken. RepA spielt dadurch beispielsweise eine Schlüsselrolle beim Beginn der X Chromosom Inaktivierung (XCI). Säuger inaktivieren eines der beiden weiblichen X Chromosomen, um gleiche Transkriptmengen in beiden Geschlechtern zu erreichen. Dieser Mechanismus wird durch die nicht-kodierende RNA Xist eingeleitet. RepA, ein nicht-kodierendes Transkript innerhalb Xists, rekrutiert PRC2 zum Xist Promotor. PRC2 katalysiert dann die Trimethylierung von H3K27, was in diesem Fall zur Aktivierung des Xist Gens führt. Wahrscheinlich können auch andere nicht-kodierende RNAs PRC2 zu Promotoren rekrutieren, aber die Prinzipien der zugrundeliegenden Protein-RNA Interaktionen sind wenig erforscht. Ich werde daher weitere RNAs identifizieren, die an PRC2 binden und untersuchen, ob sie PRC2 zu Promotoren leiten können und eine Rolle bei der Differenzierung oder XCI spielen. Außerdem werde ich die Interaktionsdomänen von PRC2 und RepA bestimmen. Die RNA-bindende Domäne von PRC2 wird dann dazu dienen, weitere in vitro interagierende RNA Sequenzen zu ermitteln. Zudem möchte ich herausfinden, ob RepA die katalytische Aktivität von PRC2 beeinflusst. Ich hoffe, sowohl Erkenntnisse über die Mechanismen von XCI und Differenzierung, als auch über strukturelle Voraussetzungen von Wechselwirkungen zwischen Proteinen und nicht-kodierenden RNAs zu gewinnen.

Polycomb 抑制复合体 2 (PRC2) 是 Rolle 的重要组成部分。 wichtiger Entwicklungsregulatoren。与 PRC2 绑定的 nicht-kodierende RNA 与 RepA 的最佳启动器有关。在 RNA Xist RepA 中的驱动机制，在 Transkript 内部。 zur Aktivierung des Xist Gens führt。请注意，PRC2 是 Promotoren leiten können 和 eine Rolle bei der Differenzierung oder XCI spielen。 RNA 测序。蛋白质和 RNA 之间的相互作用。

项目成果

Functional Proteomic Analysis of Repressive Histone Methyltransferase Complexes Reveals ZNF518B as a G9A Regulator*

抑制性组蛋白甲基转移酶复合物的功能蛋白质组学分析揭示 ZNF518B 作为 G9A 调节剂*

• DOI: 10.1074/mcp.m114.044586
• 发表时间: 2015-02-13
• 期刊: Molecular & Cellular Proteomics
• 影响因子: 7
• 作者: V. Maier;Caitlin M. Feeney;Jordan E. Taylor;Am;a L. Creech;a;Jana W. Qiao;A. Szántó;P. Das;Nicholas
• 通讯作者: Nicholas

Building the Connectivity Map of epigenetics: chromatin profiling by quantitative targeted mass spectrometry.

构建表观遗传学的连接图：通过定量靶向质谱法进行染色质分析。

• DOI: 10.1016/j.ymeth.2014.10.033
• 发表时间: 2015-01-15
• 期刊: Methods
• 影响因子: 4.8
• 作者: Creech, Amanda L.;Taylor, Jordan E.;Maier, Verena K.;Wu, Xiaoyun;Feeney, Caitlin M.;Udeshi, Namrata D.;Peach, Sally E.;Boehm, Jesse S.;Lee, Jeannie T.;Carr, Steven A.;Jaffe, Jacob D.
• 通讯作者: Jaffe, Jacob D.