Solving the Modulated Structures in Profilin:Actin Crystals

解析 Profilin:肌动蛋白晶体中的调制结构

基本信息

  • 批准号:
    0718661
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 50万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Standard Grant
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2007-09-01 至 2011-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Modulated crystals are often encountered in crystallography. Methods for their structural characterization need further development. This research is focused on the structure determination of modulated crystals of profilin:actin. The objectives of this research are two-fold; first, to continue to develop new macromolecular X-ray crystallographic methods for the structure solution of aperiodic, modulated crystals, and second, to test the hypothetical model that the actin ''ribbon'' found in PA crystals represents a structural intermediate of filamentous actin. This research will employ protein crystal growth, X-ray diffraction data collection and structure determination. At several points during the project, innovative approaches to protein crystallography and software will be developed. The unique diffraction pattern from the modulated crystals contains unusual off-lattice satellite reflections next to the main reflections. Strategies for collecting X-ray diffraction data that detect and separate satellite reflections from the main reflections will be developed. Downstream of data collection, existing software from chemical (AKA small molecule) crystallography will be adapted and used to process the modulated diffraction pattern. From the diffraction data, the type and direction of the modulation(s) will be determined. Then additional chemical crystallography software will be extensively modified and combined with macromolecular algorithms to solve the modulated crystallographic phase problem, produce multidimensional electron density images and refine the modulated atomic structure against the experimental diffraction data. Finally, the resulting structure(s) will be analyzed within the framework of the current cell biology literature. It is anticipated that these structural results will test the validity of the ribbon-to-helix model of actin filament formation. Broader ImpactsResearch will be integrated with education through partnership with the University of Nebraska-Omaha to develop undergraduate research internships and coursework in protein purification and crystallization with profilin:actin as a central theme; the formation of ''Graduate Student Training Program in Structural Biology and Biophysics'' at UNMC; supporting national conference workshops on how to solve modulated structures for the continued education of chemical and macromolecular crystallographers at all levels; and the incorporation of research results and methods into graduate-level coursework. The PI's laboratory provides a diverse and multicultural environment for the participation of underrepresented students at all levels of training in this research program.
晶体学中经常遇到调制晶体。其结构表征方法需要进一步开发。本研究的重点是 profilin:actin 调制晶体的结构测定。这项研究的目标有两个:首先,继续开发新的大分子 X 射线晶体学方法,用于非周期性调制晶体的结构解决方案;其次,测试 PA 晶体中发现的肌动蛋白“带”代表丝状肌动蛋白结构中间体的假设模型。这项研究将采用蛋白质晶体生长、X 射线衍射数据收集和结构测定。在该项目期间的几个阶段,将开发蛋白质晶体学和软件的创新方法。调制晶体的独特衍射图案在主反射旁边包含不寻常的离晶格卫星反射。将制定收集 X 射线衍射数据的策略,以检测卫星反射并将其与主反射分开。在数据收集的下游,化学(又名小分子)晶体学的现有软件将进行调整并用于处理调制的衍射图案。根据衍射数据,将确定调制的类型和方向。然后,将对其他化学晶体学软件进行广泛修改并与高分子算法相结合,以解决调制晶体相问题,生成多维电子密度图像,并根据实验衍射数据细化调制原子结构。最后,将在当前细胞生物学文献的框架内分析所得结构。预计这些结构结果将测试肌动蛋白丝形成的带到螺旋模型的有效性。更广泛的影响研究将通过与内布拉斯加大学奥马哈分校合作,将研究与教育结合起来,以开发蛋白质纯化和结晶方面的本科生研究实习和课程,以profilin:肌动蛋白为中心主题;在 UNMC 设立“结构生物学和生物物理学研究生培训项目”;支持关于如何解决调制结构问题的全国会议研讨会,以促进各级化学和高分子晶体学家的继续教育;并将研究成果和方法纳入研究生课程。 PI 的实验室为代表性不足的学生提供了一个多元化和多元文化的环境,让他们能够参与本研究计划的各个级别的培训。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Gloria Borgstahl其他文献

Gloria Borgstahl的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Gloria Borgstahl', 18)}}的其他基金

Superspace Refinement of Protein Crystals
蛋白质晶体的超空间精炼
  • 批准号:
    1518145
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Superspace Refinement of Protein Crystals
蛋白质晶体的超空间精炼
  • 批准号:
    1518145
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant
CNIC: US-UK-Czech Republic Research Planning for Collaboration on Aperiodic Protein Crystallography
CNIC:美国-英国-捷克共和国非周期性蛋白质晶体学合作研究计划
  • 批准号:
    1404976
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant
RPG: Towards the Crystal Structure of Replication Protein A
RPG:探索复制蛋白 A 的晶体结构
  • 批准号:
    9708028
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant

相似国自然基金

基于片上编码微结构的大相移太赫兹相位调制机理与器件研究
  • 批准号:
    62301112
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
热湍流中拟序结构和热输运的时空混合调制机理研究
  • 批准号:
    12372219
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    52 万元
  • 项目类别:
    面上项目
金属氧化物-二维半导体异质结构的构筑、原位表征及光电调制机理
  • 批准号:
    12374169
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于一维核壳纳米结构双向响应调制的多光谱探测器研究
  • 批准号:
    62375049
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    48 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于陷光结构的透射式GaAs光电阴极光谱调制方法研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Anti-tumor immunity and intestinal microbiota are modulated by mitochondrial DNA
抗肿瘤免疫和肠道微生物群由线粒体 DNA 调节
  • 批准号:
    10580086
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
Anti-tumor immunity and intestinal microbiota are modulated by mitochondrial DNA
抗肿瘤免疫和肠道微生物群由线粒体 DNA 调节
  • 批准号:
    10426606
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
Compact Phase-Modulated Photonic Structures for On-Chip Multiband Spectroscopy
用于片上多波段光谱的紧凑型相位调制光子结构
  • 批准号:
    2015700
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Compact Phase-Modulated Photonic Structures for On-Chip Multiband Spectroscopy
用于片上多波段光谱的紧凑型相位调制光子结构
  • 批准号:
    2015700
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Topological states of matter induced by spatially-modulated fields
空间调制场引起的物质拓扑态
  • 批准号:
    20K14375
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 50万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了