环状RNA hsa_circ_0000396作为膀胱癌分期预测标志物的实验及临床研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81873977
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Circular RNA (circRNA), a novel type of endogenous non-coding RNA, is closely related to the invasion and metastasis of bladder cancer. Recently, circRNA has been found to be secreted from bladder cancer cells into urine by exosomes, which provides a new way for noninvasive prediction of muscle-invasive bladder cancer. In our previous studies, high-throughput circRNA sequencing and experimental verification demonstrated that the novel circular RNA hsa_circ_0000396 was significantly increased in muscle-invasive bladder cancer and affected its malignant biological behavior. In further studies, cell experiments in vitro and metastatic tumor models in vivo will be conducted to clarify the function of hsa_circ_0000396. Moreover, experiments including bioinformatics prediction, RNA pull-down, RNA immunoprecipitation and etc. will be applied to reveal the molecular regulatory mechanism of hsa_circ_0000396 in the invasion and metastasis of bladder cancer. Finally, digital PCR assays of circRNA in urine exosomes will be established and the predictive value of hsa_circ_0000396 for muscle-invasive bladder cancer will be evaluated by a multi-level systematic clinical study. Taken together, this study will not only help to identify the complicated molecular mechanism of circRNA in bladder cancer progression, but also provide novel insights into noninvasive detection of bladder muscle-invasive cancer.
环状RNA(circular RNA, circRNA)作为一类新兴内源性非编码RNA,与膀胱癌侵袭转移密切相关,并可通过外泌体由膀胱癌细胞分泌至尿液中,为肌层浸润性膀胱癌的术前无创性预测提供了一条新途径。本项目前期通过高通量测序筛选及验证,发现新环状RNA hsa_circ_0000396在肌层浸润性膀胱癌组织中显著升高并影响其恶性生物学行为。现拟应用体外细胞和体内转移瘤模型明确其功能;通过生物信息学预测、RNA pull-down及RNA结合蛋白免疫沉淀等手段揭示其调控膀胱癌侵袭转移的分子机制;建立尿液上清外泌体中circRNA的微滴式数字PCR检测方法,通过临床大样本、多层次系统研究,评价hsa_circ_0000396对肌层浸润性膀胱癌的预测价值。本研究不仅为初步阐明circRNA在膀胱癌侵袭转移中的作用机制奠定基础,而且还为膀胱癌术前分期预测提供了新的依据。

结项摘要

膀胱癌(Bladder cancer,BC)是泌尿系统中最常见恶性肿瘤之一,其发病率与死亡率一直居高不下。由于缺乏灵敏的诊断方法,近四分之一的BC患者初次就诊时已经处于疾病中晚期阶段,易发生远处转移,预后差。尽管近年来,包括外科手术,放、化治疗以及免疫疗法在内的临床治疗手段有所提升,但是BC患者的整体治疗效果不佳,5年生存率依旧处于较低水平。因此,寻找高效灵敏的诊断和分期预测分子生物标志物,探究其促进肌层侵袭转移等分子机制,将为改善BC患者预后提供重要参考。环状RNAs(circRNAs)是一类特殊的非编码RNAs,能稳定存在于组织,细胞及多种体液中,研究表明,circRNAs可作为重要调节因子,广泛参与癌症发生发展的全过程。本课题前期应用高通量测序技术,初步建立了膀胱癌相关circRNAs差异表达谱,为寻找高敏感度、强特异性的膀胱癌标志物提供了基础。我们进一步通过功能富集分析,临床组织样本验证及Sanger测序等方法确定hsa_circ_0000396(circSCL38A1)为研究靶点。通过体内外功能试验分析该分子可发挥促癌基因功能,促进BC侵袭性;采用RNA pull down 及RNA 免疫共沉淀实验(RIP)证实circSCL38A1可与ILF3相互作用,二者共定位于细胞核中;通过泛素化IP实验证实circSCL38A1可通过调节泛素化修饰抑制ILF3降解;通过CUT&Tag-seq与RNA-seq数据联合分析,最终确定TGF-β2为circSCL38A1-ILF3复合体的下游靶点;此外,通过临床样本证实,显示circSCL38A1可装载至血清外泌体,并具有成为BC诊断和分期预测标志物潜能。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Characterisation of a novel transcript LNPPS acting as tumour suppressor in bladder cancer via PDCD5-mediated p53 degradation blockage
通过 PDCD5 介导的 p53 降解阻断作为膀胱癌肿瘤抑制因子的新转录本 LNPPS 的表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    Clin Transl Med
  • 影响因子:
    10.6
  • 作者:
    Juan Li;Yifan Wang;Xinya Zhang;Xuemei Yang;Qiuchen Qi;Qi Mi;Maoxiao Feng;Yunshan Wang;Chuanxin Wang;Peilong Li;Lutao Du
  • 通讯作者:
    Lutao Du
Pyroptosis, metabolism, and tumor immune microenvironment
细胞焦亡、代谢与肿瘤免疫微环境
  • DOI:
    10.1002/ctm2.492
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Clin Transl Med
  • 影响因子:
    10.6
  • 作者:
    Tiantian Du;Jie Gao;Peilong Li;Yunshan Wang;Qiuchen Qi;Xiaoyan Liu;Juan Li;Chuanxin Wang;Lutao Du
  • 通讯作者:
    Lutao Du
膀胱癌circRNAs介导的ceRNA网络及预后评估模型的构建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    山东大学学报 (医学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    米琦;史爽;李娟;李培龙;杜鲁涛;王传新
  • 通讯作者:
    王传新
A nomogram combining long non-coding RNA expression profiles and clinical factors predicts survival in patients with bladder cancer
结合长非编码 RNA 表达谱和临床因素的列线图可预测膀胱癌患者的生存
  • DOI:
    10.18632/aging.102782
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Aging (Albany NY)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yifan Wang;Lutao Du;Xuemei Yang;Juan Li;Peilong Li;Yinghui Zhao;Weili Duan;Yingjie Chen;Yunshan Wang;Haiting Mao;Chuanxin Wang
  • 通讯作者:
    Chuanxin Wang
Characterization of circSCL38A1 as a novel oncogene in bladder cancer via targeting ILF3/TGF-β2 signaling axis
通过靶向 ILF3/TGF-β2 信号轴表征 circSCL38A1 作为膀胱癌的新型癌基因
  • DOI:
    10.1038/s41419-023-05598-2
  • 发表时间:
    2023-01-25
  • 期刊:
    Cell Death Dis
  • 影响因子:
    9
  • 作者:
    Li, Peilong;Mi, Qi;Yan, Suzhen;Xie, Yan;Cui, Zilian;Zhang, Shujun;Wang, Yifan;Gao, Huiru;Wang, Yunshan;Li, Juan;Du, Lutao;Wang, Chuanxin
  • 通讯作者:
    Wang, Chuanxin

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    王传新
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    --
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  • 期刊:
    山东大学学报(医学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杜鲁涛;王传新;肖晓燕;郑妮;张欣;张旭华;王丽丽;王顺;董召刚
  • 通讯作者:
    董召刚

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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