高盐条件下耐盐菌还原典型亲电性有机污染物的全转录组分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    51008044
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    E1002.城市污水处理与资源化
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

针对高盐有机废水生物降解机理研究的不足,本研究提出以DNA微阵列考察耐盐菌Shewanella putrefaciens CN-32在高盐条件下还原降解偶氮化合物、硝基芳香化合物和氯代烃等典型亲电性有机污染物的转录组变化,并结合实时定量反转录PCR和基因敲除技术对关键基因的转录表达与功能进行深入分析。本研究可从基因组水平上全面解析高盐条件下耐盐菌中参与耐受盐度和降解典型亲电性有机污染物的功能基因,分析降解不同典型亲电性有机污染物时转录组变化的相关性,深化对高盐条件下生物降解机理的认识;在此基础上结合细胞形态学和降解产物分析,提出高盐条件下耐盐菌还原降解亲电性有机污染物的响应机制和代谢网络。另一方面,通过确定高盐条件下生物降解的重要功能基因及部分关键基因的表达调控机制,可为高盐有机废水处理过程中耐盐菌生物降解活性的调控与监测奠定基础。

结项摘要

本课题研究了多株耐盐希瓦氏菌(Shewanella)在高盐条件下对代表性亲电性有机污染物—偶氮染料的直接与介导还原;在此基础上利用基因芯片对希瓦氏菌在含盐条件下还原偶氮染料苋菜红的全转录组响应进行了分析。Shewanella algae、Shewanella marisflavi和Shewanella aquimarina等三株海洋希瓦氏菌较模式株Shewanella oneidensis MR-1表现出更强的耐盐能力,一定盐度的存在利于海洋希瓦氏菌的好氧生长与厌氧偶氮呼吸生长。在高达100 g L-1 NaCl/Na2SO4的条件下,海洋希瓦氏菌仍可有效地将偶氮染料苋菜红还原为植物毒性更低的芳香胺。一定盐度(20-30 g NaCl L-1)的存在可提高细胞的偶氮还原酶、漆酶和NADH-DCIP还原酶活性。海洋希瓦氏菌能以蒽醌-2,6-二磺酸钠(AQDS)为电子受体在0-70 g L-1 NaCl存在条件下进行醌呼吸生长。AQDS等多种醌及腐殖酸作为可溶性氧化还原介体参与胞外电子传递,促进希瓦氏菌在高盐条件下还原偶氮染料。醌介体的生物还原是介导还原偶氮染料的限速步骤。全转录组分析结果显示,有多样的电子传递路径参与S. oneidensis MR-1对偶氮染料的还原脱色。除熟知的Mtr路径相关基因外,与DMSO、TMAO、NO3-/NO2-和SO32-/S2O32-还原相关的基因dmsABEF、napAB、nrfA、sirACD和psrABC等的转录水平也显著上调。本项目首次系统研究了海洋希瓦氏菌在高盐条件下还原亲电性有机污染物的能力,为含盐偶氮染料废水的高效生物处理提供了新的微生物资源;深化了对希瓦氏菌参与胞外电子传递及偶氮染料厌氧还原的功能基因的认识。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Decolorization of azo dyes by Shewanella oneidensis MR-1 in the presence of humic acids
腐殖酸存在下 Shewanella oneidensis MR-1 对偶氮染料的脱色
  • DOI:
    10.1007/s00253-011-3273-8
  • 发表时间:
    2011-07-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Liu, Guangfei;Zhou, Jiti;Lv, Hong
  • 通讯作者:
    Lv, Hong
Azo dye decolorization by Shewanella aquimarina under saline conditions
盐水条件下 Shewanella aquimarina 偶氮染料脱色
  • DOI:
    10.1016/j.biortech.2012.03.003
  • 发表时间:
    2012-06-01
  • 期刊:
    BIORESOURCE TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Meng, Xianming;Liu, Guangfei;Wang, Guanghui
  • 通讯作者:
    Wang, Guanghui
Accelerated removal of Sudan dye by Shewanella oneidensis MR-1 in the presence of quinones and humic acids
在醌和腐殖酸存在下,Shewanella oneidensis MR-1 加速去除苏丹染料
  • DOI:
    10.1007/s11274-013-1336-y
  • 发表时间:
    2013-03
  • 期刊:
    World Journal of Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Liu, Guangfei;Zhou, Jiti;Ji, Qiuyan;Wang, Jing;Jin, Ruofei;Lv, Hong
  • 通讯作者:
    Lv, Hong
Decolorization of azo dyes by Geobacter metallireducens
金属还原地杆菌对偶氮染料的脱色
  • DOI:
    10.1007/s00253-012-4545-7
  • 发表时间:
    2013-09-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Liu, Guangfei;Zhou, Jiti;Lv, Hong
  • 通讯作者:
    Lv, Hong
Decolorization of azo dyes by marine Shewanella strains under saline conditions
海洋希瓦氏菌菌株在盐水条件下对偶氮染料的脱色
  • DOI:
    10.1007/s00253-012-4216-8
  • 发表时间:
    2013-05-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Liu, Guangfei;Zhou, Jiti;Lv, Hong
  • 通讯作者:
    Lv, Hong

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    柳广飞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
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          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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