基于浸入边界—格子Boltzmann方法的复杂弹性血管内红细胞迁移与变形机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11702259
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A0910.计算流体力学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Investigation of the migration and deformation mechanism of red blood cells is of great importance to the understanding and clinical diagnosis of various blood diseases. Numerical simulation is an efficient tool for the study of such complex problems. This project intends to take advantage of mesoscopic lattice Boltzmann (LB) method,which is coupled with immersed boundary (IB) method, and develop applicable numerical scheme for complex boundary to construct a suitable IB-LB model to simulate the migration and deformation of red blood cell in three-dimensional complex elastic vascular; at the same time, in order to solve the heavy calculation consume while simulating blood flow, the GPU parallel computing technology is utilized, the implementation and optimization of IB-LB model on CPU + GPU platforms is detailed studied. On this basis, this project will explore the migration and deformation mechanism of red blood cells in complex elastic vessels, then analyze the impact of complex vascular geometry, vascular wall elasticity and boundary conditions on the migration and deformation of red blood cells.
血管中红细胞迁移方式和形态的研究对于认识各种血液疾病和临床诊断均具有重要意义。数值模拟是研究此类复杂问题的高效工具。本项目拟利用介观格子 Boltzmann (LB) 方法,结合浸入边界法(Immersed Boundary, IB),构建合适的边界条件,建立模拟三维复杂弹性血管中红细胞迁移与变形的 IB-LB 模型;同时,为解决数值研究所面临的大规模计算量问题,拟结合 GPU 并行计算技术,深入讨论 IB-LB 模型在 CPU+GPU 平台的高效并行算法设计与优化;在此基础上,探讨复杂弹性血管中红细胞迁移与变形机理,分析复杂血管几何结构、血管壁弹性和边界条件对红细胞迁移方式和形态的影响。

结项摘要

红细胞是血液的重要组成成份,对血管中红细胞迁移和变形机理的研究有助于深入对多种血液疾病的认识及其临床诊断。数值模拟是研究此类复杂问题的有效途径。在众多数值方法中,耦合浸入边界法(Immersed Boundary, IB)的介观格子Boltzmann (LB) 方法是研究此类包含可变形结构的流体问题的高效求解工具。本项目利用浸入边界法——格子Boltzmann方法,深入地研究了复杂血管中红细胞的迁移与变形,主要内容包括:(1)针对数值模拟中巨大计算资源消耗的难题,本项目基于GPU平台,构建了适宜于研究红细胞动力学行为的高效并行算法。在不同GPU上的测试表明,所设计的算法具有较理想的加速效果。(2)系统研究了血管的复杂结构对于红细胞的运动方式及形态的影响,包括血管内狭窄处、分叉血管处等区域,细致讨论了流体动力学参数及红细胞结构参数的影响。(3)分析了血液中红细胞的分布规律,及红细胞与血小板之间的相互作用。(4)在以上研究的基础上,展开了三维红细胞运动的数值模拟。本项目所建立的算法及程序,还可应用于其他类似的流固耦合问题,例如血管中纳米药物的输送、肿瘤细胞的迁移,以及生物体的飞行和游动等问题。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Lattice Boltzmann method for fractional Cahn-Hilliard equation
分数阶 Cahn-Hilliard 方程的格子玻尔兹曼方法
  • DOI:
    10.1016/j.cnsns.2020.105443
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Communications in Nonlinear Science & Numerical Simulation
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liang Hong;Zhang Chunhua;Du Rui;Wei Yikun
  • 通讯作者:
    Wei Yikun
Effects of temperature-dependent viscosity on natural convection in a porous cavity with a circular cylinder under local thermal non-equilibrium condition
局部热非平衡条件下温度相关粘度对圆柱多孔腔内自然对流的影响
  • DOI:
    10.1016/j.ijthermalsci.2020.106570
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    International Journal of Thermal Sciences
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Lei Wang;Changsheng Huang;Junjie Hu;Baochang Shi;Zhenhua Chai
  • 通讯作者:
    Zhenhua Chai

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其他文献

利用非均匀格子Boltzmann方法研究支架对颅内动脉瘤血流动力学的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    医用生物力学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙烁然;黄昌盛;汪垒;施保昌
  • 通讯作者:
    施保昌
脂联素基因单核苷酸多态性在广西百色地区壮族人群中的分布
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    解剖学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴联滔;黄秀峰;林朝文;吴玉梅;何兰凤;杨园园;韦叶生;王金花;周庆辉;黄昌盛
  • 通讯作者:
    黄昌盛
基于CUDA 的格子Boltzmann 方法: 算法设计与程序优化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Chinese Science Bulletin
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄昌盛;张文欢;侯志敏;陈俊辉;李明晶;何南忠;施保昌
  • 通讯作者:
    施保昌
基于CUDA的格子Boltzmann方法:算法设计与程序优化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄昌盛;张文欢;侯志敏;陈俊辉;李明晶;何南忠;施保昌
  • 通讯作者:
    施保昌

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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