中国鱚科鱼类分类与系统发育研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31572227
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The Sillaginidae, are ecologically important fish species which are widely distributed throughout the Indo-West Pacific region. The studies in phylogenetic classification of Sillaginidae have been carried out as early as 200 years ago, but the taxonomy and nomenclature were still controversial. In this study, Sillaginidae species and their corresponding geographic populations will be collected, and the systematics and taxonomy of Sillaginidae family will be re-estimated based on differentiations of morphology and multiply gene loci. The phylogenetic relationships will be re-constructed and the divergence time between species will be estimated by conjoint gene analysis. Furthermore, the genetic diversity and phylogeographic patterns of Sillaginidae species can be illuminated under this study. Our study will clarify the taxonomy of Sillaginidae, and contribute a lot to the rational exploitation and protection of Sillaginidae fish. It is also important to the development of marine fish geographic zoning, fish taxonomy and zoogeography.
鱚科鱼类种类多,分布广,在印度-西太平洋动物地理学以及近岸生态系统中都占有非常重要的地位。虽然鱚科系统学研究已有近200年历史,但分类和命名仍非常混乱,其科下阶元的划分存在争议和分歧。本项目以中国沿海鱚科鱼类为研究对象,采集所有物种分布区内的地理群体,通过形态学数据与多位点分子证据的结合,厘定我国鱚科鱼类分类,澄清目前物种分类的混乱;基于多基因联合分析,重建系统发育树,确定科下阶元及其系统发育关系,估算分歧时间;基于生物地理学原理与所构建的系统发育树,探讨鱚科鱼类多样性及其系统地理分布格局。本项目不仅可建立完善的鱚科鱼类分类系统、为我国乃至世界鱚科鱼类资源的开发利用与保护提供科学依据,对我国海洋鱼类地理区划以及鱼类系统学、动物地理学研究的发展也具有重要意义。

结项摘要

鱚科鱼类广泛分布于印度-西太平洋海域,由于外部形态十分相似,又缺乏有效的分类鉴别手段和系统整理,导致鱚科鱼类的分类和系统发育关系仍存在争议和混淆。本研究通过广泛采集国内外鱚科鱼类样品,采用线粒体和核基因等分子标记,结合可数可量性状、耳石、鱼鳔结构特征等形态学和比较解剖学信息,明晰了中国沿海鱚科鱼类种类组成、地理分布格局、系统发育关系及演化过程。主要研究结果:(1)对中国鱚科鱼类进行分类修订,并构建了鱚科鱼类31个分类单元的DNA条形码库,厘定中国沿海9种已命名的鱚科鱼类,报道了一个新种邵氏鱚,另有多个疑似新种待发布;(2)基于线粒体和核基因数据重构了鱚科鱼类系统发育关系,结果显示系统发育关系与鱼鳔复杂程度存在一定的相关性;(3)基于控制区序列的群体遗传学研究结果显示,多种鱚科鱼类群体间不存在遗传谱系结构,近期发生过群体扩张事件;(4)基于高通量测序技术组装了中国鱚全长转录组序列和染色体水平的基因组全序列,为后续鱚科鱼类比较基因组学研究奠定了基础;(5)基于转录组数据研究了中国沿海鱚科鱼类系统发育关系,结果与线粒体和核基因的分析结果相一致;(6)利用实验室已有少鳞鱚采样点信息,结合环境变量数据,构建了少鳞鱚物种栖息分布模型,预测未来气候变化情景下少鳞鱚分布区将呈现收缩和向极地移动的趋势。.本项目资助下,已发表论文12篇,其中SCI论文6篇;做国际会议报告3次,墙报发表9次;在国内会议上特邀大会报告发表1次,分组报告4次,墙报发表3次;培养博士生7名、硕士生2名、本科生1名。研究成果为鱼类生物多样性保护和资源开发利用提供了科学依据,同时促进了我国海洋鱼类地理区划以及鱼类系统学和动物地理学研究的发展。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
四种鱚属鱼类线粒体Cyt b基因的序列变异及系统发育研究
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1004-1524.2020.01.05
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    浙江农业学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    袁冬皓;高天翔;杨天燕;孟玮;郑瑶;郑德育
  • 通讯作者:
    郑德育
Levels and patterns of genetic variation in Japanese whiting (Sillago japonica) based on mitochondrial DNA control region
基于线粒体 DNA 控制区的日本牙鳕 (Sillago japonica) 遗传变异水平和模式
  • DOI:
    10.1080/24701394.2018.1467411
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA Part A
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tianxiang Gao;Tianyan Yang;Takashi Yanagimoto;Yongshuang Xiao
  • 通讯作者:
    Yongshuang Xiao
浙江近海鱚属鱼类形态描述及中国鱚属鱼类分子系统发育分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖家光;张少秋;高天翔;韩志强
  • 通讯作者:
    韩志强
不同地理群体少鳞鱚形态差异比较研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    浙江海洋大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱岚倩;林彦均;杨天燕;袁冬皓;郑德育;郑瑶;高天翔
  • 通讯作者:
    高天翔
Redescription and DNA barcoding of Sillago indica (Perciformes: Sillaginidae) from the coast of Pakistan
巴基斯坦海岸 Sillago indica(鲈形目:Sillaginidae)的重新描述和 DNA 条形码
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Pakistan Journal of Zoology
  • 影响因子:
    0.6
  • 作者:
    Jiaguang Xiao;Na Song;Tianxiang Gao;Rol;J. McKay
  • 通讯作者:
    J. McKay

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其他文献

人工隐蔽物及投喂频率对许氏平鲉幼鱼生长和行为的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭浩宇;张秀梅;高天翔
  • 通讯作者:
    高天翔
许氏平鲉群体耳石形态学比较
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国海洋大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王燕平;徐思嘉;黄子敏;高天翔
  • 通讯作者:
    高天翔
舟山近海水样环境DNA获取方法的建立
  • DOI:
    10.7541/2020.007
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈治;宋娜;源利文;邬倩倩;高天翔
  • 通讯作者:
    高天翔
芍药花茎强度与褪黑素含量的关系分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    浙江农业学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    石文波;高天翔;胡蕴钰;许聪;陶俊;赵大球
  • 通讯作者:
    赵大球
舟山近海—条纹锯鮨的形态特征与 DNA 条形码研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    浙江海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王业辉;高天翔;李伟业
  • 通讯作者:
    李伟业

其他文献

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高天翔的其他基金

世界鱚科鱼类分类、系统发育与生物地理学研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    62 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于环境DNA metabarcoding技术的舟山近海鱼类多样性研究
  • 批准号:
    41776171
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    71.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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