利用代谢拨动开关调控大肠杆菌芳香型氨基酸的合成

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600066
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

All of the three aromatic amino acids, L-phenylalanine, L-tryptophan, and L-tyrosine have relatively high economic value. Because of the low costs, environmentally friendly processes and high yields, microbial production of aromatic amino acids has attracted more and more attention in recent years. As the three aromatic amino acids share the same common pathway, to increase the production of specific aromatic amino acid, branch pathways of the other two aromatic amino acids should be completely blocked, leading to the accumulation of only one aromatic amino acid for a recombinant strain. To solve this problem, in this project, a basic strain will be firstly constructed by engineering the common aromatic amino acid pathway of the wild E. coli BW25113. Then, a metabolic toggle switch dependent on three different inducers was constructed to tune the expression of PheA, TrpE and TyrA in the branch aromatic amino acid pathways of the basic strain, resulting in a common aromatic amino acid strain. This common strain can produce L-phenylalanine, L-tyrosine, or L-tryptophan according to the supplemented inducers, and therefore relatively high application value will be exhibited for this strain. In addition, this metabolic toggle switch will provide a new tool for regulating branch pathways in microbes.
L-苯丙氨酸、L-色氨酸和L-酪氨酸这三种芳香型氨基酸均具有较高的经济价值。利用微生物生产芳香型氨基酸具有成本低廉、环境友好、产量较高等优势,逐渐成为了研究的热点。由于存在着共同途径,为了提高某一种芳香型氨基酸的产量,往往需要阻断另外两种芳香型氨基酸的合成途径,使得重组菌株只能合成单一的芳香型氨基酸。为了解决这个问题,在本项目中,以野生型大肠杆菌BW25113为出发菌株,通过对其芳香型氨基酸的共同途径进行代谢工程改造,我们将首先得到一个芳香型氨基酸合成的基础菌株。之后通过构建依赖于三种不同诱导剂的代谢拨动开关并用于调控芳香型氨基酸分支途径中的关键基因PheA、TrpE以及TyrA,我们将得到可在合成L-苯丙氨酸、L-色氨酸和L-酪氨酸之间切换的芳香型氨基酸通用菌株,从而实现 “一菌多用”,具有良好的应用价值。本项目构建的代谢拨动开关也将为微生物分支途径的调控提供一种新的工具。

结项摘要

包括莽草酸、L-苯丙氨酸、L-色氨酸和L-酪氨酸在内的芳香族化合物均具有较高的经济价值。在大肠杆菌等微生物中,三种芳香型氨基酸具有共同的前体物分支酸。因此,为了提高某一种芳香型氨基酸的产量,往往需要阻断另外两种芳香型氨基酸的合成途径。另外,莽草酸作为芳香型氨基酸合成的中间代谢产物,一般无法在细胞中大量积累。在本项目中,我们利用代谢拨动开关初步解决了这两个问题。我们首先设计了一个简单的代谢拨动开关MTS-1,并用于调控莽草酸激酶的活性。通过添加诱导剂L-阿拉伯糖,实现了aroK活性的条件抑制,成功获得了非营养缺陷型的莽草酸合成菌株。在5-L发酵罐中,重组大肠杆菌在不添加芳香化合物的条件下能够合成13.15 g/L的莽草酸。在MTS-1的基础上,我们构建了更加复杂的代谢拨动开关MTS-2,将L-苯丙氨酸与L-酪氨酸分支途径中的关键基因pheAFBR与tyrAFBR分别置于PacuR与PlacUV5启动子的操纵之下,并将该代谢拨动开关转移到构建的芳香型氨基酸基础菌株中。通过添加IPTG,丙烯酸盐或者不添加诱导剂,实现了对重组菌株合成芳香型氨基酸类型的调节。构建的代谢拨动开关MTS-1和MTS-2具有在大肠杆菌或其他微生物的不同代谢途径中应用的潜力。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Construction of a switchable synthetic Escherichia coli for aromatic amino acids by a tunable switch
通过可调开关构建芳香族氨基酸的可转换合成大肠杆菌
  • DOI:
    10.1007/s10295-020-02262-y
  • 发表时间:
    2020-01
  • 期刊:
    Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xiaozhen Liu;Hao Niu;Zhaosong Huang;Qiang Li;Pengfei Gu
  • 通讯作者:
    Pengfei Gu
Different performance of Escherichia coli mutants with defects in the phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase system under low glucose condition
低糖条件下磷酸烯醇丙酮酸:碳水化合物磷酸转移酶系统缺陷的大肠杆菌突变体的不同性能
  • DOI:
    10.1007/s13205-019-1584-0
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    3 BIOTECH
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Niu, Hao;Li, Ruirui;Gu, Pengfei
  • 通讯作者:
    Gu, Pengfei
Metabolic engineering for the production of l-phenylalanine in Escherichia coli
在大肠杆菌中生产 L-苯丙氨酸的代谢工程
  • DOI:
    10.1007/s13205-019-1619-6
  • 发表时间:
    2019-03-01
  • 期刊:
    3 BIOTECH
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Liu, Xiaozhen;Niu, Hao;Gu, Pengfei
  • 通讯作者:
    Gu, Pengfei
Novel technologies combined with traditional metabolic engineering strategies facilitate the construction of shikimate-producing Escherichia coli.
新技术与传统代谢工程策略相结合,促进了产莽草酸大肠杆菌的构建
  • DOI:
    10.1186/s12934-017-0773-y
  • 发表时间:
    2017-09-29
  • 期刊:
    Microbial cell factories
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Gu P;Fan X;Liang Q;Qi Q;Li Q
  • 通讯作者:
    Li Q
Metabolic engineering for improving l-tryptophan production in Escherichia coli
提高大肠杆菌 L-色氨酸产量的代谢工程
  • DOI:
    10.1007/s10295-018-2106-5
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Niu, Hao;Li, Ruirui;Gu, Pengfei
  • 通讯作者:
    Gu, Pengfei

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Cl~-随水分在不同体积质量红壤中的迁移特性及再分布
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  • 通讯作者:
    梁欣欣
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    2014
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    裴青宝;赵新宇;张建丰;刘伟佳;高金龙;古鹏飞
  • 通讯作者:
    古鹏飞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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