中国人2型糖尿病全基因组关联研究中发现易感位点的大样本关联研究

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基本信息

  • 批准号：
    30800617
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    胡承
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    H0708.糖尿病
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

课题组前期开展了中国人2型糖尿病全基因组关联研究，在400例样本中检测了约317,000个单核苷酸多态性位点（SNP），对基因型数据质控后，分析比较300,986个SNP在193例2型糖尿病患者和200例正常对照者中的等位基因频率分布，见到分布于40个基因区域上的45个SNP在病例－对照组间频率分布存在显著差异（P<0.0005）。本课题拟以此前期发现为基础，首先在3700例病例－对照样本中对这45个SNP进行检测，开展遗传关联研究，发现疾病易感位点，并从发现的易感位点所在基因区域入选更多SNP，寻找该区域内与2型糖尿病发生最相关的位点并分析其与糖代谢中间性状的关系，同时，从2型糖尿病家系入选样本进行家系关联研究进一步验证该位点与疾病的相关性。本研究对认识中国人2型糖尿病遗传机制具有重要理论意义，并将推动2型糖尿病病因学研究及中国人2型糖尿病遗传流行病学研究的进程。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（11）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（9）
专利数量（0）
Meta-analysis of genome-wide association studies identifies eight new loci for type 2 diabetes in east Asians.
全基因组关联研究的荟萃分析确定了东亚人 2 型糖尿病的 8 个新位点
  • DOI：
    10.1038/ng.1019
  • 发表时间：
    2011-12-11
  • 期刊：
    NATURE GENETICS
  • 影响因子：
    30.8
  • 作者：
    Cho, Yoon Shin;Chen, Chien-Hsiun;Hu, Cheng;Long, Jirong;Ong, Rick Twee Hee;Sim, Xueling;Takeuchi, Fumihiko;Wu, Ying;Go, Min Jin;Yamauchi, Toshimasa;Chang, Yi-Cheng;Kwak, Soo Heon;Ma, Ronald C. W.;Yamamoto, Ken;Adair, Linda S.;Aung, Tin;Cai, Qiuyin;Chang, Li-Ching;Chen, Yuan-Tsong;Gao, Yutang;Hu, Frank B.;Kim, Hyung-Lae;Kim, Sangsoo;Kim, Young Jin;Lee, Jeannette Jen-Mai;Lee, Nanette R.;Li, Yun;Liu, Jian Jun;Lu, Wei;Nakamura, Jiro;Nakashima, Eitaro;Ng, Daniel Peng-Keat;Tay, Wan Ting;Tsai, Fuu-Jen;Wong, Tien Yin;Yokota, Mitsuhiro;Zheng, Wei;Zhang, Rong;Wang, Congrong;So, Wing Yee;Ohnaka, Keizo;Ikegami, Hiroshi;Hara, Kazuo;Cho, Young Min;Cho, Nam H.;Chang, Tien-Jyun;Bao, Yuqian;Hedman, Asa K.;Morris, Andrew P.;McCarthy, Mark I.;Takayanagi, Ryoichi;Park, Kyong Soo;Jia, Weiping;Chuang, Lee-Ming;Chan, Juliana C. N.;Maeda, Shiro;Kadowaki, Takashi;Lee, Jong-Young;Wu, Jer-Yuarn;Teo, Yik Ying;Tai, E. Shyong;Shu, Xiao Ou;Mohlke, Karen L.;Kato, Norihiro;Han, Bok-Ghee;Seielstad, Mark
  • 通讯作者：
    Seielstad, Mark
PPARG, KCNJ11, CDKAL1, CDKN2A-CDKN2B, IDE-KIF11-HHEX, IGF2BP2 and SLC30A8 are associated with type 2 diabetes in a Chinese population.
PPARG、KCNJ11、CDKAL1、CDKN2A-CDKN2B、IDE-KIF11-HHEX、IGF2BP2 和 SLC30A8 与中国人群的 2 型糖尿病相关
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0007643
  • 发表时间：
    2009-10-28
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Hu C;Zhang R;Wang C;Wang J;Ma X;Lu J;Qin W;Hou X;Wang C;Bao Y;Xiang K;Jia W
  • 通讯作者：
    Jia W
Effects of KCNQ1 Polymorphisms on the Therapeutic Efficacy of Oral Antidiabetic Drugs in Chinese Patients With Type 2 Diabetes
KCNQ1多态性对中国2型糖尿病患者口服降糖药疗效的影响
  • DOI：
    10.1038/clpt.2010.351
  • 发表时间：
    2011-03-01
  • 期刊：
    CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
  • 影响因子：
    6.7
  • 作者：
    Yu, W.;Hu, C.;Jia, W.
  • 通讯作者：
    Jia, W.
Association of apelin genetic variants with type 2 diabetes and related clinical features in Chinese Hans.
中国汉族人apelin基因变异与2型糖尿病的关联及相关临床特征。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Chin Med J (Engl)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    贾伟平;等
  • 通讯作者：
    等
Variations in KCNQ1 are associated with type 2 diabetes and beta cell function in a Chinese population
KCNQ1 变异与中国人群的 2 型糖尿病和 β 细胞功能相关
  • DOI：
    10.1007/s00125-009-1335-6
  • 发表时间：
    2009-07-01
  • 期刊：
    DIABETOLOGIA
  • 影响因子：
    8.2
  • 作者：
    Hu, C.;Wang, C.;Jia, W.
  • 通讯作者：
    Jia, W.

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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