与中国甜柿自然脱涩有关的Myb类转录因子基因克隆及其功能验证

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31071771
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1502.果树种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

中国甜柿自然脱涩受显性基因AST/ast控制,因而在遗传改良上较日本甜柿更具利用价值,但其脱涩机理尚不完全清楚。本项目以包括'罗田甜柿'在内的中国甜柿为试材,以非完全甜柿和日本甜柿为对照,首先采用同源克隆法获得Myb类转录因子基因cDNA片段,通过生物信息学分析推测其功能,通过5'Tail-PCR和3'RACE技术获得cDNA全长;进而通过分析其在不同脱涩类型(中国甜柿、日本甜柿和非完全甜柿)、不同发育阶段(花后第3、第9和第15周)、不同部位(萼片、果皮、果肉、果心和种子)表达差异并结合单宁含量分析,筛选与中国甜柿自然脱涩有关的目标cDNA;然后通过构建正义和反义表达载体转化柿愈伤组织进一步确认其功能;最后通过与DHD/SDH、F3'5'H、ANR、SCPL、PDC和ADH等结构基因表达情况的一致性分析,初步推测其调控靶基因。从而为中国甜柿自然脱涩机理以及分子技术育种研究提供科学依据。

结项摘要

柿果果肉组织存在特化的单宁细胞,其液胞中大量累积的柿单宁(原花青素)是导致涩感的主要原因。与日本甜柿在果实发育的早期即可自然脱涩的特点不同,中国甜柿在果实成熟之前才能自然脱涩,但其脱涩机理迄今尚不明确。本研究以中国甜柿‘罗田甜柿’和‘小果甜柿’为试材,通过研究其果实发育期单宁细胞大小和可溶性及不溶性单宁含量的动态变化,发现其存在可溶性单宁向不溶性单宁的转化现象;利用同源克隆获得柿单宁代谢途径中Myb转录因子基因(DkPA1),发现其编码蛋白具MYB转录因子的典型结构域,属于R2R3类MYB转录因子;通过邻接法的进化分析发现其与已报道的其他物种中参与单宁调控MYB转录因子具有极高的序列相似性;DkPA1在‘罗田甜柿’与‘磨盘柿’中的表达模式与其可溶性单宁的累积模式一致,与结构基因DkDHD、DkSCPL、DkF3’H、DkF3’5’H、DkANR的表达模式也一致;DkPA1转录因子可能特异结合DkLAR、DkLAC1、DkMATE1启动子序列中MYBCORE顺式元件,进而调控这些基因的表达;应用454 GS FLX Titanium测序技术,以乙醇脱涩后(Tr)及对照(Co)‘罗田甜柿’果实进行转录组测序,3639条差异unigene基因中含有Myb类转录因子基因;通过同源克隆获得转录因子基因DkMYC1、DkWD40和结构基因DkLAC、DkGST、DkMATE1,对其进行时空表达及其与中国甜柿自然脱涩的关系分析。此外,利用与中国甜柿自然脱涩性状连锁的分子标记(RO2)鉴定出6份完全雄性和4份甜柿变异单株含有该标记,这些种质可能成为中国甜柿育种新的双亲亲本;将该标记用于两个杂交群体中完全甜柿个体的早期选择,发现其呈现1:1分离,说明控制中国甜柿自然脱涩性状的可能为单显性基因位点;开发了针对柿属植物专属EST-SSR和TRAP分子标记,并在柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中初步应用。在国外专业期刊发表学术论文9篇。培养博士4名,硕士1名,组织召开学术会议4次。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Characterization and comparison of EST-SSR and TRAP markers for genetic analysis of the Japanese persimmon Diospyros kaki
EST-SSR 和 TRAP 标记在日本柿遗传分析中的表征和比较
  • DOI:
    10.4238/2013.january.9.3
  • 发表时间:
    2013-01-01
  • 期刊:
    GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
  • 影响因子:
    0.4
  • 作者:
    Luo, C.;Zhang, F.;Luo, Z. R.
  • 通讯作者:
    Luo, Z. R.
Sequence variations of chloroplast genome trnS-trnfM region in some oriental persimmon (Diospyros kaki Thunb.)
一些东方柿叶绿体基因组trnS-trnfM区的序列变异(Diospyros kaki Thunb.)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Acta Horticulturae, 2013, 996: 171-176
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡德昌;唐仙英;张青林;罗正荣(通讯作者)
  • 通讯作者:
    罗正荣(通讯作者)
Effectiveness of the RO2 marker for the identification of non-astringency trait in Chinese PCNA persimmon and its possible segregation ratio in hybrid F1
RO2标记对PCNA柿非涩味性状鉴定的有效性及其在杂交F1中可能的分离率
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Scientia Horticulturae
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    裴忺;张青林;郭大勇;罗正荣(通讯作者)
  • 通讯作者:
    罗正荣(通讯作者)
Isolation and characterization of a Laccase gene potentially involved in proanthocyanidin polymerization in oriental persimmon (Diospyros kaki Thunb.) fruit
东方柿 (Diospyros kaki Thunb.) 果实中可能参与原花青素聚合的漆酶基因的分离和表征
  • DOI:
    10.1007/s11033-012-2296-2
  • 发表时间:
    2013-04-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Hu, Qianni;Luo, Chun;Luo, Zhengrong
  • 通讯作者:
    Luo, Zhengrong
Revision of a primary core collection of persimmon (Diospyros kaki Thunb.) originated in China
原产于中国的柿子(Diospyros kaki Thunb.)主要核心种质的修订
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Acta Horticulturae
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张艳芳;张青林;杨勇;罗正荣(通讯作者)
  • 通讯作者:
    罗正荣(通讯作者)

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其他文献

中国大陆的柿业和柿学概况
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  • 通讯作者:
    罗正荣
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    谷晓峰;罗正荣
  • 通讯作者:
    罗正荣
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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    谷晓峰;罗正荣
  • 通讯作者:
    罗正荣
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  • 发表时间:
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    --
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  • 通讯作者:
    罗正荣

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罗正荣的其他基金

与中国甜柿可溶性单宁自然凝固相关的转录因子及其调控网络研究
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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