基于虚拟筛选从广西北仑河口红树内生真菌发现活性次生代谢产物

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21102022
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0703.天然产物化学生物学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

红树内生真菌为一种新的资源微生物,其次生代谢产物是海洋天然产物化学的研究热点之一。虚拟筛选可提供一定的信息来指导药理活性实验,弥补实验能力的不足,加速发现先导化合物的进程。广西北仑河口国家级自然保护区是我国大陆海岸线唯一一个位于边境的红树林保护区和全球三大GEF红树林国际示范区之一,其药用红树品种齐全,红树内生真菌及其次生代谢产物尚无研究报道。本项目拟从广西北仑河口采集红树样品,分离纯化内生真菌,活性初筛(课题组已纯化了126株和初筛了一批活性菌株),放大培养,活性追踪分离纯化内生真菌的次生代谢产物,通过虚拟筛选和抗菌、抗氧化和酶抑制剂等药理活性筛选,寻找活性先导化合物。该项目通过虚拟筛选可减少随机筛选所造成的浪费,针对性地测试样品的活性,加速从海洋微生物天然产物中发现活性先导化合物的进程,为开发新的自主知识产权的海洋药物打下基础,防止过度开发红树植物资源,有利于保护红树林生态环境。

结项摘要

广西北仑河口国家级自然保护区是我国大陆海岸线唯一一个位于边境的红树林保护区和全球三大 GEF 红树林国际示范区之一,其药用红树品种齐全。从广西北仑河口红树林国家自然保护区采集红树植物样品,共分离纯化了341株内生真菌、96株内生放线菌。通过抗菌、抗氧化和乙酰胆碱酯酶抑制活性筛出多株活性菌株,通过ITS和18S rRNA法鉴定了20株活性菌株的种属。分离活性菌株的次级代谢产物88个,发现了新化合物4个,将新化合物进行虚拟筛选及后继研究工作还在进行。红树内生真菌及其次级代谢产物的研究结果将为开发先导化合物打下了坚实的基础。.研究了海洋链孢囊菌FXJ7.131中7.131-A、7.131-C和7.131-F三个多环芳香聚酮类化合物。通过理论计算确定了绝对构型,其中7.131-F为新化合物。7.131-F手性碳C-16与7.131-A、7.131-C两个化合物手性碳的构型相反,推测可能是生物合成过程中不同的酶催化形成的。研究发现链霉菌FXJ1.264能够产生六环的芳香聚酮类化合物1.264-C。通过理论计算首次确定了1.264-C、BE-24566B、anthrabenzoxocinone和bischloroanthrabenzoxocinone等相关化合物的绝对构型。这些研究结果将为相关放线菌次级代谢产物的后继研究打下坚实的基础。.用半经验PM3计算方法研究xyloketals化合物的电子结构与其药理活性的关系,首次从理论化学的角度解释各化合物的活性差异,为进一步研究此类化合物的药理活性提供理论指导。另外通过理论计算2508C异构化为2508B的热力学函变。.海洋真菌No.1893代谢产物mycoepoxydiene(1893C)及其催化氢化衍生物, hexahydromycoepoxydiene(1893D), deacetylhexahydromycoepoxydiene(1893E),其结构通过波谱、单晶X-ray衍射等手段表征。对其培养基的发酵条件进行优化,使mycoepoxydiene的发酵浓度增加了近四倍。从头算的方法研究化合物1893C~E的电子结构与抗肿瘤活性的关系,表明化合物的内酯为其抗肿瘤的活性部位,为结构修饰提供一定理论上的指导。.对各种海洋微生物次级代谢产物进行了虚拟筛选,对筛选结果的数据还在进一步分析和药理实验的验证,将会发现一批先导化合物。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
罗汉果内生真菌SG-69次级代谢产物的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    应用化工
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈海燕;付东兴;林翠梧;王志滨;覃江克
  • 通讯作者:
    覃江克

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2007年一般拓扑学国际学术会议
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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