非编码RNA在大蹼铃蟾免疫调节过程中的作用机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31560596
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    41.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0403.动物生理与行为
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

There is large number of genome sequences without any protein-coding frame; including non-coding RNA is an important component. It plays a number of important physiological functions, which can be used as an activator or inhibitor involved in cell differentiation and ontogeny. Our previous work is about Bombina maxima for the study, which revealed a very strong and mature immune system. And, skin as an important immune organ, plays an important role in anti-microbial infection. Also, we found a large number of non-coding RNA, including small amounts of tissue-specific and highly expressed noncoding RNAs in skin and blood tissues. We hypothesized that the non-coding RNA may be used as a supplement immune regulation system to regulate the immune response, thereby increasing the environmental adaptability of Bombina maxima. Therefore, our study is going to reach two aims: 1, with high-throughput screening and theoretical prediction methods, initially set out to which non-coding RNAs play an immune regulation of the frog; 2, with functional test in vitro, reveal the mechanism of the candidates to modulate the immune response in amphibians and the fundamental function at the environmental adaptability.
基因组中存在着大量的非编码序列,其中非编码RNA是重要的组成部分。它担负着多项非常重要的生理学功能,可以作为激活子或者抑制子参与细胞分化和个体发育的过程。我们前期的工作以大蹼铃蟾(Bombina maxima)为研究对象,揭示了其具有强大的免疫系统,以及皮肤作为重要的免疫器官,在抗微生物感染中的重要作用。并且,在皮肤和血液组织中发现了大量的非编码RNA,以及少量的组织特异性表达和高表达的非编码RNA。我们推测非编码RNA可能作为一套免疫调节的增补系统,来调节免疫应答,从而提高了大蹼铃蟾的环境适应性。因此,本研究项目旨在:1. 通过高通量筛选和理论预测的方法,初步确定出对大蹼铃蟾免疫系统起调节作用的非编码RNA;2. 通过细胞水平上的功能试验,揭示候选非编码RNA分子调节免疫应答的分子机制,初步确定非编码RNA在两栖类环境适应性中的功能。

结项摘要

我们以大蹼铃蟾(Bombina maxima)为研究对象,前期研究揭示了其具有强大的免疫系统,以及皮肤作为重要的免疫器官,在抗微生物感染中的重要作用。并且,在皮肤和血液组织中发现了大量的非编码RNA,以及少量的组织特异性表达和高表达的非编码RNA。我们推测非编码RNA可能作为一套免疫调节的增补系统,来调节免疫应答,从而提高了大蹼铃蟾的环境适应性。因此,我们完成了转录组、蛋白质组和小RNA组的测序,以及数据组装和分析,筛选出9个候选非编码RNA;构建了大蹼铃蟾中非编码RNA作用网络,预测靶点109个。通过大蹼铃蟾单核细胞的培养,制备了大蹼铃蟾白介素等6种抗体;相关体外、体内实验,均暂未证实9个候选非编码RNA分子对大蹼铃蟾免疫系统起到调节作用,进而无法揭示非编码RNA对大蹼铃蟾免疫系统作用的机制,及其对大蹼铃蟾环境适应性的贡献。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
In-depth profiles of bioactive large molecules in saliva secretions of leeches determined by combining salivary gland proteome and transcriptome data
通过结合唾液腺蛋白质组和转录组数据确定水蛭唾液分泌物中生物活性大分子的深入概况
  • DOI:
    10.1016/j.jprot.2019.03.009
  • 发表时间:
    2019-05-30
  • 期刊:
    JOURNAL OF PROTEOMICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Liu, Zichao;Tong, Xiangtong;Zhao, Feng
  • 通讯作者:
    Zhao, Feng
Comparative analysis of diverse toxins from a new pharmaceutical centipede, Scolopendra mojiangica
新药用蜈蚣多种毒素的比较分析
  • DOI:
    10.24272/j.issn.2095-8137.2020.019
  • 发表时间:
    2020-03-18
  • 期刊:
    ZOOLOGICAL RESEARCH
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Liu,Zi-Chao;Liang,Jin-Yang;Zhao,Feng
  • 通讯作者:
    Zhao,Feng
Comparative transcriptomic analysis reveals the mechanism of leech environmental adaptation
比较转录组分析揭示水蛭环境适应机制
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2018.04.063
  • 发表时间:
    2018-07-20
  • 期刊:
    GENE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Liu, Zichao;Zhao, Feng;Wang, Debin
  • 通讯作者:
    Wang, Debin
King cobra peptide OH-CATH30 as a potential candidate drug through clinic drug-resistant isolates.
通过临床耐药分离株将眼镜王蛇肽OH-CATH30作为潜在的候选药物。
  • DOI:
    10.24272/j.issn.2095-8137.2018.025
  • 发表时间:
    2018-03-18
  • 期刊:
    Zoological research
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Zhao F;Lan XQ;Du Y;Chen PY;Zhao J;Zhao F;Lee WH;Zhang Y
  • 通讯作者:
    Zhang Y
Proteotranscriptomic Analysis and Discovery of the Profile and Diversity of Toxin-like Proteins in Centipede.
蜈蚣毒素样蛋白的概况和多样性的蛋白质转录组分析和发现。
  • DOI:
    10.1074/mcp.ra117.000431
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Molecular & Cellular Proteomics
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Zhao Feng;Lan Xinqiang;Li Tao;Xiang Yang;Zhao Fang;Zhang Yun;Lee Wenhui
  • 通讯作者:
    Lee Wenhui

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其他文献

CL-20/DNB共晶基PBXs相容性、界面作用和力学性能的MD模拟
  • DOI:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    肖鹤鸣
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  • DOI:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    赵锋
太湖春夏两季反硝化与厌氧氨氧化速率的空间差异及其影响因素
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    赵锋;许海;詹旭;朱广伟;郭宇龙;康丽娟;朱梦圆
  • 通讯作者:
    朱梦圆

其他文献

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赵锋的其他基金

miRNA调控蜈蚣毒液过敏原减低药材致敏性的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
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  • 项目类别:
    地区科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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