磷酸化和可变剪切修饰影响Bnip3调控线粒体自噬和细胞凋亡的结构及功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670742
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The interaction between Bnip3 and LC3 family members induces mitophagy, which is regulated by the phosphorylation modification on Bnip3. The spliced isoform Bnip3Δex3 can inhibit the pro-apoptotic Bnip3 and is preferentially expressed in several human adenocarcinomas and promotes survival. So far, the 3-D structures of Bnip3、Bnip3Δex3 and their homologues are unavailable. Recently, we have determinated the crystal structure of the complex of phosphopeptide of Bnip3 and LC3B. Besides, we have obtained the crystals of the truncated Bnip3 and LC3B with a resolution up to 3.5Å. In this project we will further refine the complex crystal and try to get the crystals of Bnip3Δex3 as well as Bnip3Δex3-LC3B, and then determine their structures. Based on these structures, on the level of biochemistry and cell biology, we will then engineer a serials of key mutants to elucidate the mechanisms of how the phosphorylation modification on Bnip3 to regulate the interactions between Bnip3 and LC3B to impact the mitophagy, as well as how Bnip3Δex3 to inhibit Bnip3 and then promote the survival of human adenocarcinoma cells. Our study will provide insights into the mechanism of Bnip3 and Bnip3Δex3 regulate mitophagy and apoptosis, and will be helpful for us to better understand the working mechanism of other mitophagy receptors such as Nix and Fundc1 in mammals and ATG32 in yeast.
磷酸化修饰可调节Bnip3与LC3家族成员相互作用介导线粒体自噬。剪切体Bnip3Δex3能抑制促凋亡蛋白Bnip3,促进人多种恶性腺瘤细胞生存。Bnip3、Bnip3Δex3及其同源蛋白的三维结构尚未被报道。最近我们已解出Bnip3磷酸化多肽-LC3B晶体结构,模拟磷酸化Bnip3片段蛋白-LC3B复合物衍射分辨率达3.5Å。本项目将继续优化晶体,尝试获取Bnip3Δex3以及Bnip3Δex3-LC3B的晶体,解析它们结构并基于结构设计关键氨基酸突变体,在生化和细胞水平上阐明磷酸化修饰调控Bnip3与LC3B相互作用介导线粒体自噬,以及Bnip3Δex3抑制Bnip3促进恶性腺瘤细胞生存的分子机理。研究结果将加深对Bnip3、Bnip3Δex3在线粒体自噬和细胞凋亡两个方面的理解,为其它哺乳动物线粒体自噬受体、酵母Atg32介导线粒体自噬的研究提供指导。

结项摘要

磷酸化修饰可调节Bnip3与LC3家族成员相互作用介导线粒体自噬。剪切体Bnip3Δex3能抑制促凋亡Bnip3蛋白,促进人多种恶性腺瘤细胞生存。本项目研究得到一下成果:(1)得到了多个高纯度Bnip3片段蛋白。已获得磷酸化Bnip3磷酸化多肽与LC3B蛋白的复合物晶体,并成功解析了其三维空间结构,目前文章已经撰写中,等文章投稿后才将三维空间结构文件存入国际蛋白质晶体数据库PDB中。(2)测定了不同Bnip3磷酸化位点修饰对Bnip3与LC3B相互作用的影响差异,根据三维空间结构信息,阐明了磷酸化修饰调控的机制。已获得了多种条件下Bnip3片段蛋白和LC3B的复合物微小晶体,进行了大量的晶体的优化并获得分辨率较低的衍射花样图。为了优化Bnip3-LC3B蛋白复合体的晶体分辨力,我们尝试了多种方法。(3)通过原核表达和纯化技术,获得的Bnip3Δex3基因片段编码的蛋白质,筛选Bnip3Δex3以及Bnip3Δex3-LC3B复合物单晶,目前还在进一步优化晶体和进行相关细胞生化实验。(4)本项目在研期间,已发表了3 篇sci论文(影响因子分别为:5.06,3.5,2.9)(见附件),并在国内期刊上发表6篇论文,还有很多的关键的实验结果正在整理投稿之中,这些论文均标注本项目基金号。在本项目期间,项目负责人联合招生培养4名儿科硕士学生,独立招生培养2名儿科硕士学生。派出8人次(项目负责人及项目负责人招生培养的儿科硕士研究生)参加相关的学习和培训会议,提升专业知识和技能。研究结果将加深对Bnip3、Bnip3Δex3在线粒体自噬和细胞凋亡两个方面的理解,为其它哺乳动物线粒体自噬受体、酵母Atg32介导线粒体自噬的研究提供指导。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
中毒性表皮坏死松解症伴噬血细胞综合征1例
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中华实用儿科临床杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王贤诚;张星亮;柯创宏;谭建新;黄宇戈
  • 通讯作者:
    黄宇戈
自噬在支气管哮喘发病及治疗中的作用及相关治疗药物研究进展
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1002-266x.2019.35.030
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    山东医药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈银慧;毛晓宁;吴锐剑;张星亮
  • 通讯作者:
    张星亮
Divergent Roles of miR-3162-3p in Pulmonary Inflammation in Normal and Asthmatic Mice as well as Antagonism of miR-3162-3p in Asthma Treatment
miR-3162-3p 在正常小鼠和哮喘小鼠肺部炎症中的不同作用以及 miR-3162-3p 在哮喘治疗中的拮抗作用
  • DOI:
    10.1159/000507250
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    International Archives of Allergy and Immunology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Zhang Feng;Chen Yinhui;Liu Juman;Peng Xi;Mao Xiaoning;Lu Weihong;Wu Ruijian;Huang Binglong;Bao Yanmin;Ma Lian;Huang Yuge;Zhang Xingliang
  • 通讯作者:
    Zhang Xingliang
支气管镜下气道炎症状态评估在慢性咳嗽患儿中应用
  • DOI:
    10.13507/j.issn.1674-3474.2018.06.007
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中华实用诊断与治疗杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王贤诚;刘桂萍;张星亮;柯创宏;谭建新
  • 通讯作者:
    谭建新
非成熟体序列对肺表面活性蛋白B分布及表达的影响
  • DOI:
    10.16519/j.cnki.1004-311x.2020.02.0023
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    生物技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李承燕;张星亮;刘国军;黄宇戈
  • 通讯作者:
    黄宇戈

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其他文献

线粒体自噬受体Nix蛋白的原核表达及其纯化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    广东医学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    熊英环;林千文;吴湘涛;张星亮
  • 通讯作者:
    张星亮
线粒体自噬受体Bnip3的载体构建及蛋白表达纯化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    生物技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张玲莉;张星亮
  • 通讯作者:
    张星亮
β-Ogg1与H-Ras可溶性原核表达纯化及其相互作用的鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    广东医学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张星亮;谭建新
  • 通讯作者:
    谭建新
自体髂骨取骨对脊髓型颈椎病中期临床疗效的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    东方食疗与保健
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张星亮;孟庆奇
  • 通讯作者:
    孟庆奇
PVP和PKP术式骨水泥注射量与术后椎体高度及疼痛评分的相关性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    现代医院
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡莉琼;熊英环;孟庆奇;张星亮
  • 通讯作者:
    张星亮

其他文献

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张星亮的其他基金

线粒体自噬受体蛋白FUNDC1与LC3复合物的结构及功能研究
  • 批准号:
    31300602
  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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