发夹结构DNA(Hairpin DNA)电化学传感器的设计与研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21073019
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    38.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0205.电化学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

针对单链和双链DNA分子组装的问题以及发夹结构DNA稳定性的问题,本项目拟设计和研究一类不用电活性基团标记的发夹结构DNA电化学传感器,具体包括:1) 发夹结构DNA在电极上组装并与肽核酸PNA杂化形成DNA-PNA单分子膜,考察与Ni2+作用前后膜电阻的变化,检测8种单碱基错配和错配的位置,分析检测限并探索在实体中应用的可能性;2) 设计发夹结构DNA探针链、组装并与目标链杂化形成"开放结构"的DNA-DNA单分子膜,用于高灵敏地识别Pb2+、Hg2+、Ag+以及两种或三种金属离子共存的情况;3) 发夹结构DNA组装、细胞色素P450酶覆盖、置于H2O2和多环芳烃存在的体系中,P450酶与H2O2将多环芳烃在发夹结构DNA表面 "在位代谢"并与DNA"在位作用",用于检测多环芳烃。这些研究工作的展开,将研发出一类新型的电化学DNA传感器,有望用于实体基因分析和实际污染环境检测。

结项摘要

针对单链和双链DNA分子组装的问题以及发夹结构DNA(Hairpin DNA)稳定性的问题,本项目设计和研究了一类不用电活性基团标记的发夹结构DNA电化学传感器,具体包括:1)DNA与肽核酸PNA杂化形成DNA-PNA,并在电极上组装形成单分子膜,考察与Ni2+作用前后膜电阻的变化,检测8种单碱基错配,检测限达10 fM。最后以PNA为探针链,研究在老年痴呆症早期预测方面的应用,并探索在实际体系(如血清和细胞裂解液)中的应用;2) 设计Hairpin DNA探针链,通过Pb2+诱导构型转变(从Hairpin DNA 到G-Quadruplex),实现对Pb2+的实时检测;设计Y-型DNA,实现对Ag+和半胱氨酸的可逆检测;3) 设计Hairpin DNA、组装并与目标链杂化形成“开放结构”的DNA-DNA单分子膜,通过构型转变,实现了对Pb2+、Hg2+的单独和分别检测;通过设计特殊结构DNA,实现对Pb2+、Hg2+、Ag+的分别和同时检测;基于Hg2+诱导DNA的构型转变,实现了对I-离子的检测;4)在研究金属离子诱导DNA构型转变的过程中发现,在高钠离子存在的条件下,K+可以从Pb2+稳定的G-quadruplex中夺取Pb2+进而生成K+稳定的G-quadruplex,从而实现了对K+的高灵敏高选择性检测。关于构型转变的规律,后续的工作仍在进行中。5)Hairpin DNA在电极上组装,通过Loop段碱基与羟基(氢键作用)或氨基多环芳烃(π-π共轭或与酶催化)选择性键合,实现了对羟基多环芳烃(9-羟基芴和奈酚)和氨基(氨基萘)的高灵敏高选择性检测。这些研究工作为进一步研发 新型的电化学DNA传感器奠定了基础,有望用于实体基因分析和实际污染环境检测。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Electrochemical detection of 9-hydroxyfluorene based on the direct interaction with hairpin DNA
基于与发夹 DNA 直接相互作用的 9-羟基芴的电化学检测
  • DOI:
    10.1039/c2an36255d
  • 发表时间:
    2013-01-01
  • 期刊:
    ANALYST
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Liang, Gang;Li, Xiaohong;Liu, Xinhui
  • 通讯作者:
    Liu, Xinhui
Impedimetric Immobilized DNA-Based Sensor for Simultaneous Detection of Pb2+, Ag+, and Hg2+
用于同时检测 Pb2、Ag 和 Hg2 的阻抗固定化 DNA 传感器
  • DOI:
    10.1021/ac2014096
  • 发表时间:
    2011-09-01
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Lin, Zhenzhen;Li, Xiaohong;Kraatz, Heinz-Bernhard
  • 通讯作者:
    Kraatz, Heinz-Bernhard
Pb2+ induced DNA conformational switch from hairpin to G-quadruplex: electrochemical detection of Pb2+
Pb2 诱导 DNA 构象从发夹转变为 G-四链体:Pb2 的电化学检测
  • DOI:
    10.1039/c1an15080d
  • 发表时间:
    2011-01-01
  • 期刊:
    ANALYST
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Lin, Zhenzhen;Chen, Yue;Fang, Weihai
  • 通讯作者:
    Fang, Weihai
Y-type, C-rich DNA probe for electrochemical detection of silver ion and cysteine
用于电化学检测银离子和半胱氨酸的 Y 型富含 C DNA 探针
  • DOI:
    10.1039/c1an15159b
  • 发表时间:
    2011-01-01
  • 期刊:
    ANALYST
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Gong, He;Li, Xiaohong
  • 通讯作者:
    Li, Xiaohong
Chemiluminescence Assay for Sensitive Detection of Iodide Based on Extracting Hg2+ from T-Hg2+-T Complex
基于从 T-Hg2 -T 复合物中提取 Hg2 的化学发光法灵敏检测碘化物
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Analyst
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Tao Li;Gang Liang;Xiaohong Li
  • 通讯作者:
    Xiaohong Li

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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