NLRX1/NLRBP3/NAIP基因多态性及环境与缺血性脑卒中易感性的关联研究

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基本信息

  • 批准号:
    81302497
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

NLRX1/NLRP3/NAIP may be implicated in the development of ischemic stroke (IS) by immunity, inflammation and apoptosis as well as mitochondria. The present study plans to explore and replicate the association of NLRX1/NLRP3/NAIP gene polymorphisms with IS by MALDI-TOF, GeXP-Genetic Analysis System and TaqMan SNP genotyping assays based on two independent large scale case-control studies. A structured questionaire is used to record the epidemiological information including status of smoking, alcohol drinking, diet, obesity,negative events and other environmental risk factors. Dual luciferase reporter assays and real-time RT-PCR are further carried out to determinate the effects of the significant SNPs. Finally, a comprehensive analysis is performed to demonstrate the associations of gene polymorphisms, haplotype, gene-gene, gene-environment interaction with IS and a predictive model is constructed to identify the persons with high risk of IS. The current study is expected to shed light on the association of NLRX1/NLRP3/NAIP and environment with the susceptibility of IS, which would provide scientific research rules for identifying genetic biomarkers and taking preventive steps for the high-risk groups.
NLRX1/NLRP3/NAIP基因可能通过免疫、炎症、凋亡、线粒体影响缺血性脑卒中的发生。本研究采用两项独立的大样本病例-对照研究,通过问卷调查获取研究对象流行病学信息(吸烟、饮酒、饮食、肥胖、负性事件等环境危险因素),运用飞行质谱、GeXP 多重遗传分析技术、Taqman探针技术,分别检测和验证以上基因多态性及其单体型与缺血性脑卒中的关联性,根据关联结果采用荧光定量RT-PCR检测及荧光素酶报告基因方法对关联基因阳性位点开展功能研究。最后综合分析三基因多态性、单倍型、基因-基因、基因-环境交互作用与缺血性脑卒中的关联性并构建缺血性脑卒中高危个体识别预测模型,本研究以期阐明NLRX1/NLRP3/NAIP基因及环境与中国汉族人群缺血性脑卒中发病风险的关联性,并为缺血性脑卒中易感生物学标志物的探讨及早期高危个体识别与特异性防护措施的制定提供科学依据。

结项摘要

NLRX1/NLRBP3/NAIP基因可能通过免疫、炎症、凋亡、线粒体影响缺血性脑卒中的发生。本研究采用大型的大样本病例-对照研究,通过问卷调查获取研究对象流行病学信息(吸烟、饮酒、饮食、肥胖、负性事件等环境危险因素),运用飞行质谱、GeXP 多重遗传分析技术、Taqman探针技术,分别检测和验证以上基因多态性及其单体型与缺血性脑卒中的关联性,根据关联结果采用荧光定量RT-PCR检测及荧光素酶报告基因方法对关联基因阳性位点开展功能研究。最后综合分析三基因多态性、单倍型、基因-基因、基因-环境交互作用与缺血性脑卒中的关联性并构建缺血性脑卒中高危个体识别预测模型,本研究以期阐明NLRX1/NLRBP3/NAIP基因及环境与中国汉族人群缺血性脑卒中发病风险的关联性,并为缺血性脑卒中易感生物学标志物的探讨及早期高危个体识别与特异性防护措施的制定提供科学依据。目前课题已经按照计划完成全部研究内容。 在两项病例-对照研究中执行,针对NLRX1/NLRBP3/NAIP基因的20余个tagSNPs位点进行大样本量的验证,并最终发现NLRBP3基因rs1539019位点突变与汉族人群缺血性脑卒中易感性相关,深入分析发现其可能通过影响人体代谢中间表型TC、LDL影响卒中发生。截止目前,研究成果已发表SCI论文6篇(累计影响因子为20分),在审论文1篇。今后将在不同种族人群中进行深入验证,同时探索基因功能的生物机制方面研究,以进一步明确NLRBP3对缺血性脑卒中的具体影响机制。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Two Novel Susceptibility SNPs for Ischemic Stroke Using Exome Sequencing in Chinese Han Population
利用外显子组测序在中国汉族人群中发现两个新的缺血性中风易感性 SNP
  • DOI:
    10.1007/s12035-013-8561-0
  • 发表时间:
    2014-04-01
  • 期刊:
    MOLECULAR NEUROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Zhang, Yanwei;Tong, Yeqing;Cheng, Jinquan
  • 通讯作者:
    Cheng, Jinquan
Functional genetic variants of pparx03b3; and pparalpha encoding peroxisome proliferator-activated receptors and susceptibility to ischemic stroke in chinese han population
pparx03b3 的功能性遗传变异;
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Cerebrovasc Dis
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Hou S;Zhan F;Cheng JQ;Liu J
  • 通讯作者:
    Liu J
Associationof functional genetic variants in ppargamma and pparalpha encoding peroxisomeproliferator-activated receptors with ischemic stroke in a unique chinesepopulation
编码过氧化物酶体增殖物激活受体的 ppargamma 和 pparalpha 功能性遗传变异与中国独特人群缺血性中风的关联
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Int J Cardiol
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ying X;Lu Z;Liu J;Cheng J
  • 通讯作者:
    Cheng J
Association of functional genetic variants in PPARδ encoding peroxisome proliferator-activated receptor delta with ischemic stroke in Chinese Uyghur population.
编码过氧化物酶体增殖物激活受体δ的PPARγ功能性遗传变异与中国维吾尔族人群缺血性中风的关联。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    J Neurol Sci
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li X;Hou S;Lu Q;Liu J
  • 通讯作者:
    Liu J
The nlrp3 inflammasome and stroke
nlrp3 炎症小体与中风
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Int J Clin Exp Med
  • 影响因子:
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  • 作者:
    Hou SY;Lu Z;Wang ZH;Liu JF
  • 通讯作者:
    Liu JF

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基于Meta分析《抗菌药物临床应用管理办法》在基层医疗机构实施效果评价
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    公共卫生与预防医学
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  • 作者:
    殷晓旭;龚言红;卢祖洵;童叶青
  • 通讯作者:
    童叶青

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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