肿瘤抑制蛋白APC及与其相互作用蛋白的复合物的结构生物学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30900225
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    吴更
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    C0501.结构生物学
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

腺瘤性息肉蛋白adenomatous polyposis coli (简称APC)是一种重要的肿瘤抑制蛋白。APC在Wnt信号传导通路中起着关键作用，APC的基因突变导致结肠癌等多种癌症。APC的Armadillo重复结构域是APC蛋白序列中最保守的一段区域，并是Asef、PP2A的B56亚基等多种蛋白的结合位点。APC的C末端结合DLG、EB1等蛋白。本项目拟从结构生物学角度，纯化、结晶APC的Armadillo重复结构域，APC的Armadillo结构域与Asef、PP2A-B56蛋白形成的复合物，以及APC的C末端与DLG、EB1形成的复合物，并用X射线衍射方法解析这些蛋白质与蛋白质复合物的晶体结构。这些蛋白质与蛋白质复合物晶体结构的解析将为我们深入理解肿瘤抑制蛋白APC如何结合Asef、PP2A-B56、DLG、EB1等蛋白的分子机理，如何实现其抑制细胞增殖的生理功能提供重要线索。

结项摘要

肿瘤抑制蛋白adenomatous polyposis coli（简称APC）是一种重要的肿瘤抑制蛋白，其基因在80%以上的先天性结肠癌病人和后天散发性结肠癌病人被发现存在突变。在国家自然科学基金青年基金项目的支持下，经过三年的努力，我们解析了人APC蛋白的最保守的armadillo（简称ARM）结构域的晶体结构，并发现这个结构域有内在的柔性（发表于BBRC，2011年，通讯作者）。我们解析了人APC蛋白的ARM结构域与鸟苷酸交换因子Asef的复合物的晶体结构，揭示了APC特异性识别Asef、激活其鸟苷酸交换因子活性的分子机理（发表于Cell Research，2012年，通讯作者，被英国皇家科学院院士Mariann Bienz选入Faculty of 1000数据库推荐论文）。此外，我们还解析了APC与肿瘤抑制蛋白discs large（简称DLG）的复合物的晶体结构（发表于PLoS One，2011年，通讯作者），阐明了APC蛋白如何用其保守的C端10个氨基酸的肽结合DLG的PDZ1结构域和PDZ2结构域的分子机理。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Crystal structure of the armadillo repeat domain of adenomatous polyposis coli which reveals its inherent flexibility.
腺瘤性息肉病大肠杆菌犰狳重复结构域的晶体结构揭示了其固有的灵活性。
  • DOI：
    10.1016/j.bbrc.2011.08.044
  • 发表时间：
    2011-09
  • 期刊：
    Biochemical and Biophysical Research Communications
  • 影响因子：
    3.1
  • 作者：
    吴更
  • 通讯作者：
    吴更
Molecular basis for the recognition of Adenomatous Polyposis Coli by the Discs Large 1 protein.
Discs Large 1 蛋白识别腺瘤性结肠息肉病的分子基础。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    PLoS One
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    吴更
  • 通讯作者：
    吴更
Purification, crystallization, and preliminary X-ray analysis of DndE protein from Salmonella enterica serovar Cerro 87 which is involved in DNA phosphorothioation.
对参与 DNA 硫代磷酸化的肠沙门氏菌 Cerro 87 血清型 DndE 蛋白进行纯化、结晶和初步 X 射线分析。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Acta Crystallography Section F Structural Biology and Crystallization Communications
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴更
  • 通讯作者：
    吴更
Crystal structure of the cysteine desulfurase DndA from Streptomyces lividans which is involved in DNA phosphorothioation.
浅青紫链霉菌中参与 DNA 硫代磷酸化的半胱氨酸脱硫酶 DndA 的晶体结构
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0036635
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Chen F;Zhang Z;Lin K;Qian T;Zhang Y;You D;He X;Wang Z;Liang J;Deng Z;Wu G
  • 通讯作者：
    Wu G

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其他文献

Ⅳ型戊型肝炎病毒ORF3蛋白在人肝细胞中相互作用蛋白的筛选与鉴定
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    上海交通大学学报(农业科学版)
  • 影响因子：
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  • 作者：
    郭亮;傅艳琨;吴更;崔立;华修国
  • 通讯作者：
    华修国
戊型肝炎病毒ORF3蛋白的原核表达和纯化
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    上海交通大学学报(农业科学版)
  • 影响因子：
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  • 作者：
    傅艳琨;郭亮;吴更;华修国;崔立
  • 通讯作者：
    崔立

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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