长雄野生稻内生菌的群落结构特征及其抗逆功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31560041
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0106.微生物与环境互作
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Strong rhizomatousness is a key component of perenniality of Oryza longistaminata that contribute to competitiveness and perennial trait of the wild rice. At present, the sudies on O. longistaminata are focus on genetic research and mapping of gene controlling rhizomatousness, but the endophytes biodiversity and biofunctions is unclear. Studies of the biodiversity of the endophytes, the interaction of endophytes with their host and their function within their hosts are important to address the ecological relevance and evolution of O. longistaminata and guide the agricultural practice. In the project, an effort was taken to get insights into the endophytes of O. longistaminata from the ecosystem to molecular levels. Community structure and biodiversity of the endophytes in different tissues of O. longistaminata from 14 different afria countries will be analyse using MiSeq pyrosequencing, the dynamic change of endophytes community structure under different conditions will be determined by MiSeq analysis, the transmission of endophytes will be observed using the GFP-tagged strains. In addition to, the role of endophytes in plant abiotic stress tolerance will be estimated through assessing the efficiency of endophyte colonization of inoculated plants and the absence of endophytes in mock-inoculated controls. To study the endophytes in O. longistaminata with specical evolution and survival strategy will reveal the evolution and molecular mechanism in the plant micro-ecosystem.
发达的地下茎使得长雄野生稻具备优良的抗逆性和多年生的特性。目前国内外研究多集中于长雄野生稻地下茎相关基因的克隆,对其内生菌的研究尚无报道。挖掘长雄野生稻内生菌资源,分析植物与内生菌互作的分子机制,对于阐明长雄野生稻的进化生物学特征和农业实践生产具有重要意义。本项目以具有特殊进化历程和生存策略的长雄野生稻为材料,拟对其地下茎、根系及叶等组织的内生菌群落结构特征和增强宿主的抗逆性进行分析。通过MiSeq对源自14个非洲国家的长雄野生稻内生菌进行高通量测序,分析内生菌生物多样性和群落结构特征。利用MiSeq分析逆境胁迫下内生菌群落结构的动态变化,筛选具有促进宿主抗逆活性的内生菌,并观察其定殖过程。进一步,通过回接和消除长雄野生稻的内生菌,研究其提高宿主抗逆的作用机制。本研究不仅为揭示植物微生态系统的进化和植物-微生物互作的分子机制提供理论依据,而且为现代水稻遗传育种提供理论支持和实践基础。

结项摘要

全球气候变暖加剧干旱对农作物的危害,如何应对干旱对水稻的产量和品质的影响?除了节水灌溉、改善作物本身的抗旱能力等方式,通过改善水稻微生物来提高宿主抗旱成为一种新的解决方案。长雄野生稻具备抗旱、抗虫、抗病等优良性状,挖掘长雄野生稻微生物资源,分析植物与微生物的互作效应,对于阐明长雄野生稻的进化生物学特征和农业实践生产具有重要意义。本项目通过16s rRNA高通量测序,分析了长雄野生稻叶、茎、根和根系的微生物组。结果表明,长雄野生稻四个组织中Proteobacteria,Firmicutes 和Bacteroidetes都是优势菌,但四个组织的微生物群落结构存在显著差异(PERMANOVA, P<0.01)。干旱显著改变了长雄野生稻各组织的微生物群落结构和共发生网络特征。从水稻田分离的固氮共生菌(Raoultella terrigena和Sinorhizobium sp)具有溶磷、产IAA和铁载体等促生特性。水培、盆栽和田间试验表明,接种Raoultella terrigena和Sinorhizobium sp显著的提高了栽培稻中华11的根生物量、株高和光合效率,这种促生效应在缺氮环境下尤为显著。本项目表明野生稻是宝贵的微生物资源库,为挖掘野生稻微生物组提高栽培稻的产量和品质提供了理论依据和实践价值。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Over-expression of a protein disulfide isomerase gene from Methanothermobacter thermautotrophicus, enhances heat stress tolerance in rice
嗜热甲烷杆菌中蛋白质二硫键异构酶基因的过度表达可增强水稻的热应激耐受性
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2018.10.064
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Gene
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Wang Xin;Chen Jie;Liu Changai;Luo Junling;Yan Xin;Ai Aihua;Cai Yaohui;Xie Hongwei;Ding Xia;Peng Xiaojue
  • 通讯作者:
    Peng Xiaojue
Regulation of ATRIP protein abundance by RAD9 in the DNA damage repair pathway.
DNA 损伤修复途径中 RAD9 对 ATRIP 蛋白丰度的调节。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Cell Mol Biol (Noisy-le-grand)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cai, Y-H;Li, B-M;Hang, H-Y;Ding, X
  • 通讯作者:
    Ding, X
干旱胁迫对长雄野生稻根际微生物群落结构的影响
  • DOI:
    10.13764/j.cnki.ncdl.2018.06.017
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    南昌大学学报(理科版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韦海波;毛心怡;毛立晖;刘聪;吴雨宸;丁霞
  • 通讯作者:
    丁霞
Comparative proteomic analysis of Methanothermobacter thermautotrophicus reveals methane formation from H(2) and CO(2) under different temperature conditions.
嗜热甲烷杆菌的比较蛋白质组分析揭示了不同温度条件下 H-2 和 CO2 形成甲烷
  • DOI:
    10.1002/mbo3.715
  • 发表时间:
    2019-05
  • 期刊:
    MicrobiologyOpen
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Liu C;Mao L;Zheng X;Yuan J;Hu B;Cai Y;Xie H;Peng X;Ding X
  • 通讯作者:
    Ding X

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其他文献

川西平原水稻土对磺胺甲噁唑的吸附动力学研究
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    吴倪征
吉布斯抽样在数据缺失中的应用及其R实现 Application of Gibbs Sampling in Data Missing and Execution in R
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁霞
  • 通讯作者:
    丁霞
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李健
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁霞;魏玮;沈洪;苏泽琦
  • 通讯作者:
    苏泽琦
Gateway技术构建盐和干旱胁迫下水稻根系混合cDNA文库及其质量鉴定
  • DOI:
    --
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    蔡耀辉

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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