富营养湖泊中溞属种类表型可塑性的生态适应及其分子进化机制

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基本信息

  • 批准号:
    31870451
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0306.生态系统生态学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Human activities strengthen the process of lake eutrophication. Cyanobacterial bloom and fishery culture could affect the occurence of phenotypic plasticity of Daphnia species in eutrophic lakes. Using the technology of transcriptome sequencing, real-time fluorescence quantitative PCR and molecular markers (16S DNA,COⅠ and microsatellite), the mechanisms on ecological adaptation and molecular evolution of phenotypic plasticity of Daphnia species in eutrophic lakes located in the middle and lower reaches of the Yangtze River were investigated. Combined with the resting-eggs of Daphnia species stored in lake sediments, we discussed that the ecological adaptation mechanism and long-term molecular evolution laws of the formation of Daphnia phenotypic plasticity in response to the process of lake eutrophication, through revealing the differences of morphology, life history traits and the expression of candidate genes in Daphnia between ancestral populations and modern populations. In order to reveal the mechanisms on ecological adaptation and molecular evolution of phenotypic plasticity of Daphnia species in eutrophic lakes, we studied the effects of fish kairomones, microcystins and their combination on the morphology, life history traits and candidate genes of Daphnia species. We further discussed species diversity of Daphnia and the possibility of speciation according to the analysis on genetic structure of Daphnia in different eutrophic lakes located in the middle and lower reaches of the Yangtze River. Our results will provide the theory evidence to the fitness of species in response to environmental selection and species evolutionary mechanism in the process of lake eutrophication.
人类活动加剧导致了湖泊富营养化的加剧,蓝藻水华和渔业养殖影响富营养湖泊中溞属种类表型可塑性的发生。运用转录组测序、荧光定量PCR和分子标记技术,研究长江中下游地区富营养湖泊中溞属种类表型可塑性的生态适应及其分子进化机制。结合湖泊沉积层保存的溞属种类休眠卵,通过揭示历史种群与现代种群的形态、生活史特征及相关候选基因表达的差异,探讨溞属种类响应富营养化进程中形成的表型可塑性的生态适应机制和长期的分子进化规律;通过开展鱼类信息素、藻毒素及其共同作用对溞属种类的形态、生活史特征及相关候选基因表达的影响研究,揭示长江中下游地区富营养湖泊中影响溞属表型可塑性的生态适应及其分子进化机制;通过不同湖泊溞属种类的遗传结构分析,进一步探讨长江中下游地区富营养湖泊中溞属种类的物种多样性和物种形成的可能性。本研究结果将为在湖泊富营养化进程中探讨物种对环境选择的适合度及物种进化规律提供理论依据。

结项摘要

. 湖泊富营养化和气候变暖,导致了湖泊蓝藻水华的大量暴发,蓝藻水华和鱼类捕食诱导了溞属种类表型可塑性的发生。运用转录组测序、荧光定量PCR和RNA干扰等技术,研究了湖泊溞属种类表型可塑性的生态适应及其分子进化机制,取得了以下成果:. (1)已调查的湖泊中,发现了3个溞属种类,即中华拟同形溞、盔形溞和蚤状溞,不同湖泊的种类、季节分布和密度差异明显。与2002-2003年相比,2020-2021年巢湖溞属种类较低的密度与自2020年1月以来实行全湖渔业禁捕、导致捕食压力增加有关。来自三个湖泊的盔形溞形态和生活史参数具有种群间和克隆间的差异性。(2)实验表明,溞属种类能够通过其形态和生殖的权衡响应鱼类信息素或铜绿微囊藻的影响;不同形态铜绿微囊藻(单细胞和群体)下,溞属种类生长生殖的响应模式不同;长时间暴露在群体铜绿微囊藻下,种间竞争强烈抑制了小型种类盔形溞的种群增长,而增强了大型种类中华拟同形溞的种群增长。(3)鱼类信息素诱导了两个溞属种类的生殖量增加,导致中华拟同形溞壳刺变长,而铜绿微囊藻的存在却明显抑制了两个溞属种类的生长生殖,但当两者协同作用时,鱼类信息素能够缓解铜绿微囊藻对溞属种类生长生殖的抑制影响。与现代种群相比(Clones 1~3),较高浓度的铜绿微囊藻能够显著抑制两个溞属种类历史种群(Clones 4~6)的产幼溞数。此外,中华拟同形溞现代种群的产幼溞数在含鱼类信息素组明显高于历史种群。(4)在鱼类信息素诱导下,24个与盔形溞形态相关(头盔、壳刺)和19个与中华拟同形溞生殖相关的候选基因被筛选,且鱼类信息素显著增加了这些候选基因的表达水平。两个与中华拟同形溞生殖相关的未知基因(Cluster-32243和Cluster-22885)、一个与盔形溞壳刺形成相关的未知基因(Dagcut)功能被证实。同时,CYP302A1基因被证实在中华拟同形溞的蜕皮合成通路上起重要作用。此外,铜绿微囊藻显著增加了9个已知蜕皮基因在中华拟同形溞体内的表达水平。. 本研究结果将对进一步研究溞属种类表型可塑性的生态和分子机制提供重要参考和支撑。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Cloning and functional analysis of the molting gene CYP302A1 of Daphnia sinensis.
中华溞蜕皮基因CYP302A1的克隆及功能分析
  • DOI:
    10.1186/s12983-023-00483-2
  • 发表时间:
    2023-01-12
  • 期刊:
    FRONTIERS IN ZOOLOGY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Qi, Huiying;Cao, Huijuan;Zhao, Yajie;Cao, Yaqin;Jin, Qide;Wang, Yeping;Zhang, Kun;Deng, Daogui
  • 通讯作者:
    Deng, Daogui
Experimental study of population variations on the morphology and reproduction of Daphnia galeata from three Chinese lakes
中国三个湖泊帽状溞形态和繁殖种群变异的实验研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    American Journal of Environmental Science and Engineering
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yaqin Cao;Huiying Qi;Jun Li;Kun Zhang;Daogui Deng
  • 通讯作者:
    Daogui Deng
Effects of toxic Microcystis aeruginosa on the expression of Hox genes in Daphnia similoides sinensis.
有毒铜绿微囊藻对中华溞Hox基因表达的影响
  • DOI:
    10.1002/ece3.8685
  • 发表时间:
    2022-03
  • 期刊:
    Ecology and evolution
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Xu X;Cao Y;Qi H;Deng D;Zhang YN;Wu J;Peng S;Zhou Z
  • 通讯作者:
    Zhou Z
Long-term eutrophication affects vertical changes of Daphnia ephippia in the sediments of a subtropical Chinese lake
长期富营养化对中国亚热带湖泊沉积物中溞垂直变化的影响
  • DOI:
    10.1007/s11356-019-07157-9
  • 发表时间:
    2019-12
  • 期刊:
    Environmental Science and Pollution Research
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Zhang Kun;Deng Daogui;Wang Wenping;Peng Shuixiu;Liu Fei;Ji Lei
  • 通讯作者:
    Ji Lei
Transcriptome analysis of different life-history stages and screening of male-biased genes in Daphnia sinensis.
中华溞不同生活史阶段的转录组分析及雄性偏基因筛选
  • DOI:
    10.1186/s12864-022-08824-x
  • 发表时间:
    2022-08-13
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
  • 通讯作者:

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其他文献

温度对发头裸腹溞(Moina irrasa)种群动态和两性生殖的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    湖泊科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张赛;邓道贵;李玉颖;孟小丽;任盼盼;雷娟;金显文
  • 通讯作者:
    金显文
3种溞属动物线粒体COⅠ基因及其侧翼序列的PCR扩增与分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张海军
巢湖春夏季节浮游植物的动态变化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    生态科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孟小丽;邓道贵;张赛;杨威;陈丽娜
  • 通讯作者:
    陈丽娜
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    生态科学
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    --
  • 作者:
    邵元启;邓道贵;葛茜;张晓莉;杨威
  • 通讯作者:
    杨威
基于16S rDNA和COⅠ基因序列探讨四种溞类的系统关系和分类地位
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邓道贵;王文平;张晓莉;查岭生
  • 通讯作者:
    查岭生

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邓道贵的其他基金

长江中下游浅水湖泊溞属枝角类休眠卵的遗传多样性及其优势种的种群遗传结构对水环境的响应机制
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    31370470
  • 批准年份:
    2013
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    80.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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    27.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
富营养化水体中蓝藻对枝角类休眠卵形成和萌发影响的生态学机理
  • 批准号:
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  • 批准年份:
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  • 资助金额:
    9.0 万元
  • 项目类别:
    专项基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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