桑树响应植原体侵染的microRNAs的生物学功能和调控机制研究

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项目介绍
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基本信息

  • 批准号:
    31100478
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1609.森林保护学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

桑树黄化型萎缩病是由植原体引起的毁灭性病害,目前关于桑树响应植原体侵染的分子机制还不清楚。microRNAs (miRNAs) 作为一种重要的基因表达调控因子,在植物响应外界胁迫过程中扮演重要角色。桑树在响应植原体侵染的过程中必然有miRNAs的参与,对参与响应过程的miRNAs 进行研究,有助于更好地理解桑树响应植原体侵染的分子机制,但目前还未见有植物miRNAs响应植原体胁迫方面的报道。本课题拟在已完成的桑树转录组学分析的基础上,利用高通量测序的小RNA数字化分析技术,鉴定出桑树响应植原体侵染的miRNAs,利用转基因技术,整合转录组学和蛋白质组学分析方法,探讨鉴定的miRNAs的生物学功能,初步揭示基于miRNAs水平上的桑树响应植原体侵染的调控机制,为全面了解桑树黄化型萎缩病的发生机制及桑树功能基因组学研究奠定基础,对于丰富和发展miRNAs的生物学功能具有重要意义。

结项摘要

桑树黄化型萎缩病是由植原体引起的毁灭性病害,目前该病发生的分子机制仍不清楚。植物miRNAs作为一种重要的调控因子,在植物防卫体系中扮演重要角色。本研究构建了桑树感病和健康叶片小RNA文库,鉴定了166种保守的miRNAs,其中有 62种miRNAs表达量差异显著;预测得到23个新的miRNAs,其中有13个表达差异显著。预测到差异表达的miRNAs的靶基因399个,部分靶基因通过降解组分析得到验证。这些靶基因的功能涉及到代谢、发育、信号传导等多个生理过程;本研究克隆得到了3个响应植原体侵染的新miRNAs基因,并成功转化了拟南芥。研究发现桑树的3个新mul-miRNAs基因均能在转基因拟南芥中加工形成成熟体,并可以靶向拟南芥中的同源靶基因。对转基因拟南芥进行包括植原体侵染在内的生物胁迫和非生物胁迫试验,表明3个新miRNAs在植物生长发育和响应逆境胁迫过程中具有不同的生物学功能,他们不仅参与响应植原体侵染过程,还同时参与植物的生长发育和多种生物胁迫及非生物胁迫响应过程。另外,本研究还克隆得到mul-miRn3的靶基因MulBAH1和mul-miRn12的靶基因MulZF1基因,并对其生物学功能进行了研究。除此之外,本研究还对mul-miR482的生物功能进行了研究,发现mul-miR482在植物抗病反应过程中具有负调控作用,同时mul-miRNA还参与了植物的生长发育过程的调控。通过整合基因表达谱和蛋白质组表达谱分析,初步揭示了mul-miR482调控的代谢网络,为深入研究该miRNA的功能奠定了基础。. 在完成研究计划内容的基础上,我们还对桑树响应植原体侵染的siRNAs进行了分析,分别在健康和感病桑树叶片小RNA文库中鉴定到了271, 367和315, 910条siRNAs,发现有500个 siRNA簇,鉴定了14, 598差异表达的 siRNAs。研究还发现植原体侵染可以诱导MulMIR393A基因表达升高,而且mul-miR393可以激发产生次级siRNAs。本研究首次对桑树响应植原体侵染的sRNAs 进行了研究,初步揭示了基于miRNAs水平上的桑树响应植原体侵染的调控机制,研究结果对于全面揭示桑树黄化型萎缩病发生的分子机制具有重要意义,同时为桑树功能基因组的研究奠定了基础,对于丰富和发展植物miRNAs的生物学功能具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Metabolomic analysis reveals the potential metabolites and pathogenesis involved in mulberry yellow dwarf disease
代谢组学分析揭示桑树黄矮病的潜在代谢物和发病机制
  • DOI:
    10.1111/pce.12255
  • 发表时间:
    2014-06-01
  • 期刊:
    PLANT CELL AND ENVIRONMENT
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Gai, Ying-Ping;Han, Xue-Juan;Ji, Xian-Ling
  • 通讯作者:
    Ji, Xian-Ling
桑树景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶基因的遗传转化及生物学功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    蚕业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    袁传忠;韩雪娟;李轶群;莫瑶瑶;郭方月;李卫国;盖英萍;冀宪领
  • 通讯作者:
    冀宪领
桑树黄化型萎缩病植原体溶血素基因MDPH的克隆及生物信息学分析和原核表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    蚕业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卢宝云;韩雪娟;袁传忠;李轶群;盖英萍;冀宪领
  • 通讯作者:
    冀宪领
桑树乳汁蛋白基因MLX56的克隆及生物学功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    蚕业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    莫瑶瑶;张华梁;郭方月;王红;刘琪;袁传忠;盖英萍;冀宪领
  • 通讯作者:
    冀宪领
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    蚕业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    袁传忠;莫瑶瑶;李轶群;郭方月;李卫国;盖英萍;冀宪领
  • 通讯作者:
    冀宪领

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  • 作者:
    刘超瑞;董晴;王玉琪;郭方月;董晓楠;李燕;盖英萍;冀宪领
  • 通讯作者:
    冀宪领

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
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          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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