肺炎链球菌锌离子摄取关键脂蛋白AdcA和AdcAII金属结合特性的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21571082
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Zinc is an essential element for bacterial survival and infection to host. The zinc uptake system on cell surface is vital to bacterial virulence. Previous studies found that two lipoproteins AdcA and AdcAII, which are located on the cell surface and anchored to the cell membrane, were responsible for zinc uptake in Streptococcus pneumoniae.. This project will clone, express and purify two AdcA and AdcAII proteins. Fluorescence, UV-Vis, Circular dichroic spectroscopy, Stop-flow and other biophysical and biochemical methods will be applied to characterize the thermodynamics and kinetics properties of metal binding and release of AdcA and AdcAII, to study the effects of metal on protein conformation, and to analyze the difference and the preference in zinc transport of two proteins. Site-mutagenesis, NMR and in vivo experiments will analyze the roles of key amino acids in metal binding. At a suitable condition, proteins will be crystallized and their structure will be solved. We will study the relationship between the structure and function, and further elucidate the molecular mechanism of zinc uptake in Streptococcus pneumoniae. These results will provide new clues for the study of bacterial zinc transport mechanism and important theoretical basis for development of new vaccines and anti-bacterial drugs.
锌离子是细菌赖以生存和对宿主形成感染的必需元素,因此位于细胞表面的锌摄取系统也直接决定了细菌的毒力。研究发现在肺炎链球菌表面,主要是两个脂蛋白AdcA和AdcAII锚定于细胞膜上负责从外界摄取锌离子。. 本课题拟对两种锌摄取蛋白进行克隆、表达和纯化;利用荧光光谱、紫外光谱、圆二色光谱以及停留等多种生物物理和生物化学的研究手段,交叉组合表征锌摄取蛋白的金属结合及释放的热力学和动力学特性,研究金属结合对蛋白构象的影响,分析二者的异同以及在锌转运过程中的优先性;结合定点突变技术和核磁共振技术及体内功能验证等研究关键氨基酸残基的作用;在条件合适的情况下,尝试结晶蛋白质并解析结构,分析其结构与功能的关系,进而阐明AdcA和AdcAII介导的肺炎链球菌的锌摄取分子机制。本课题的成果将为研究细菌中锌离子运输提供重要的新思路,同时为开发基于锌摄取蛋白的新疫苗和抗菌药物提供重要理论基础。

结项摘要

锌离子是细菌生存和感染的关键元素。因此位于细胞表面的锌摄取系统也直接决定了细菌的毒力。研究发现在肺炎链球菌表面,主要是两个脂蛋白AdcA和AdcAII锚定于细胞膜上负责从外界摄取锌离子。.本课题通过进化分析发现在大多数细菌体内都具有AdcA的同源蛋白,但大部分都是单结构域的小分子量蛋白质,这可能是由于小蛋白的生物合成效率更好。然而,我们发现具有两个锌结合位点的双结构域蛋白AdcA显著富集在链球菌属中,其中许多是感染人体的病原菌。热力学和动力学实验表征发现N端对于锌的亲和力比C端强,结合速率也比较快;分子动力学模拟(MD simulation)显示AdcA的N端和C端结构域结合锌可以先后稳定其三维结构,并形成一个域间接触面,这些都是保证增加蛋白对锌的亲和力和传输速度的基础。这种特殊的双结构域赋予链球菌属在锌稀缺的情况下具有明显的锌转运优势,这是AdcA单结构域同源蛋白所不具有的。在链球菌中AdcA凭借双结构域的优势在锌离子结合速率方面较AdcAII 快两个数量级,因此在锌离子摄取过程中发挥主要作用,而AdcAII发挥次要作用,推测其在细菌缺锌情况下作为补充转运通路。AdcAII本身作为双功能蛋白既可以结合层黏连蛋白,也可以转运锌离子和锰离子。深入研究AdcA和AdcAII介导的锌锌转运机制为研发抗链球菌药物提供了潜在目标。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Novel Mechanistic Insights into Bacterial Fluoroquinolone Resistance
对细菌氟喹诺酮耐药性的新机制见解。
  • DOI:
    10.1021/acs.jproteome.9b00410
  • 发表时间:
    2019-11-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Du, Gao-Fei;Zheng, Yun-Dan;Sun, Xuesong
  • 通讯作者:
    Sun, Xuesong
Cytotoxicity of Silver Nanoparticles against Bacteria and Tumor Cells
银纳米粒子对细菌和肿瘤细胞的细胞毒性。
  • DOI:
    10.2174/1389203718666161108092149
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Shi, Tianyuan;Sun, Xuesong;He, Qing-Yu
  • 通讯作者:
    He, Qing-Yu
Photocatalytic Protein Damage by Silver Nanoparticles Circumvents Bacterial Stress Response and Multidrug Resistance.
银纳米颗粒的光催化蛋白质损伤可规避细菌应激反应和多药耐药性。
  • DOI:
    10.1128/msphere.00175-19
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    mSphere
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Shi Tianyuan;Wei Qiuxia;Wang Zhen;Zhang Gong;Sun Xuesong;He Qing-Yu
  • 通讯作者:
    He Qing-Yu
Two zinc-binding domains in the transporter AdcA from Streptococcus pyogenes facilitate high-affinity binding and fast transport of zinc
化脓性链球菌转运蛋白 AdcA 中的两个锌结合域促进锌的高亲和力结合和快速转运。
  • DOI:
    10.1074/jbc.m117.818997
  • 发表时间:
    2018-04-20
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Cao, Kun;Li, Nan;Sun, Xuesong
  • 通讯作者:
    Sun, Xuesong
Crucial residue Trp158 of lipoprotein PiaA stabilizes the ferrichrome-PiaA complex in Streptococcus pneumoniae
脂蛋白 PiaA 的关键残基 Trp158 可稳定肺炎链球菌中的铁铬-PiaA 复合物。
  • DOI:
    10.1016/j.jinorgbio.2016.08.015
  • 发表时间:
    2017-02-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Zhang, Liang;Li, Nan;He, Qing-Yu
  • 通讯作者:
    He, Qing-Yu

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珠江口及南海沉积物碳黑的放射性
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孙雪松的其他基金

巴豆酰转移酶SPD_0839对肺炎链球菌铁摄取和毒力调控机制的研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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