转录共抑制子SlTPL3调控多心室番茄形成的分子机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870286
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Tomato is not only one of the most important vegetables in the world, but also as a model plant for fruit development and ripening. It is reported that the size of tomato and the incidence of malformed fruit are two important economic traits in tomato production. The fruit size and the incidence of fruit malformation of tomato were significantly affected by locule number. The greater the number of locules is, the bigger the fruit will be and the higher the incidence of malformed fruit will be. Therefore, the study of molecular mechanism of tomato locule formation is of great significance to the production of tomato. . SlTPL3 belongs to transcriptional co-repressors family. Previously, we found that the transgenic plant of SlTPL3 down-regulated lines (SlTPL3 RNAi) produced fruits with greater numbers locules. This phenotype suggested that SlTPL3 regulates fruit locules formation. Aims to study the regulatory mechanism of SlTPL3 in locules formation, this project will be performed by phenotyping the transgenic plants of SlTPL3 overexpression and SlTPL3 down-regulated lines; searching the upstream regulator of SlTPL3 and the interacted transcription factor and target genes of SlTPL3 by using RNA-seq, Chip-qPCR and Screening of yeast library technology; functional analysis of target genes by using CRISPR/Cas9 technology; detecting the methylation and acetylation level of target genes in SlTPL3 RNAi lines by using Chip-qPCR technology. The research result will provide theoretical basis for molecular mechanism of malformed fruit formation.
番茄是世界上最重要的蔬菜之一,也是研究果实发育与成熟的模式植物。研究发现,果实的大小和畸形果发生率是番茄生产中重要的经济性状,而心室数是影响番茄果实大小性状和畸形果发生率的重要因素。因此,心室形成的机制研究对于番茄生产具有非常重大的意义。.SlTPL3属于转录共抑制子家族,前期研究发现SlTPL3的RNAi干扰沉默植株产生了多心室番茄,说明该基因对心室的形成具有调控作用,为了深入研究该基因的调控机制,本项目从SlTPL3超表达和基因沉默植株入手,通过酵母文库筛选、RNA-seq及ChIP-qPCR等技术筛选到SlTPL3的上游调控因子、与SlTPL3互作的转录因子及其共有靶基因,通过CRISPR/Cas9以及ChIP-qPCR技术验证靶基因功能及检测多心室番茄中靶基因的甲基化以及乙酰化水平来解析SlTPL3调控多心室番茄形成的分子机制,研究结果将为畸形果形成的分子机制提供理论依据。

结项摘要

番茄是世界上最重要的蔬菜之一,也是研究果实发育与成熟的模式植物。研究发现,畸形果发生率是番茄生产中重要的经济性状,而心室数是影响番茄畸形果发生率的重要因素。因此,研究番茄心室数量形成的调控机制具有重要理论和经济价值。.本研究发现转录共抑制子SlTPL3与SlWUS在SAM的分化过程中具有表达相关性;SlTPL3RNAi植株的SAM变大,果实心室数量增加,同时SlTPL3的CRISPR/Cas9基因敲除植株也产生了多心室番茄;RNA-seq分析发现SAM中差异表达的基因显著富集在IAA信号转导途径、GA合成代谢等途径,且外源IAA以及GA合成抑制剂PAC处理恢复了SlTPL3RNAi多心室的表型;Y2H、BiFc、LCI、Co-IP的实验表明SlTPL3与SlWUS互作,DAP-seq、EMSA以及双荧光素酶报告系统的实验表明SlTPL3和SlWUS蛋白的相互作用增强了SlWUS对下游靶基因SlPIN3、SlGA2ox1启动子的抑制和激活作用。因此,SlTPL3-SlWUS模块通过调控SlPIN3和SlGA2ox1介导IAA分布和GA水平来维持SAM的大小,SlTPL3-SlWUS模块的改变引起SAM的增大,多心室形成。该结果发表在Journal of Integrative Plant Biology植物学杂志上,具有重要的理论价值。此外,我们通过酵母文库筛选、LCI技术筛选到了SlTPL3新的互作转录因子SlAGL66b,该基因的CRISPR/Cas9基因敲除植株也产生多心室番茄,同时,SlAGL66b与组蛋白去乙酰化酶SlHDA1、SlHDA3、组蛋白甲基化修饰酶SlLHP1A、SlLHP1B互作,并获得了T0代的SlLHP1A/B基因编辑植株,说明SlTPL3-SlAGL66b可能介导组蛋白的修饰影响番茄心室数量,为后续心室数量形成的表观遗传机制研究奠定了很好基础。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The SlHB8 acts as a negative regulator in tapetum development and pollen wall formation in Tomato.
SlHB8 在番茄绒毡层发育和花粉壁形成中充当负调节因子
  • DOI:
    10.1093/hr/uhac185
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Horticulture research
  • 影响因子:
    8.7
  • 作者:
  • 通讯作者:
Knockout of Auxin Response Factor SlARF4 Improves Tomato Resistance to Water Deficit.
敲除生长素反应因子 SlARF4 可提高番茄对缺水的抵抗力
  • DOI:
    10.3390/ijms22073347
  • 发表时间:
    2021-03-25
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Chen M;Zhu X;Liu X;Wu C;Yu C;Hu G;Chen L;Chen R;Bouzayen M;Zouine M;Hao Y
  • 通讯作者:
    Hao Y
The SlTPL3–SlWUS module regulates multi‐locule formation in tomato by modulating auxin and gibberellin levels in the shoot apical meristem
SlTPL3-SlWUS 模块通过调节茎尖分生组织中的生长素和赤霉素水平来调节番茄中的多室形成
  • DOI:
    10.1111/jipb.13347
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Journal of Integrative Plant Biology
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Shiwei Song;Binbin Huang;Zanlin Pan;Qiuxiang Zhong;Yinghua Yang;Da Chen;Lisha Zhu;Guojian Hu;Mi He;WU Caiyu;Mohamed Zouine;Riyuan Chen;Mondher Bouzayen;Yanwei Hao
  • 通讯作者:
    Yanwei Hao
SlTPL1 Silencing Induces Facultative Parthenocarpy in Tomato.
SlTPL1 沉默诱导番茄兼性单性结实
  • DOI:
    10.3389/fpls.2021.672232
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    He M;Song S;Zhu X;Lin Y;Pan Z;Chen L;Chen D;Hu G;Huang B;Chen M;Wu C;Chen R;Bouzayen M;Zouine M;Hao Y
  • 通讯作者:
    Hao Y
The SlHB8 Acts as a Negative Regulator in Stem Development and Lignin Biosynthesis.
SlHB8 在茎发育和木质素生物合成中充当负调节剂
  • DOI:
    10.3390/ijms222413343
  • 发表时间:
    2021-12-12
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Liu X;Wu C;Su D;Yang Y;Xian Z;Yu C;Li Z;Hao Y;Chen R
  • 通讯作者:
    Chen R

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其他文献

基于MCT4/CD147探讨四君子汤加减改善酸性微环境逆转胃癌前病变的效应机
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    2021
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  • 作者:
    喻俊榕;郝彦伟;程敬;王钧冬;陈玉;曾进浩;张怡
  • 通讯作者:
    张怡
基于“凡土脏取决于胆”刍议从胆论治阿尔茨海默病
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭静;王智超;吴雨潇;谢沛俊;郝彦伟;喻俊榕;李斌
  • 通讯作者:
    李斌
基于MCT4/CD147探讨四君子汤加减改善酸性微环境逆转胃癌前病变的效应机制
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    10.13422/j.cnki.syfjx.20210223
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    喻俊榕;郝彦伟;程敬;王钧冬;陈玉;曾进浩;张怡
  • 通讯作者:
    张怡

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郝彦伟的其他基金

SlAGL66-SlTPL1介导组蛋白修饰调控番茄兼性单性结实形成的分子机制
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    32372716
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
SlHB8基因调控番茄单性结实形成的分子机制研究
  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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