酵母细胞囊泡形成复合体的结构生物学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370732
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

As the primary eukaryotic organelles substances transfer mechanism, vesicle trafficking plays an irreplaceable important role in eukaryotic life processes. The applicant and his research group always focused on the structure studies on the eukaryotic vesicle trafficking, in particular, the newborn vesicle formation, and has got a number of important research progress of it.The applicant hopes to get the financial support from the National Natural Science Foundation of China, and further studies the whole process of vesicle formation, such as the structure of the late endosome vesicle formation complex : ENT3-VTI1-PEP12-SYN8- GGA2. The interaction information obout above complex would be helpful for clarifying the mechanism for this Cargo-Complex Containing newborn vesicle formation process.
囊泡运输作为真核生物细胞器间的主要物质传递方式,在真核生物生命过程中发挥着不可替代的重要作用。申请人及所领导的研究组拟在国家自然科学基金的经费支持下,以完整囊泡形成体系为研究对象,尝试解析酵母细胞中以货物蛋白复合体VTI1-PEP12-SYN8为核心,以ENT3蛋白为质膜-货物接头蛋白、以GGA2为货物-Clathrin接头蛋白的新生囊泡复合物三维结构,揭示上述复合物中存在的蛋白质-蛋白质及蛋白质-质膜相互作用关系;结合生物化学及细胞生物学技术手段阐明上述复合物及各功能组件的具体功能及分子机制;阐明酵母细胞该复杂货物蛋白运输囊泡形成机制。

结项摘要

囊泡运输作为真核生物细胞器间的主要物质传递方式,在真核生物生命过程中发挥着不可替代的重要作用。在项目执行期间,我们以酵母囊泡转运过程中货物蛋白复合体VTI1-PEP12-SYN8 为核心,完成了VTI1、PEP12、SYN8、ENT3、GGA2 五种蛋白蛋白的克隆、表达及相互作用关系研究,实现了多种亚复合物的体外组装及晶体学研究。同时我们还完成了GGA1蛋白的VHS、GAT和GAE结构域、ENT5_[A/E]NTH结构域的结构与功能关系研究,为深入理解酵母细胞复杂货物蛋白运输囊泡形成机制提供了重要的生物化学和结构生物学证据。项目执行期间,共发表标注有资助号的SCI研究论文18篇,培养了5名博士,较好的完成了预定研究目标。

项目成果

期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural analysis of Dis3l2, an exosome-independent exonuclease from Schizosaccharomyces pombe
Dis3l2(一种来自粟酒裂殖酵母的外泌体独立核酸外切酶)的结构分析。
  • DOI:
    10.1107/s1399004715005805
  • 发表时间:
    2015-06-01
  • 期刊:
    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Lv, Hui;Zhu, Yuwei;Li, Xu
  • 通讯作者:
    Li, Xu
Crystal and EM structures of human phosphoribosyl pyrophosphate synthase I (PRS1) provide novel insights into the disease-associated mutations.
人磷酸核糖焦磷酸合酶 I (PRS1) 的晶体和电镜结构为疾病相关突变提供了新的见解。
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0120304
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Chen P;Liu Z;Wang X;Peng J;Sun Q;Li J;Wang M;Niu L;Zhang Z;Cai G;Teng M;Li X
  • 通讯作者:
    Li X
The multiple nucleotide-divalent cation binding modes of Saccharomyces cerevisiae CK2 alpha indicate a possible co-substrate hydrolysis product (ADP/GDP) release pathway
酿酒酵母 CK2 α 的多种核苷酸-二价阳离子结合模式表明可能的共底物水解产物 (ADP/GDP) 释放途径
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu, Huihui;Wang, Hong;Teng, Maikun;Li, Xu
  • 通讯作者:
    Li, Xu
Structure of Rot, a global regulator of virulence genes in Staphylococcus aureus.
Rot 的结构,金黄色葡萄球菌毒力基因的全局调节因子。
  • DOI:
    10.1107/s1399004714015326
  • 发表时间:
    2014-09
  • 期刊:
    Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiang, Xuguang;Niu, Liwen;Teng, Maikun;Li, Xu
  • 通讯作者:
    Li, Xu
The crystal structure of the Hsp90 co-chaperone Cpr7 from Saccharomyces cerevisiae
酿酒酵母 Hsp90 共伴侣 Cpr7 的晶体结构
  • DOI:
    10.1016/j.jsb.2017.02.002
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Structural Biology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Qiu Yu;Ge Qiangqiang;Wang Mingxing;Lv Hui;Ebrahimi Mohammad;Niu Liwen;Teng Maikun;Li Xu
  • 通讯作者:
    Li Xu

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其他文献

hPRS1蛋白酶的同步辐射真空紫外圆二色光谱研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
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    --
  • 作者:
    程兵兵;罗昭锋;滕脉坤;韦世强;彭晓晖;张国斌;刘洪林
  • 通讯作者:
    刘洪林
Structure-based de novo prediction of zinc-binding sites in proteins of unknown function
基于结构的未知功能蛋白质中锌结合位点的从头预测
  • DOI:
    10.1093/bioinformatics/btr133
  • 发表时间:
    2011-05
  • 期刊:
    Evolutionary Bioinformatics
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    赵伟;徐蒙;梁治;丁博;牛立文;刘海燕;滕脉坤
  • 通讯作者:
    滕脉坤

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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