环状样RNA竞争内源性msRNAs调控变异链球菌胞外多糖 代谢和致龋性的作用及其机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81800964
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1503.牙体牙髓及根尖周组织疾病
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Exopolysaccharides play the crucial role in dental plaque cariogenic pathogenicity. Streptococcus mutans msRNA (microRNA- size small RNAs) which bind to the 5’ UTR region and results in inhibition of vicR transcription. This process could reduce the caries of dental plaque by interfering with the bacterial extracellular polysaccharide metabolism and biofilm phenotype construction. Based on the previous S. mutans noncoding RNAs research, the applicant approved for the first time: circular like RNAs exist in S. mutans which has the specific binding sites to msRNAs. However, the biological characteristics and effects of bacterial circular like RNAs as well as the relationship with msRNAs have been poorly understood. Therefore, the applicant hereby put forward the new hypothesis: the circular like RNAs could compete with endogenous msRNA which regulates the polysaccharides metabolism and dental plaque cariogenic pathogenicity. In order to verify the hypothesis, second-generation sequencing, structural analysis and co-immunoprecipitation techniques would be applied in this project. The goal of this study was to define: the biological characteristics of S. mutans circular like RNAs; the mechanism of circular like RNAs competing with endogenous msRNAs; compete with endogenous msRNAs; the circular like RNAs compete with endogenous msRNAs which regulates the polysaccharides metabolism and dental plaque cariogenic pathogenicity. This project would provide a new perspective for the post-transcriptional control of S. mutans non-coding RNAs. Furthermore, new anti-caries measures would be developed to achieve the effective prevention and treatment of dental caries.
胞外多糖是牙菌斑生物膜致龋的重要毒力因子。变异链球菌msRNAs抑制必需转录因子vicR转录,干预胞外多糖合成从而降低牙菌斑生物膜致龋性。申请人新发现和筛选到与变异链球菌msRNAs有特异性结合位点的环状样RNA。然而,细菌中环状样RNA的生物学功能及其与msRNAs的相互关系、效应、机制等均未见报道。据此,申请人提出环状样RNA可竞争内源性msRNAs从而调控变异链球菌胞外多糖代谢和致龋性的科学假说。本项目拟通过序列测定、结构分析、环状样RNA干扰与过表达、免疫共沉淀等技术:①探讨环状样RNA生物学功能及其竞争内源性msRNAs效应和机制;②阐明环状样RNA竞争内源性msRNAs调控胞外多糖代谢的分子机制;③解析环状样RNA在变异链球菌中调控致龋性强弱的效应。环状样RNA研究为变异链球菌非编码RNA调控提供新视角,为实现龋病的有效防治及新的防龋措施转化提供理论依据。

结项摘要

龋病属于微生物生态失衡性疾病,它的发生与牙菌斑生物膜沉积密切相关。变异链球菌是主要致龋菌,龋病的发生发展与细菌胞外多糖(葡聚糖)合成密切相关。变异链球菌msRNAs抑制必需转录因子vicR基因转录,干预胞外多糖合成从而降低牙菌斑生物膜致龋性。本项目在变异链球菌转录后调控层面,新发现和筛选到与变异链球菌msRNAs有特异性结合位点的环状样RNA,发现环状样RNA可差异性调控变异链球菌胞外多糖代谢,借助最主要的糖代谢通路vicRKX及其下游的rnc基因为影响因素,探讨变异链球菌环状样RNA生物学功能及其调控胞外多糖代谢的分子机制,研究发现:①环状样RNA分子circ4/6/7/8在添加蔗糖的培养条件下表达显著差异;②借助RNA近端连接技术验证vicR 5’UTR与msRNA1657的结合,免疫共沉淀技术验证ASvicR与msRNA1657的特异性结合;③变异链球菌环状样RNA circ 6/7对生物膜表型呈现差异性的调控效应;④过表达ASvicR显著抑制大鼠龋病发生。本课题较好地完成了研究任务,研究内容为变异链球菌非编码RNA调控提供新视角,为实现龋病的有效防治及新的防龋措施转化提供理论依据。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
变异链球菌vicK基因调控vicR反义RNA影响胞外多糖代谢
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    临床口腔医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卓妮娅;邓雅兰;雷蕾;杨英明;胡涛
  • 通讯作者:
    胡涛
Quantitative acetylome analysis reveals involvement of glucosyltransferase acetylation in Streptococcus mutans biofilm formation
定量乙酰组分析揭示了葡萄糖基转移酶乙酰化参与变形链球菌生物膜形成。
  • DOI:
    10.1111/1758-2229.12907
  • 发表时间:
    2020-11-24
  • 期刊:
    ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Lei, Lei;Zeng, Jumei;Li, Yuqing
  • 通讯作者:
    Li, Yuqing
Carbohydrate Metabolism Regulated by Antisense vicR RNA in Cariogenicity
致龋性中反义 vicR RNA 调节碳水化合物代谢
  • DOI:
    10.1177/0022034519890570
  • 发表时间:
    2019-12-10
  • 期刊:
    JOURNAL OF DENTAL RESEARCH
  • 影响因子:
    7.6
  • 作者:
    Lei, L.;Zhang, B.;Hu, T.
  • 通讯作者:
    Hu, T.
The VicRK Two-Component System Regulates Streptococcus mutans Virulence
VicRK 双组分系统调节变形链球菌毒力
  • DOI:
    10.21775/cimb.032.167
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    CURRENT ISSUES IN MOLECULAR BIOLOGY
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Lei, Lei;Long, Li;Li, Yuqing
  • 通讯作者:
    Li, Yuqing
Sucrose selectively regulates Streptococcus mutans polysaccharide by GcrR.
蔗糖通过 GcrR 选择性调节变形链球菌多糖。
  • DOI:
    10.1111/1462-2920.15887
  • 发表时间:
    2022-01
  • 期刊:
    Environmental Microbiology
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Zhang Hongyu;Xia Mengying;Zhang Bin;Zhang Yue;Chen Hong;Deng Yalan;Yang Yingming;Lei Lei;Hu Tao
  • 通讯作者:
    Hu Tao

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AIE-active florescent polymers: The design, synthesis and the cell imaging application
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  • 发表时间:
    2017-12
  • 期刊:
    Polymer
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    雷蕾;马恒昌;秦艳芳;杨满义;马钰程;王涛;杨媛;雷自强;路德待;关晓琳
  • 通讯作者:
    关晓琳
镀锌钢-铝锂合金点焊接头的超声成像及力学性能分析
  • DOI:
    10.14158/j.cnki.1001-3814.2016.15.048
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    雷蕾;何晓聪;高爱凤;张龙
  • 通讯作者:
    张龙
Vav-Cre介导的YFP报告基因系统标记小鼠NK细胞的特异性和效率检测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    天津医药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    雷蕾;尹洁;王玺;张玲
  • 通讯作者:
    张玲
奥贝胆酸对2型糖尿病KKAy小鼠的糖脂稳态影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国新药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曹慧;环奕;李彩娜;刘率男;刘泉;孙素娟;雷蕾;申竹芳
  • 通讯作者:
    申竹芳
泡沫镍夹层在压印-粘接复合连接十字接头中应用的可行性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    塑性工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    初明明;何晓聪;雷蕾;张杰
  • 通讯作者:
    张杰

其他文献

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变异链球菌反义vicR RNA内源性转录调控机制干预胞外多糖代谢及致龋性的研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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