嗜热菌Thermus thermophilus HB8铁硫簇SUF合成途径的研究

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基本信息

  • 批准号:
    31070067
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    33.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

铁硫簇广泛分布于古细菌、细菌、真核生物中,参与电子传递、酶活的调控等重要生物功能。铁硫簇生物合成途径至少有三个系统NIF、ISC和SUF,都由脱硫酶催化半胱氨酸脱-SH提供硫原子,由铁载体提供铁原子,在骨架蛋白(scaffold)上进行组装并将铁硫簇转移到受体蛋白的脱辅基蛋白(Apo-protein)上形成全蛋白(Holo-protein)后行使生理功能。嗜热菌Thermus thermophilus HB8中存在较为完整的SUF体系,是进行铁硫簇SUF合成途径研究的很好材料,而且嗜热菌蛋白具有热稳定性,有利于体外蛋白纯化及晶体生长。本项目意在结合嗜热菌蛋白特性,在体外研究SUF系统中尚未解决的问题,几种可能的骨架蛋白的结构与作用机理以及在铁硫簇组装过程中涉及的蛋白质的相互作用所形成的蛋白复合体的结构和功能的探讨。为下一步系统性了解SUF系统的作用机理奠定基础。

结项摘要

铁硫簇是一种古老且很重要的无机辅因子,广泛存在于各种基础生命活动中,在细胞的生物学过程中起着重要的作用,可参与电子传递和基因调节等过程。现已发现细菌中主要铁硫簇合成途径有三种类型,即为ISC,NIF和SUF系统。ISC系统由iscSUA-hscBA-fdx基因串编码,合成的是一类“管家”蛋白,适于在正常条件下表达。NIF系统由nifSU基因编码,适于固氮酶(厌氧条件下起作用)铁硫簇的合成。SUF系统由基因串sufABCDSE编码,常在恶劣环境如氧化应激和铁饥饿条件下表达。但是在Thermus thermophiles HB8 中存在较为完整的而且唯一的SUF体系,是进行铁硫簇SUF合成途径研究的很好材料。SUF途径主要包括sufABCDSE这样一个基因簇,分别编码SufA、SufB、SufC、SufD、SufS和SufE这六种蛋白。.本课题以Thermus thermophiles HB8全基因组为模板,通过PCR技术,分别获得sufA、sufB、sufC、sufD、sufS、sufE基因,并成功将目的基因分别连接到表达载体pET28a(+)和pGEX-6P-1上,构建重组质粒。重组质粒转化E.coli BL21后,获得大量表达,通过亲和层析与蛋白凝胶过滤层析等方法将其分别纯化。并通过共表达和共转化等方法成功表达复合体SufBC、SufCD、SufBCD蛋白。.对蛋白的功能研究表明:SufS具有半胱氨酸脱硫酶活性,SufE没有脱硫酶活性,但SufE存在会使SufS活性增强,摸索体外重组的条件发现在60 ℃孵育1.0-2.5 h效果比较好,其活性是单体SufS的2倍左右;SufC蛋白具有ATP水解酶活性,使用一个三偶联的方法测定SufC ATPase活性。 SufC可以与SufB,SufD相互作用形成复合体SufBC,SufCD,SufBCD。这些复合体的形成均可以提高SufC ATPase活性。同时在复合体SufBCD 存在时,SufS半胱氨酸脱硫酶的活性也被提高。.体外重组实验表明:SufS与SufE可在体外重组为复合体,但是通过非共价键连接的,暂时的,不利于复合体的获取。而通过交联剂Mts-Atf-Biotin使SufS与SufE共价交联后,不仅复合体SufSE稳定性增加,而且半胱氨酸脱硫酶的活性亦大大增加,此时SufSE酶活性是单体的6倍左右,活性可持续72小

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
嗜热菌HB8 Fe-S簇生物合成相关酶SufS与SufE重组酶的体外复合体(系)功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国生物化学与分子生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘晓晴
  • 通讯作者:
    刘晓晴
Identification of a brevianamide F reverse prenyltransferase BrePT from Aspergillus versicolor with a broad substrate specificity towards tryptophan-containing cyclic dipeptides
鉴定来自杂色曲霉的 brevianamide F 反向异戊二烯基转移酶 BrePT,对含色氨酸的环状二肽具有广泛的底物特异性
  • DOI:
    10.1007/s00253-012-4130-0
  • 发表时间:
    2013-02
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Yin, Suqin;Yu, Xia;Wang, Qing;Liu, Xiao-Qing;Li, Shu-Ming
  • 通讯作者:
    Li, Shu-Ming
嗜热菌铁硫簇合成途径中SufB、SufC和SufD蛋白的表达、纯化及其功能初步研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    首都师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王妮莎;张宗棋;刘晓晴
  • 通讯作者:
    刘晓晴
嗜热菌Thermus thermophilus HB8铁硫簇合成途径中IscA和IscU蛋白的表达、纯化和功能研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    首都师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘晓晴
  • 通讯作者:
    刘晓晴
The SufBCD protein complex is the scaffold for ironsulfur cluster assembly in Thermus thermophiles HB8
SufBCD 蛋白复合物是铁的支架
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biochemical and Biophysical Research Communications
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Xiao-Qing Liu
  • 通讯作者:
    Xiao-Qing Liu

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  • 影响因子:
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  • 作者:
    温志刚;刘晓晴;范阳;邹俊伟;黎羴
  • 通讯作者:
    黎羴

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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