多倍体荠菜的起源研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470331
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    90.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0202.植物系统发生与进化
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Polyploidy plays an important role in the evolution and diversification of plants. There are many economically important plants are polyploid as well, such as wheat, cotton, and kiwi fruit. Evolution and orgin of polyploidy is a fundamentally important question since the beginning of last century. Capsella bursa-pastoris (Brassicaceae), relative of Arabidopsis thaliana, is a typical polyploid species with worldwide distriution and one of the most successful plants on the earth. Despite many studies about its origin, it is ambiguous about its origin so far. In this study, we want to clarify the origin of this polyploid species via sequence data and coalencence method. At the same time, this will provide solid foundation for the understanding of adaptation of this successful polyploid species.
植物中很多物种都是多倍体,包括许多重要的经济作物,如小麦、棉花、猕猴桃等。对多倍体植物的进化及起源的研究是进化生物学长期以来非常关注的核心科学问题,无论在理论上还是实践中都具有重大的研究价值。十字花科的荠菜是个典型的四倍体植物,同时也是拟南芥的近缘种,荠菜是世界上最成功的物种之一。对该物种的起源有许多研究,但截止目前,对于其起源历史仍不清楚。本研究拟通过大尺度的居群采样,利用分子标记及基因组数据并通过模拟分析的方法来揭示四倍体荠菜的起源历史。同时通过本研究为进一步地探讨四倍体荠菜是如何能够成为最成功的物种提供基本数据;为探讨多倍体植物的起源及进化提供关键的理论基础及具体实证。

结项摘要

植物界许多植物是多倍体,包括很多重要的作物,如小麦、棉花、猕猴桃等。多倍体的起源研究是进化生物学关注的核心科学问题,无论在理论还是实践上都具有重大的研究价值。本研究利用荠菜作为模式来研究多倍体植物的起源及进化机制,荠菜是世界上最成功物种之一,是拟南芥的近缘种。首先,揭示了荠菜是由两个二倍体亲本杂交后加倍形成的异源四倍体;其次,发现荠菜起源于20万年前的中亚地区;最后,揭示荠菜之所以适应力强分布范围广与其获得二倍体亲本来的杂交渐渗密切相关。本研究的结果对于理解多倍体的起源及进化机制具有重大理论意义,同时相关研究成果也能促进育种实践。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Adaptation of Arabidopsis thaliana to the Yangtze River basin.
拟南芥对长江流域的适应
  • DOI:
    10.1186/s13059-017-1378-9
  • 发表时间:
    2017-12-28
  • 期刊:
    Genome biology
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Zou YP;Hou XH;Wu Q;Chen JF;Li ZW;Han TS;Niu XM;Yang L;Xu YC;Zhang J;Zhang FM;Tan D;Tian Z;Gu H;Guo YL
  • 通讯作者:
    Guo YL
Transposable Elements Contribute to the Adaptation of Arabidopsis thaliana.
转座因子有助于拟南芥的适应
  • DOI:
    10.1093/gbe/evy171
  • 发表时间:
    2018-08-01
  • 期刊:
    Genome biology and evolution
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Li ZW;Hou XH;Chen JF;Xu YC;Wu Q;González J;Guo YL
  • 通讯作者:
    Guo YL
Parallel Evolution of Common Allelic Variants Confers Flowering Diversity in Capsella rubella
常见等位基因变异的平行进化赋予荠菜开花多样性
  • DOI:
    10.1105/tpc.18.00124
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Plant Cell
  • 影响因子:
    11.6
  • 作者:
    Yang Li;Wang Hui Na;Hou Xing Hui;Zou Yu Pan;Han Ting Shen;Niu Xiao Min;Zhang Jie;Zhao Zhong;Todesco Marco;Balasubramanian Sureshkumar;Guo Ya Long
  • 通讯作者:
    Guo Ya Long
On the Origin of De Novo Genes in Arabidopsis thaliana Populations.
拟南芥种群 De Novo 基因的起源
  • DOI:
    10.1093/gbe/evw164
  • 发表时间:
    2016-08-03
  • 期刊:
    Genome biology and evolution
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Li ZW;Chen X;Wu Q;Hagmann J;Han TS;Zou YP;Ge S;Guo YL
  • 通讯作者:
    Guo YL
Long-term balancing selection contributes to adaptation in Arabidopsis and its relatives.
长期平衡选择有助于拟南芥及其近缘植物的适应
  • DOI:
    10.1186/s13059-017-1342-8
  • 发表时间:
    2017-11-15
  • 期刊:
    Genome biology
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Wu Q;Han TS;Chen X;Chen JF;Zou YP;Li ZW;Xu YC;Guo YL
  • 通讯作者:
    Guo YL

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拟南芥及其近缘种的适应性进化研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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  • 作者:
    郭亚龙
  • 通讯作者:
    郭亚龙
基于透明质酸构建的功能材料及其在生物医药领域中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    功能高分子学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱益锐;蔡志祥;郭亚龙;张洪斌
  • 通讯作者:
    张洪斌

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植物适应性进化
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  • 批准年份:
    2019
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多倍体基因组变异机制及其适应性的研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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