中国肥胖儿童16p11.2基因组失衡热点的检测及临床与分子机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81000346
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    余永国
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    H0709.能量代谢调节异常与肥胖
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

虽然日益增多的儿童肥胖与环境因素密切相关,但大量证据表明儿童肥胖具有高度遗传性.人类染色体16p11.2区域呈高度拷贝数多态性。16p11.2两个相邻区域chr16:29.5-30.1Mb 和chr16:28.73-28.95 Mb的拷贝数变异（CNV）与孤独症、智力落后密切相关。课题负责人在分析美国孤独症儿童资料时发现这两个基因组失衡热点CNV与肥胖亦密切相关。本研究首先通过新一代多重连接探针扩增(MLPA)技术检测上述二个失衡热点CNV在500例中国肥胖儿童中的分布，同时通过收集完整的临床资料研究其饮食行为/能量平衡/代谢水平等临床病理机制；然后通过Affymetrix公司基因芯片进行全基因组基因转录表达研究，分析这两个区域共计包含51个基因在有/无CNV的肥胖儿童和正常体重儿童基因表达差异；最后使用通路分析软件（IPA）分析表达差异基因所涉及的信号传导通路，试图发现新的肥胖相关基因。

结项摘要

16p11.2区域拷贝数变异(Chr16:29.5-30.1Mb)是已知的儿童智力落后、孤独症的致病热点，但是否会导致儿童肥胖并不是很清楚。本研究通过基因芯片和MLPA技术检测中国智力落后和孤独症儿童发现28例上述失衡热点，进一步通过临床表型和基因型的关联分析发现:18例16p11.2缺失的儿童13例有肥胖表型；10例16p11.2的重复有早发型肥胖表型2例(<5岁)，有意思的是临床表型有性别依赖性，男性儿童肥胖症状更明显(J Genet Genomics. 2011;38(9): 403-9)；而且进一步机制研究发现16p11.2的缺失还会导致小头畸形，重复导致头围增加，有剂量依赖性(Nature.2011;478(7367):97-102)。.Chr16:29.5-30.1Mb区域一共包含40个基因，根据通路分析发现SH2B1最可能是肥胖的候选基因，筛选338例中国汉人肥胖儿童和221例完全匹配的正常儿童对照，SH2B1全基因测序发现肥胖儿童的SH2B1四个可能致病性变异，有趣的是进一步筛查FTO全基因变异发现SH2B1和FTO有协同共作用(PLOS One.2013;8(6):e67039)。.中国汉人肥胖儿童SH2B1其中一个变异为L293R，是磷酸化位点之一，推测SH2B1的磷酸化可能是儿童肥胖的原因机制之一，需要进一步功能验证。.本研究完成了项目计划书的所有内容，完全利用本项目资金发表相关SCI论文4篇，标注该基金资助SCI论文6篇，统计源核心期刊论文1篇，并有了进一步发现可以深入研究,出色的完成了课题任务。

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Exome and Whole-Genome Sequencing as Clinical Tests: A Transformative Practice in Molecular Diagnostics
外显子组和全基因组测序作为临床测试：分子诊断的变革性实践。
  • DOI：
    10.1373/clinchem.2012.193128
  • 发表时间：
    2012-11-01
  • 期刊：
    CLINICAL CHEMISTRY
  • 影响因子：
    9.3
  • 作者：
    Yu, Yongguo;Wu, Bai-lin;Shen, Yiping
  • 通讯作者：
    Shen, Yiping
Screening for coding variants in FTO and SH2B1 genes in Chinese patients with obesity.
中国肥胖患者 FTO 和 SH2B1 基因编码变异的筛选
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0067039
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Zheng Z;Hong L;Huang X;Yang P;Li J;Ding Y;Yao RE;Geng J;Shen Y;Shen Y;Fu Q;Yu Y
  • 通讯作者：
    Yu Y
The Fas/Fas ligand death receptor pathway contributes to phenylalanine-induced apoptosis in cortical neurons.
Fas/Fas 配体死亡受体途径有助于苯丙氨酸诱导皮质神经元细胞凋亡
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0071553
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Huang X;Lu Z;Lv Z;Yu T;Yang P;Shen Y;Ding Y;Fu D;Zhang X;Fu Q;Yu Y
  • 通讯作者：
    Yu Y

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其他文献

高通量测序技术在智力障碍/全面发育迟缓中的临床应用
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.1009-8158.2019.02.003
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中华检验医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孙昱;傅启华;余永国
  • 通讯作者：
    余永国
硫胺素二硫化物类脑靶向药物载体的设计与合成
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    华西药学杂志
  • 影响因子：
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  • 作者：
    姚念;樊维;余永国;吴勇
  • 通讯作者：
    吴勇

其他文献

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CCNK基因变异通过调控组蛋白H4多巴胺修饰导致神经分化障碍的分子机制研究
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相似海外基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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