组蛋白去乙酰化酶HDA15与bHLH类转录因子相互作用的生物学功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31301056
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Histone deacetylases play an important role in regulation of gene expression during plant growth and development. Currently, the interacting proteins, component and direct target genes of HDACs are still unknown. In our previous studies, we showed that HDA15, an RPD3/HDA1-type HDAC, interacts with bHLH protein PIF3 in repression of chlorophyll biosynthesis in Arabidopsis. Furthermore, HDA15 can also interact with PIF1 and bHLH147. In this study, we will go on screening and confirming the HDA15-interacting bHLH proteins. Next, we will study the development pathways co-regulated by HDA15 and bHLHs. Furthermore, we will study the component of HDA15 protein complexes and detect direct target genes of HDA15 in Arabidopsis. Based on the work above, we will try to clarify the biological function mediated by HDA15-bHLHs interaction and the epigenetic mechanisms in regulation of plant growth and development.
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)介导的组蛋白修饰作为基因转录调控的重要方式而广泛参与到植物生长与发育途径。目前,对HDACs在基因转录调控中相互作用的转录因子、蛋白质复合体的组成及调控的靶基因网络的尚不清楚。本项目前期研究表明,拟南芥RPD3/HDA1型组蛋白去乙酰化酶HDA15与bHLH类转录因子PIF3相互作用,并共同参与抑制叶绿素的生物合成;HDA15与其它bHLH类蛋白PIF1和bHLH147也能发生互作。本项目拟在此基础上,继续筛选和验证与HDA15互作的bHLHs蛋白;分析HDA15与bHLHs互作共同调控的生物学过程;分析HDA15蛋白质复合体组成及调控的靶基因网络。以期揭示HDA15与bHLHs转录因子相互作用的生物学功能,阐明植物生长与发育过程中的表观遗传调控机制。

结项摘要

组蛋白去乙酰化修饰作为基因表达调控的重要方式广泛的参与到植物生长发育途径。本项目中,我们筛选了组蛋白去乙酰化酶HDA15互作的bHLH转录因子,分析了HDA15与互作的bHLH蛋白共同调控的基因网络和生物学过程。研究结果表明,在拟南芥中超表达HDA15抑制光调控的种子萌发,而缺失hda15突变则促进光调控的种子萌发过程。研究发现,HDA15与光信号转导途径中的重要转录因子PIF1在体内和体外发生直接的相互作用。全基因组表达分析显示HDA15和PIF1共同抑制萌发期种子中细胞壁代谢和生长素信号相关基因的表达。PIF1和HDA15在黑暗中共同结合到下游基因启动子的G-box区域,通过降低这些基因的乙酰化修饰水平,从而抑制其表达。本研究揭示了光调控植物种子萌发的表观遗传调控机制,为农作物的育种提供了重要的思路。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Expression and functional analysis of the plant-specific histone deacetylase HDT701 in rice
植物特异性组蛋白脱乙酰酶HDT701在水稻中的表达及功能分析
  • DOI:
    10.3389/fpls.2014.00764
  • 发表时间:
    2015-01
  • 期刊:
    Frontiers in Plant Science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zheng, Feng;Tian, Lining;Liu, Xuncheng;Duan, Jun
  • 通讯作者:
    Duan, Jun
Arabidopsis BREVIPEDICELLUS interacts with the SWI2/SNF2 chromatin remodeling ATPase BRAHMA to regulate KNAT2 and KNAT6 expression in control of inflorescence architecture.
拟南芥 BREVIPEDICELLUS 与 SWI2/SNF2 染色质重塑 ATP 酶 BRAHMA 相互作用,调节 KNAT2 和 KNAT6 表达,控制花序结构
  • DOI:
    10.1371/journal.pgen.1005125
  • 发表时间:
    2015-03
  • 期刊:
    PLoS genetics
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Zhao M;Yang S;Chen CY;Li C;Shan W;Lu W;Cui Y;Liu X;Wu K
  • 通讯作者:
    Wu K
Transcriptional Repression by Histone Deacetylases in Plants
植物中组蛋白脱乙酰酶的转录抑制
  • DOI:
    10.1093/mp/ssu033
  • 发表时间:
    2014-05-01
  • 期刊:
    MOLECULAR PLANT
  • 影响因子:
    27.5
  • 作者:
    Liu, Xuncheng;Yang, Songguang;Wu, Keqiang
  • 通讯作者:
    Wu, Keqiang
Arabidopsis histone demethylases LDL1 and LDL2 control primary seed dormancy by regulating DELAY OF GERMINATION 1 and ABA signaling-related genes.
拟南芥组蛋白去甲基化酶 LDL1 和 LDL2 通过调节 DELAY OF GERMINATION 1 和 ABA 信号相关基因控制初级种子休眠
  • DOI:
    10.3389/fpls.2015.00159
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zhao M;Yang S;Liu X;Wu K
  • 通讯作者:
    Wu K

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    刘勋成;张美;郑枫;段俊;吴克
  • 通讯作者:
    吴克
香蕉MaDREB转录因子调控香蕉果实成熟的调控网络
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    New Phytologist
  • 影响因子:
    9.4
  • 作者:
    邝健飞;陈建业;刘勋成;韩延超;萧允艺;单伟;汤杨;吴克强;何军贤;陆旺金
  • 通讯作者:
    陆旺金

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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