古细菌aDim2p、a/eIF2和核糖体30S亚基之间相互作用分子机制的初步研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
31070659
项目类别：
面上项目
资助金额：
35.0万
负责人：
贾黾泽
依托单位：
中国科学院生物物理研究所
学科分类：
C0501.结构生物学
结题年份：
2013
批准年份：
2010
项目状态：
已结题
起止时间：
2011-01-01 至2013-12-31

项目参与者：
单骁越；魏佳；董建树；
关键词：
相互作用 a/eIF2 蛋白质翻译起始核糖体小亚基 aDim2p

项目摘要

本项目主要研究古细菌16S rRNA成熟因子aDim2p、蛋白质翻译起始因子a/eIF2和核糖体30S亚基之间相互作用的分子机制。本研究通过解析aDim2p-a/eIF2复合体的晶体结构和对a/eIF2-aDim2p-核糖体30S亚基复合体进行电镜分析，在分子水平深入研究aDim2p和a/eIF2之间以及aDim2p、a/eIF2和核糖体30S亚基之间相互作用的机制；在此基础上，通过tRNA酰化保护实验和GFP/YFP荧光指示反应等生物化学方法初步研究a/eIF2-aDim2p复合体形成对aDim2p解离和a/eIF2携带起始tRNA等过程的影响机制以及aDim2p参与古细菌蛋白质翻译起始调控过程的可能机制。本研究工作不仅将加深我们对于生物体中核糖体成熟和蛋白质翻译起始等重要生命活动过程的认识，也将为深入研究核糖体产生和蛋白质翻译两个过程之间的协调作用奠定基础和提供重要线索。

结项摘要

古细菌和真核生物在蛋白质翻译起始过程的很多方面具有很大的相似性，并且相比较要简单的多，如古细菌中包含α、β和γ 三个亚基的蛋白质翻译起始因子2 (a/eIF2) 等。另一方面，古细菌蛋白质翻译起始过程也有和细菌相同的地方，如古细菌中大量存在着SD 序列引导的mRNA等。到目前为止，古细菌中这两种蛋白质翻译起始过程的调控机制还不清楚。.更值得关注的是在古细菌中蛋白质翻译起始和核糖体小亚基成熟这两个过程存在某种程度的相互作用。蛋白激酶aRio2p 能够在体外特异地磷酸化a/eIF2α亚基N端的氨基酸Ser48。我们发现如它们在酵母中的同源蛋白Dim2p 和Rio2p一样，古细菌aDim2p 与aRio2p之间也存在直接的相互作用，并且aDim2p是结合在aRio2p N端的活性调节区域。实验结果还表明，aDim2p结合16S rRNA 3’末端RNA片断（包含SD反义核心序列）与否不影响它与a/eIF2之间的相互作用。同时我们初步验证了aDim2p-a/eIF2-核糖体30S小亚基复合体形成的可能性。.本项目希望通过对古细菌aDim2p-a/eIF2复合体以及aDim2p-a/eIF2-30S小亚基复合体的空间结构研究，分析古细菌aDim2p、a/eIF2和核糖体小亚基之间相互作用的分子机制，并对aDim2p因子在古细菌蛋白质翻译起始过程中可能行使的生物学功能进行探讨。

项目成果

期刊论文数量（2）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

FUS-NLS/Transportin 1 complex structure provides insights into the nuclear targeting mechanism of FUS and the implications in ALS.

FUS-NLS/Transportin 1 复杂结构深入了解 FUS 的核靶向机制及其对 ALS 的影响

DOI：
10.1371/journal.pone.0047056
发表时间：
2012
期刊：
PloS one
影响因子：
3.7
作者：
Niu C;Zhang J;Gao F;Yang L;Jia M;Zhu H;Gong W
通讯作者：
Gong W

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

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        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]

会员权益说明：

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