甘蓝型油菜 kelch motif ACBP4 基因克隆及其功能分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31701456
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Increasing the oil content and improving the fatty acid compositions are one of the main breeding project in Brassica napus. The acyl-coA binding proteins (ACBPs) bind acyl-coA esters and preserve the intracellular acyl-coA pool. Their significant implication in lipid metabolism, in plant development and stress response highlight their importance. In B. napus, researches on ACBPs were mainly focused on ACBP6. It would be of a great importance to analyze the function of these BnACBPs in B. napus. Thus, the aim of this project is to clone BnACBP4 and to perform the function analysis by using of overexpression and knock out techniques, and to analyze the effects of these genes on oil content and fatty acid compositions. The differentally expressed genes would be analyzed on the transgenetic materials in order to obtain the inner reasons why ACBP4 could lead to the change of oil content and fatty acid compositions.
提高含油量和改善脂肪酸组分是当前油菜育种的主要目标之一。酰基辅酶A结合蛋白(ACBPs)结合酰基辅酶A酯并维持细胞内酰基辅酶A库,它们在脂质代谢,植物发育和应激反应中都有重要意义。在模式植物拟南芥中鉴定了在大小和结构域上不同的四类ACBPs,而在甘蓝型油菜中,对ACBPs的研究主要集中在ACBP6;因此,在甘蓝型油菜中研究BnACBPs功能非常有意义。本项目拟首先从甘蓝型油菜中克隆酶BnACBP4,通过在油菜中超表达和敲除来研究该基因对油菜种子含油量和脂肪酸组分的影响;对获得的转基因株系进行转录组分析,通过研究差异表达基因参与的代谢途径而揭示ACBP4引起含油量和脂肪酸变化的原因。

结项摘要

酰基辅酶A结合蛋白(Acyl-coA binding proteins, ACBP)存在于许多物种中,并保持重要的生物学功能。在拟南芥中,发现了6个ACBP拷贝,据报道它们与多种功能有关,如膜的生物合成、脂代谢中酶活性和基因表达的调节、细胞信号传导、应激反应和抗病。ACBP4可通过蛋白质结构中存在kelch基序结构域来区分。早期研究报道其参与多种生物过程,如重金属结合。然而,之前尚未报告过ACBP4 对油脂合成的影响。作为一种能够改变种子中的油脂的胞质蛋白及其同源物ACBP6,ACBP4也可能改变种子中的含油量。甘蓝型油菜是世界第二大油料作物,与拟南芥有84%的同源性。本研究旨在分析甘蓝型油菜ACBP4 (BnACBP4)在种子性状中的作用。主要发现如下: (1) BnACBP4位于质体、内质网表面和质膜中。(2) BnACBP4基因在拟南芥中过表达,且表达水平随着胚胎发育而升高。(3)脂肪酸组成分析显示,C16:0、C18:0、C18:1、C18:2增加,转基因系的油分和蛋白含量分别增加2%和14.20%。(4)转基因成熟种子与野生型相比,长度增加7.85%,宽度增加2.51%,重量增加16.44%。(5) 差异表达基因分析表明在胚胎成熟发育后期,DEG的数目最多,而且大多数是下调表达。共鉴定出99个与种子发育相关的DEG。最显著的DEG与种子贮藏蛋白(ATS和CRUCIFERIN)和脂质转移蛋白有关。上调/下调的DEGs Log2FC倍数变化相当低,表明BnACP4可能对种子性状没有很大影响,证实了表型分析的结果。我们的研究完善了关于油菜籽粒ACBP4在种子表型中作用。尽管在转基因品系表型中检测到小幅变化,但已出现了关于其他功能的假设,今后应进行深入分析,敲除株系的表型应用于验证BnACBP4功能。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional and Structural Diversity of Acyl-coA Binding Proteins in Oil Crops.
油料作物中酰基辅酶A结合蛋白的功能和结构多样性
  • DOI:
    10.3389/fgene.2018.00182
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in genetics
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Raboanatahiry N;Wang B;Yu L;Li M
  • 通讯作者:
    Li M

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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