高性能数字体相关技术及其用于细胞与三维基底相互作用研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11002003
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A0812.实验固体力学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本项目将依托激光共聚焦显微镜三维成像技术,重点发展高性能数字体积相关方法,并用于定量研究细胞与三维基底微环境之间的物理力学相互作用。通过构建三维求和表并利用三维快速Hartley变换技术,发展高效数字体积相关整体素匹配搜索算法;根据变形前后体积图像"光流"变化特征,发展基于光流梯度的亚体素定位算法;在此基础上,引入一阶形函数表征体积微元的变形,发展基于Newton-Raphson迭代的亚体素定位算法。另一方面,以琼脂糖、胶原和荧光颗粒为基底材料,制备既适合细胞三维培养又利于共聚焦显微观测的三维"荧光散斑"基底,通过上述高性能数字体积相关技术,定量计算成纤维细胞在三维基底中迁移所引起的基底位移、应变及应力等物理力学指标,结合相关生物学实验,探索三维基底环境物理力学特性对于细胞行为和功能的影响,为细胞与三维基底相互作用的力-生化信号转导通路研究提供精确高效的测试手段和定量的物理力学实验依据。

结项摘要

本项目借助于激光共聚焦显微镜三维成像技术,发展高性能数字体积图像相关方法,定量探索研究细胞与三维基底微环境之间的物理力学相互作用。本项目结合三维快速傅里叶变换技术和三维求和表技术,发展了高效数字体积相关整体素搜索算法;在此基础上,针对亚体素图像定位搜索的特点,给出了基于“光流梯度”的亚体素定位算法和基于“牛顿-拉夫森”迭代的亚体素定位算法,并测试了这两种算法的精度和计算效率;为了测试数字体积图像相关方法的变形测量精度,本项目采用弹性力学中的Boussinesq-Cerruti积分解(解析解),构建了数字体积图像相关方法理论精度(误差)测试平台;提出了基于高斯窗函数的自适应数字图像相关方法和数字体积图像相关方法;为了实现细胞的三维培养与实时观测,本项目先后成功制备了琼脂糖-胶原-荧光弹性基底、聚乙二醇二丙烯酸水凝胶弹性基底和可光聚合的海藻酸钠水凝胶弹性基底,并运用原子力显微镜定量测量了此类基底材料的弹性模量;基于激光共聚焦显微镜系统搭建了三维细胞-基底变形实验加载装置;采用Sinc 函数(sin(π z) (π z))为重构核,使用经典的Lucy-Richardson 迭代解卷积算法对三维图像进行了复原处理,纠正了Z方向上的光学偏差,运用高性能数字体积图像相关算法,定量计算得到了实际细胞-基底三维位移场;细胞与三维弹性基底力学生物学实验探索研究表明:(肿瘤)细胞能够在上述三维基底中进行正常分裂生长,且生长速度受三维基底刚度调控;本项目也建立了细胞与弹性基底相互作用的力-化学耦合模型和细胞-基底粘附成核的统计热力学模型。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
A DIGITAL VOLUME CORRELATION TECHNIQUE FOR 3-D DEFORMATION MEASUREMENTS OF SOFT GELS
软凝胶三维变形测量的数字体积相关技术
  • DOI:
    10.1142/s1758825111001019
  • 发表时间:
    2011-06-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF APPLIED MECHANICS
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Huang, Jianyong;Pan, Xiaochang;Fang, Jing
  • 通讯作者:
    Fang, Jing
Cell adhesion nucleation regulated by substrate stiffness: A Monte Carlo study
基质硬度调节细胞粘附成核:蒙特卡罗研究
  • DOI:
    10.1016/j.jbiomech.2011.09.013
  • 发表时间:
    2012-01-03
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOMECHANICS
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Peng, Xiaoling;Huang, Jianyong;Fang, Jing
  • 通讯作者:
    Fang, Jing
Cellular Traction Force Reconstruction Based on a Self-adaptive Filtering Scheme
基于自适应滤波方案的蜂窝牵引力重建
  • DOI:
    10.1007/s12195-012-0224-0
  • 发表时间:
    2012-06-01
  • 期刊:
    CELLULAR AND MOLECULAR BIOENGINEERING
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Huang, Jianyong;Deng, Hao;Fang, Jing
  • 通讯作者:
    Fang, Jing
Digital Image Correlation with Self-Adaptive Gaussian Windows
自适应高斯窗的数字图像关联
  • DOI:
    10.1007/s11340-012-9639-8
  • 发表时间:
    2013-03-01
  • 期刊:
    EXPERIMENTAL MECHANICS
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Huang, J.;Pan, X.;Yuan, F.
  • 通讯作者:
    Yuan, F.
高分辨率细胞牵引力频域反演技术
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    医用生物力学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李姗姗;黄建永;邓昊;庞明姝;彭小玲;熊春阳;方竞
  • 通讯作者:
    方竞

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其他文献

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高通量细胞三维牵拉芯片系统及其应用研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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