弥漫大B细胞淋巴瘤多组学生物标记物研究及其在精准诊治中的临床价值探索

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81670184
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0810.淋巴瘤与淋巴细胞疾病
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is one of the most common and aggressive forms of lymphoma. It is a heterogeneous disease, and at least 2 subtypes can be distinguished by gene expression analysis: the germinal center B-cell like (GCB) and the activated B-cell like (ABC) subtypes, with the latter being characterized by an increased disease aggressiveness and poor clinical outcome In our previous studies, we have provided the first somatic mutation spectrum for DLBCL derived from Chinese patients, identified a number of novel, recurrent mutated genes in DLBCL. In this proposal, we plan to study the heterogeneity of DLBCL and to identify biomarkers of DLBCL for precision diagnosis and therapy, using the most updated next-generation sequencing technologies and a multi-omic approach. Three specific aims for this proposal: 1) using multi-omics analysis to identify the mutation landscape and heterogeneity of primary and relapsed DLBCL; 2) to identify biomarkers for the R-CHOP-based therapy in DLBCL and study the function of selected biomarkers; 3) To identify biomarkers based on muilt-omic studies that can predict beneficial effects from immunotherapies targeting the PD1/PD-L1 axis in DLBCL patients.
弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)是最常见的恶性淋巴瘤之一,其分子亚型及临床预后表现出强烈的异质性。通过二代测序及多组学分析方法来系统研究DLBCL的异质性及其临床标志物,是实现DLBCL精准治疗的根本途径。我们在前期研究中,系统地描绘了DLBCL的基因突变频谱,阐明了中国人DLBCL驱动基因高频突变的特征,并发现了DLBCL中活化诱导胞苷脱氨酶导致的超级增强子的超变异现象。在本课题中,我们将进一步系统研究DLBCL的异质性,及其在不同类型治疗中的多组学标记物,以期实现DLBCL的精准诊治。我们拟从以下三个方面展开研究:(1)原发及复发DLBCL多组学分析及异质性研究;(2)DLBCL在R-CHOP标准治疗中的多组学临床标记物鉴定及功能研究;(3)DLBCL多组学生物标记物在anti PD-1/PD-L1免疫治疗中的临床价值探索。

结项摘要

弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)的分子亚型及临床预后均表现出异质性。通过二代测序及多组学分析方法系统研究DLBCL的异质性及其临床标志物是实现DLBCL精准治疗的根本途径。我们在该研究中发现HBV阳性DLBCL患者具有年龄小,临床分期较晚,预后差等临床特征;揭示了HBV阳性DLBCL患者具有独特的基因遗传突变图谱和基因表达谱;并发现了KLF2、 ZFP36L1、 OSBPL10、VMP1、TP73、 MSL2 以及MEOX2等7个新的潜在的驱动基因;证实了HBV感染是DLBCL预后不良的一种生物标志物。我们还发现合并HBV感染的DLBCL患者更加容易对一线RCHOP治疗产生原发耐药,阐明了合并HBV感染的DLBCL对一线RCHOP治疗耐药的基因突变图谱及基因表达图谱,并发现了新的潜在的驱动基因和信号通路,揭示了HBV可能参与原发耐药的机制。我们还对HBV阳性DLBCL高频突变基因生物标志物TP73和CD70进行了研究,我们发现部分TP73突变影响其与DNA的结合能力,并影响其激活下游基因的能力;揭示了CD70与PD-1/PD-L1通路以及肿瘤浸润T细胞耗竭显著相关,并可通过联合药物治疗显著改善T细胞耗竭的情况并抑制肿瘤的生长。我们还对DLBCL/FL的体细胞突变频谱进行了分析,揭示了7个不同的突变特征,分别与年龄,APOBEC,AID等有关。我们也发现了一组新的突变特征,该突变特征和DNA聚合酶η(POLH)的活性高度相关。该研究也首次揭示了不同的淋巴瘤类型有着不同的基因突变特征,该突变特征可能与DLBCL的分型以及疾病的预后显著相关,进一步揭示不同亚型的DLBCL的可能存在着不同的起源。我们也对DLBCL的RNA编辑进行了研究,发现DLBCL中的RNA编辑水平明显高于正常的细胞,同时发现受RNA编辑影响的一些在DLBCL的发生中起到重要的作用的信号通路。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Distinct subtype distribution and somatic mutation spectrum of lymphomas in East Asia
东亚淋巴瘤的独特亚型分布和体细胞突变谱
  • DOI:
    10.1097/moh.0000000000000355
  • 发表时间:
    2017-07-01
  • 期刊:
    CURRENT OPINION IN HEMATOLOGY
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Ren, Weicheng;Li, Wei;Pan-Hammarstrom, Qiang
  • 通讯作者:
    Pan-Hammarstrom, Qiang
Genome-wide mutational signatures revealed distinct developmental paths for human B cell lymphomas.
全基因组突变特征揭示了人类 B 细胞淋巴瘤的独特发展路径
  • DOI:
    10.1084/jem.20200573
  • 发表时间:
    2021-02-01
  • 期刊:
    The Journal of experimental medicine
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ye X;Ren W;Liu D;Li X;Li W;Wang X;Meng FL;Yeap LS;Hou Y;Zhu S;Casellas R;Zhang H;Wu K;Pan-Hammarström Q
  • 通讯作者:
    Pan-Hammarström Q
Plasma soluble PD-L1 and STAT3 predict the prognosis in diffuse large B cell lymphoma patients.
血浆可溶性 PD-L1 和 STAT3 预测弥漫性大 B 细胞淋巴瘤患者的预后
  • DOI:
    10.7150/jca.47816
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Journal of Cancer
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Fei Y;Yu J;Li Y;Li L;Zhou S;Zhang T;Li L;Qiu L;Meng B;Pan Y;Ren X;Qian Z;Wang X;Zhang H
  • 通讯作者:
    Zhang H
Tumor CD73/A2aR adenosine immunosuppressive axis and tumor-infiltrating lymphocytes in diffuse large B-cell lymphoma: correlations with clinicopathological characteristics and clinical outcome
弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤CD73/A2aR腺苷免疫抑制轴和肿瘤浸润淋巴细胞:与临床病理特征和临床结果的相关性
  • DOI:
    10.1002/ijc.32144
  • 发表时间:
    2019-09-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Wang, Xianhuo;Zhang, Tingting;Zhang, Huilai
  • 通讯作者:
    Zhang, Huilai

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其他文献

PD-1/PD-L1轴与淋巴瘤
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2017.05.013
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中华微生物学和免疫学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王先火;傅凯;潘嫱;任秀宝;张会来
  • 通讯作者:
    张会来
肿瘤免疫检查点疗法与CAR-T细胞治疗及其组合治疗策略的临床运用价值
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中华微生物学与免疫学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李林玉;张婷婷;贾晓辉;孔令喆;孟斌;任秀宝;傅凯;潘嫱;王先火;张会来
  • 通讯作者:
    张会来

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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