非吸烟肺癌表皮生长因子受体基因相关非编码小RNA差异表达研究

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基本信息

  • 批准号：
    81071914
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    36.0万
  • 负责人：
    钱碧云
  • 依托单位：
    天津医科大学
  • 学科分类：
    H1826.肿瘤学研究新技术与新方法
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

针对非吸烟肺癌发病率不断上升且发病机制不同于吸烟者患肺癌的状况，特别是东亚地区非吸烟肺癌患者表皮生长因子受体基因(EGFR)的高突变率特征,根据不同的肿瘤临床病理和预后特征具有显著差异的非编码小RNA(miRNAs)表达谱的假说，本项目将在前期已运用全基因组miRNAs芯片对肺癌组织进行667个人类miRNAs表达谱检测的基础上，采用TaqMan实时荧光定量PCR方法对筛选出的EGFR突变与野生组比较表达差异最大的10个miRNAs，在420例非吸烟肺癌患者的组织和血浆样本中逐一分别开展表达验证研究，最终获得EGFR突变相关miRNAs。一方面研究其与临床病理特征和预后的关系，拟合预测模型；另一方面进行miRNAs的体外实验，探索其与EGFR及下游靶基因之间的关系，对阐明EGFR突变的分子机制，揭示中国的高突变率特征具有重要意义，也为临床个体化分子靶向治疗筛选和预后判断提供参考。

结项摘要

本项目针对非吸烟肺癌发病率不断上升且发病机制不同于吸烟者患肺癌的状况，特别是东亚地区非吸烟肺癌患者表皮生长因子受体基因(EGFR)的高突变率特征,根据不同的肿瘤临床病理和预后特征具有显著差异的非编码小RNA(miRNAs)表达谱的假说，首先采用人的全基因组miRNAs芯片检测了患者手术新鲜组织样本和匹配的血浆样本中miRNAs表达情况，采用生物信息学分析筛选出包括EGFR突变/野生型等不同特征差异表达的miRNAs，然后通过TaqMan实时定量PCR的实验技术，在130例女性非吸烟肺癌队列的组织和匹配的血浆样本中对近50个miRNAs进行了逐一验证研究，开展临床关联分析。. 我们的结果发现miR-122在女性非吸烟患者EGFR突变型和野生型的血浆中存在明显的差异表达，而且血浆中一组miRNAs的表达状态与患者的临床特征以及预后密切相关，特别是在临床晚期以及EGFR突变检测为阳性的患者当中。经数学模型方程拟合，发现采用患者血浆miR-195联合miR-122和miR-143 判断EGFR突变的肺癌患者预后的灵敏度可达到70.7%。而对肺肿瘤组织样本的研究发现，其与血浆样本中miRNAs的表达不具有统计学相关性。检测的25个miRs在癌与癌旁组织中存在明显的差异表达，且大多数呈现癌组织中低表达状态。组织miR-25、miR-183-3p等的表达或与临床分期、淋巴结转移、远处转移以及预后、EGFR突变与否等都存在密切关系。. 本项研究亦重点对miR-195等开展了靶基因预测及体外细胞学研究。通过对5个肺癌细胞株体外培养，转染miR-195的模拟物和抑制子，采用MTT实验，细胞划痕、流式细胞分析、Luciferase报告基因实验及Western-blot等体外实验技术，我们发现miR-195可直接靶CHEK1基因的3‘UTR，下调其表达，并可能同时作用于细胞周期通路上CCND1，CCNE几个基因，在肺癌的发病和预后中共同发挥作用。此外，我们的研究也发现miR-23b可通过靶SET8基因抑制肺癌细胞生长增殖、迁移和侵袭，在肺癌的发生发展中可能起一定作用。

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
EGFR突变相关miR-335靶基因预测及其功能的生物信息学分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中国肿瘤临床
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏玉亮;张寰;曲金力;钱碧云
  • 通讯作者：
    钱碧云
Meta-Analysis of the Association between Mir-196a-2 Polymorphism and Cancer Susceptibility.
Mir-196a-2 多态性与癌症易感性关联的 Meta 分析
  • DOI：
    10.3969/j.issn.2095-3941.2012.01.012
  • 发表时间：
    2012-03
  • 期刊：
    Cancer biology & medicine
  • 影响因子：
    5.5
  • 作者：
    Zhang H;Su YL;Yu H;Qian BY
  • 通讯作者：
    Qian BY
肺癌患者柯萨奇病毒和腺病毒受体的表达及其临床意义
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中国肿瘤临床
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    夏文彬;孙蕾娜;钱碧云;战忠利
  • 通讯作者：
    战忠利
Association of genetic polymorphisms in DNA repair pathway genes with non-small cell lung cancer risk
DNA修复途径基因的遗传多态性与非小细胞肺癌风险的关联
  • DOI：
    10.1016/j.lungcan.2010.11.018
  • 发表时间：
    2011-08-01
  • 期刊：
    LUNG CANCER
  • 影响因子：
    5.3
  • 作者：
    Qian, Biyun;Zhang, Huan;Chen, Kexin
  • 通讯作者：
    Chen, Kexin
Circulating microRNAs in relation to EGFR status and survival of lung adenocarcinoma in female non-smokers.
循环 MicroRNA 与女性非吸烟者肺腺癌 EGFR 状态和生存相关
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0081408
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Zhang H;Su Y;Xu F;Kong J;Yu H;Qian B
  • 通讯作者：
    Qian B

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其他文献

IGF-1和IGFBP-3基因多态性与非吸烟女性肺癌关联研究
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    --
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  • DOI：
    --
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非吸烟女性肺腺癌组织中miRNAs的表达与表皮生长因子受体关系的研究
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  • 发表时间：
    2016
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王富民;张寰;许芳秀;曲金力;孔金玉;钱碧云
  • 通讯作者：
    钱碧云

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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