绒山羊次级毛囊lncRNA参与调控毛乳头细胞诱导功能的作用及分子机理研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31672388
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1702.家畜种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The inducing function of dermal papilla cell of secondary hair follicle is significantly important in improving the cashmere yield and quality in cashmere goat, however, its regulatory mechanism is unknown. Long chain noncoding RNA (lncRNA) was found to be widely involved in various physiological processes in cells. In our previous study, 1049 differentially expressed lncRNAs were identified in dermal papilla between anagen and telogen stages in Liaoning cashmere goat by RNA-seq technique. In present study, we will predict the potential function of the differentially expressed lncRNA, and construct lncRNA-miRNA-mRNA regulatory network through combining with mRNA and miRNA high-throughput sequencing data obtained in our provious work, and further determine the critical lncRNA which might regulate the inducing function of demal papilla cell. Through constructing overexpression and shRNA interference vectors of lncRNA and transfecting to dermal papilla cell, we will reveal the regulation effects of lncRNA on the inducing function of dermal papilla cell. Further by RNA pull down, CHIRP-Seq and methylation detection methods, we will reveal the target molecules (DNA, RNA or protein) and methylation regulation in order to clarify the melocular regulatory mechanisms of lncRNA on inducing function of dermal papilla cell of secondary hair follicle in cashmere goat. The results from the present study will provide a novel scientific evidence to further improve the cashmere yield and quality in cashmere goat.
绒山羊次级毛囊毛乳头细胞诱导功能对提高山羊绒产量及品质有重要意义,但其调控机制不清楚。长链非编码RNA(lncRNA)被发现广泛参与细胞多种生理过程。前期研究中,我们从辽宁绒山羊次级毛囊生长期和休止期毛乳头中,通过RNA-seq筛选到1049个差异表达的lncRNA。本项目对这些lncRNA进行功能预测,结合前期mRNA和miRNA高通量测序数据,构建lncRNA-miRNA-mRNA 调控网络,确定出调控毛乳头细胞诱导功能的关键lncRNA,构建过表达和shRNA干扰载体,转染毛乳头细胞,揭示lncRNA 对毛乳头细胞诱导功能的调控作用;进一步通过RNA pull down、CHIRP-Seq 和甲基化检测等,分析与lncRNA结合的靶分子(DNA、RNA或蛋白质)及甲基化调控,阐明lncRNA调控绒山羊次级毛囊毛乳头细胞诱导功能的分子机理,为提高山羊绒产量及改善绒品质提供新的科学依据。

结项摘要

① 项目的背景:绒山羊次级毛囊毛乳头细胞诱导功能对山羊绒产量及品质有重要意义。项目“绒山羊次级毛囊lncRNA参与调控毛乳头细胞诱导功能的作用及分子机理研究”(31672388),起止日期:2017年1月1日-2020年12月31。.② 主要研究内容:从次级毛囊筛选差异表达lncRNAs,构建lncRNA-miRNA-mRNA网络,确定关键lncRNAs,功能获得/缺失试验揭示lncRNAs对毛乳头细胞诱导功能的调控作用;RNA pull down等解析与lncRNA结合靶分子阐明其分子调控机理。.③ 重要结果:共筛选出lncRNA-599547、lncRNA-599554、lncRNA-000133、lncRNA-H19和lncRNA-HOTAIR等22个候选lncRNAs;功能获得/缺失试验发现lncRNA-599547、lncRNA-599554和lncRNA-000133正向调控毛乳头细胞诱导功能;lncRNA-599547通过miR-15b-5p/Wnt10b 轴,lncRNA-599554吸附miR-15a-5p,上调Wnt3a表达实现其对毛乳头细胞诱导功能的调控。.④ 关键数据:lncRNA-599547、lncRNA-599554、lncRNA-000133、lncRNA-H19和lncRNA-HOTAIR等5个 lncRNA在生长期显著上调;lncRNA-H19、lncRNA-HOTAIR和lncRNA-000133启动子甲基化参与其转录。lncRNA-000133、lncRNA-599547和lncRNA-599554的功能获得/缺失试验表明均显著改变ALP等标志基因表达。RNA Pull-down 等技术分析表明与lncRNA-599547和lncRNA-599554互作的靶分子分别是miR-15b-5p和miR-15a-5p;甲基化和双荧光素酶报告试验表明lncRNA-599547和lncRNA-599554不是通过甲基化途径发挥作用,而是通过miR-15b-5p和miR-15a-5p分别靶向结合毛乳头细胞诱导功能关键基因Wnt10b和Wnt3a的mRNA 3’-UTR发挥作用。.⑤ 科学意义:项目研究结果为阐明绒山羊次级毛囊发育和生绒的分子调控机理提供新线索,也为人工调节山羊绒生长、提高山羊绒产量及改善绒品质提供新的思路和科学依据。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
LncRNA-599554 sponges miR-15a-5p to contribute inductive ability of dermal papilla cells through positive regulation of the expression of Wnt3a in cashmere goat
LncRNA-599554海绵miR-15a-5p通过正向调节绒山羊中Wnt3a的表达来贡献真皮乳头细胞的诱导能力
  • DOI:
    10.1016/j.ejbt.2020.03.002
  • 发表时间:
    2020-05
  • 期刊:
    Electronic Journal of Biotechnology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Yin Rong H.;Wang Yan R.;Zhao Su J.;Yin Rong L.;Bai Man;Wang Ze Y.;Zhu Yu B.;Cong Yu Y.;Liu Hai Y.;Bai Wen L.
  • 通讯作者:
    Bai Wen L.
LncRNA-000133 from secondary hair follicle of Cashmere goat: identification, regulatory network and its effects on inductive property of dermal papilla cells
绒山羊次生毛囊LncRNA-000133:鉴定、调控网络及其对真皮乳头细胞诱导特性的影响
  • DOI:
    10.1080/10495398.2018.1553788
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Animal Biotechnology
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zheng Yuanyuan;Wang Zeying;Zhu Yubo;Wang Wei;Bai Man;Jiao Qian;Wang Yanru;Zhao Sujun;Yin Xianbo;Guo Dan;Bai Wenlin
  • 通讯作者:
    Bai Wenlin
A IncRNA-H19 transcript from secondary hair follicle of Liaoning cashmere goat: Identification, regulatory network and expression regulated potentially by its promoter methylation
辽宁绒山羊次级毛囊的IncRNA-H19转录物:鉴定、调控网络和可能受其启动子甲基化调控的表达
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2017.10.028
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Gene
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Zhu Yu B;Wang Ze Y;Yin Rong H;Jiao Qian;Zhao Su J;Cong Yu Y;Xue Hui L;Guo Dan;Wang Shi Q;Zhu Yan X;Bai Wen L
  • 通讯作者:
    Bai Wen L
LncRNAs in Secondary Hair Follicle of Cashmere Goat: Identification, Expression, and Their Regulatory Network in Wnt Signaling Pathway
绒山羊次级毛囊中的 LncRNA:鉴定、表达及其在 Wnt 信号通路中的调控网络
  • DOI:
    10.1080/10495398.2017.1356731
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    ANIMAL BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Bai, Wen L.;Zhao, Su J.;Yin, Rong H.
  • 通讯作者:
    Yin, Rong H.
Identification and molecular analysis of a lneRNA-HOTAIR transcript from secondary hair follicle of cashmere goat reveal integrated regulatory network with the expression regulated potentially by its promoter methylation
绒山羊次级毛囊 lncRNA-HOTAIR 转录物的鉴定和分子分析揭示了整合的调控网络,其表达可能受其启动子甲基化调节
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2018.11.084
  • 发表时间:
    2019-03-10
  • 期刊:
    GENE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Jiao, Qian;Yin, Rong H.;Bai, Wen L.
  • 通讯作者:
    Bai, Wen L.

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