图表达与划分支持下的高性能矢量地理计算方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41701461
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0114.地理信息学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

High performance computing provides an effective way to deal with the growing spatial data and the high computational cost. When to efficiently process the vector geographic data in parallel, spatial decomposition plays a key role in dividing and solving the task evenly, and largely determines the task scheduling. Traditional decomposing methods, such as quad-tree partition, grid partition, etc., often use the horizontal or vertical lines to constrain the decomposing chunks, and fail to tackle some difficult issues, including the arbitrary distribution of vector objects, the diversity of the spatial associations, and the heterogeneity of the computation. With the pre-experiment, the present study will investigate the definitions of the computing elements, i.e., a new family of functions for processing the vector objects, the dependency relations, and the strength assessment of the computation. This will create a graph representation for describing the geocomputational process quantitatively. Then, a graph approach will be formed by combining the graph partitioning towards the heterogeneous environment, the sub-task computing scheme and the subsequent reduction. A further step is to design and develop a middleware prototype by way of parallel computing models. Finally, some typical algorithms will be parallelized and tested against the large scale vector data produced in the Geographic Conditions Monitoring project.
高性能计算为应对空间数据量及模型计算量的快速增长提供了有效手段。在矢量地理数据的并行处理中,空间划分是实现任务均衡分治的关键,并在很大程度上决定了任务调度的成功实施。传统的四叉树划分、规则网格划分等方法多采用水平或垂直界线来约束划分范围,缺乏对矢量对象的分布随机性、计算关联的多样性以及计算强度的非均匀性进行综合考虑。在预实验基础上,本项目将定义一组计算映射元素,包括对象操作函数、依赖关系操作函数、计算强度评估函数等,形成一种图式化表达以定量描述矢量数据的地理计算过程。然后,通过设计面向异构环境的图划分算法、子任务计算及子结果规约算法,构建高性能矢量地理计算的理论方法。进而,选取相应的并行计算模式,设计与实现中间件原型。最后,针对典型分析算法进行并行优化,并基于全国地理国情监测中的大规模矢量数据开展应用测试。

结项摘要

大数据时代,高性能计算已成为应对海量空间数据资源与复杂地理算法的必要手段。不同于易并行处理的栅格数据,矢量要素本身的数据分布偏斜特征成为决定均衡空间划分和高效任务调度的关键。传统的四叉树划分、规则格网划分等方法,由于缺乏对矢量对象的分布随机性、计算依赖关系及计算强度的综合表达,难以有效支撑各类矢量地理算法的分治优化。本项目主要从矢量地理计算任务的图式表达理论构建、多粒度均衡划分和异步重叠调度三个方面展开系统研究,研发了相应的方法和模型,实现了大规模地表覆盖转移矩阵计算系统。图式表达理论构建分别从拓扑依赖关系和距离依赖关系展开试验研究,验证了亿级规模图斑空间叠加分析和百万级规模点要素缓冲分析的可表达性。多粒度均衡划分研究主要涉及图斑级粒度(粗粒度)和节点粒度(细粒度)两方面内容,分别验证了多核CPU和众核GPU环境下不同算法的可并行性。图斑级粒度划分侧重于选用高效的分治方法,降低划分成本,进而利用多核CPU解决后续的高负载计算问题;细粒度划分则侧重于对全路径算法(All Pairs Shortest Paths,APSP)、地理加权回归算法(Geographically weighted regression,GWR)的高密集、轻量级代码片段进行识别、改造与并行调度,以显著提高整体性能。异步重叠调度以高耗时的封闭区域表面面积算法为研究对象,通过对规则划分、并行处理与属性汇总过程进行重叠,验证了该模型对百万以上规模图斑的I/O密集处理逻辑的显著优化效果。同时,项目的研究方法均基于地理国情监测中的大规模矢量数据开展应用测试,转移矩阵计算、APSP算法、表面面积算法等已在全国多个省区的推广软件中得到集成应用,取得了较为满意的成果转化效果。项目发表论文9篇,其中SCI检索6篇、EI检索2篇、中文核心1篇;项目提交发明专利4项;获得软件著作权3项;在GitHub上发布了Matrix的计算框架代码;资助赴加拿大学术交流1次,培养研究生2名,圆满完成了既定的各项考核指标。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
国土三调数据与地理国情数据融合可行性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    遥感信息
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    龚国辉;董春;亢晓琛
  • 通讯作者:
    亢晓琛
一种顾及道路复杂度的增量路网构建方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    测绘学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘纪平;张用川;徐胜华
  • 通讯作者:
    徐胜华
大数据时代的地理国情统计分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    武汉大学学报· 信息科学版
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘纪平;董春;亢晓琛;邱士可
  • 通讯作者:
    邱士可
Error-bounded and Number-bounded Approximate Spatial Query for Interactive Visualization
用于交互式可视化的误差有界和数有界的近似空间查询
  • DOI:
    10.1515/geo-2018-0039
  • 发表时间:
    2018-09
  • 期刊:
    Open Geosciences
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    仇阿根;张志然;钱新林;何望君
  • 通讯作者:
    何望君
A CUDA-Based Parallel Geographically Weighted Regression for Large-Scale Geographic Data
基于 CUDA 的大规模地理数据并行地理加权回归
  • DOI:
    10.3390/ijgi9110653
  • 发表时间:
    2020-10
  • 期刊:
    ISPRS International Journal of Geo-Information
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    王东超;杨毅;仇阿根;亢晓琛
  • 通讯作者:
    亢晓琛

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其他文献

多核处理器的机载激光雷达点云并行三角网渐进加密滤波方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    测绘学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    亢晓琛;刘继平;林祥国
  • 通讯作者:
    林祥国

其他文献

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相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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