SNPrs11614913影响pre-miRNA-196a成熟的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31100936
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    王凯
  • 依托单位：
    中国人民解放军第三军医大学
  • 学科分类：
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份：
    2014
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

miRNA-196a是Hox家族的上游基因，在很多肿瘤中表达异常,可能发挥癌基因或抑癌基因的作用。关联研究发现在它前体区的一个SNP位点（rs11614913）与多种肿瘤如乳腺癌，肺癌，食管癌等都有关联性。因此它可能作为一个功能性位点而参与肿瘤的发生发展，但是它是如何影响肿瘤易感性的，其具体的机制还不是很清楚。有研究发现不同基因型表达载体pre-miRNA-196a的表达没有差异但是成熟miRNA-196a有差别，因此此SNP位点很可能是影响了pre-miRNA到成熟miRNA的过程。本研究拟采用RT-RCR，EMSA,Norehern Blot等实验技术研究SNP（rs11614913）对miRNA-196a成熟过程以及表达的影响。探讨此SNP位点参与肿瘤易感性的机制。本研究将有助于我们进一步理解肿瘤发生，高异质性的分子机制具有重要的理论意义。

结项摘要

单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs）是DNA序列中单个核苷酸碱基的变异，是基因组中最常见的遗传变异。SNPs在基因组分布广泛，根据其在基因组中位置不同，分为基因间SNPs、基因编码区SNPs、调控区SNPs。本项目选择三种不同类型的SNPs位点，在中国汉族人群的食管癌样本中通过病例对照的关联分析找到相关联的位点，并对其阳性位点进行功能研究。（一）P53是迄今为止发现的最为重要的肿瘤抑制因子之一。而P53抑癌活性的产生，是以其作为转录因子调控众多下游靶基因为基础的。因此，这些P53结合区域的SNPs有望成为新的肿瘤发病风险标记。本研究发现位于P53靶基因BAX的SNP位点rs1009316以及靶基因CDKN1A的SNP位点rs762624、rs2395655与食管鳞癌显著相关。（二）位于编码区的SNPs可能影响蛋白的结构而导致肿瘤的易感性不同。SERPIN基因家族是一类丝氨酸蛋白酶抑制剂，它们可以通过改变蛋白结构而参与多种生物学过程。通过研究发现位于SERPINB5基因的外显子区的SNP rs2289519以及rs2289520与食管鳞癌显著相关，但是这两个SNPs位点不能影响蛋白的结构等。进一步研究发现SerpinB5在食管癌组织中的表达比正常组织显著降低。（三）miRNA基因通常是由RNA聚合酶II(polI)转录的，最初产物为pri-miRNA。pri-miRNA在Drosha作用下被处理成pre-miRNA。exportin 5将pre-miRNA输送到细胞质。随后，另一个酶Dicer将其剪切产生约为22个核苷酸长度的miRNA:miRNA*双链。成熟的miRNA通过碱基配对调控基因表达。那么位于miRNA前体区的SNP位点可能会影响miRNA的成熟过程而导致对疾病的易感性不同。我们研究发现位于miR-196a前体区的SNP位点rs11614913与食管鳞癌显著相关，并且不同的基因型miR-196a的表达不同。进一步研究发现另一类非编码RNA-lncRNA可以通过结合Lin28A蛋白参与miRNA的成熟过程。SNP的关联分析作为复杂疾病易感基因挖掘的常用方法之一，本项目通过基因不同区域的SNPs的研究，发现了6个与食管癌相关的SNPs位点，为食管癌的诊断提供了新的潜在靶点。

项目成果

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专著数量（0）
科研奖励数量（0）
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
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其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
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