新型荧光蛋白改造以及新型活细胞超高分辨显微成像方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370851
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2105.交叉融合生物技术
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The development and application of super-resolution imaging technologies in living cells enable us to dynamicallydefine the accurate localization of labeled protein in cells and has been hot issues in recent years in popular imaging field. However, fluorescent proteins (FPs)for the current developed diffraction-unlimited imaging methods are either limited or need to be optimized, which make it an important direction to evolve novel fluorescent proteins for super-resolution microscopy. Based on the demand and limit of currently used live-cell super-resolution microscopy, the project will develop novel fluorescent proteins with specific physical and chemical properties and related diffraction-unlimited imaging technology. We will develop stable reversible photo-activatablered FPs for non-linear SIM microscopy, super stable monomeric red FPs for Bessel beam plane illumination. And based on stable reversible photo-activatable green FPs we will develop novel live-cell super-resolution imaging technique. The evolved FPs in this project will greatly increase the development of super-resolution microscopies and application of these technologies in the field of protein trafficking and localization in cell biology.
当前超高分辨显微成像技术朝着活细胞、三维和多蛋白标记三个方向发展。其中在活细胞水平的超高分辨显微成像技术可以使我们在纳米尺度实时、动态观察目标蛋白在细胞中的精确定位,是荧光成像领域的一研究热点和重要发展趋势。然而,现有可用的荧光蛋白颜色单一、性能不够优化,制约了活细胞超高分辨显微成像的进一步发展和广泛应用。本课题将根据活细胞超高分辨显微成像技术对荧光蛋白探针的特征需求,发展具有光化学性质的荧光蛋白,并发展基于光转化特征的活细胞超高分辨显微成像新方法。具体包括发展可用于非线性结构光照明(NLSIM)活细胞超高分辨显微成像的绿色、红色单体可逆光转换荧光蛋白,可用于贝塞尔平行光照明活细胞成像的超稳单体红色荧光蛋白,以及基于荧光蛋白可逆光转化特性的活细胞超高分辨显微成像新方法。本项目的实施将极大地促进当前超高分辨显微成像技术的发展及其在细胞生物学、蛋白质定位和转运等研究中的广泛应用。

结项摘要

活细胞水平的超高分辨显微成像技术可以使我们在纳米尺度实时、动态观察目标蛋白在细胞中的精确定位,是荧光成像领域的一研究热点和重要发展趋势。本项目发展了可以用于超高分辨显微成像标记的可逆光激活荧光蛋白Skylan-S和Skylan-NS,在超分辨成像中表现优异。改善了超分辨方法,实现快速计算FID3B,并发展了可用于活细胞成像的单分子引导贝叶斯定位超高分辨显微成像技术(SIMBA)。相关研究成果发表在ACS Nano、Science、PNAS、Cell Research等高水平期刊上。另外,本项目还发展了一种高特异性快速标记细胞膜蛋白的方法,并总结了现今的荧光蛋白标记以及超高分辨显微成像技术。. 本项目的成果将极大地促进当前超高分辨显微成像技术的发展及其在细胞生物学、蛋白质定位和转运研究、蛋白质转录和翻译等诸多领域中的广泛应用。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(1)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
ADVANCED IMAGING. Extended-resolution structured illumination imaging of endocytic and cytoskeletal dynamics.
高级成像 内吞和细胞骨架动力学的扩展分辨率结构照明成像
  • DOI:
    10.1126/science.aab3500
  • 发表时间:
    2015-08-28
  • 期刊:
    Science (New York, N.Y.)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li D;Shao L;Chen BC;Zhang X;Zhang M;Moses B;Milkie DE;Beach JR;Hammer JA 3rd;Pasham M;Kirchhausen T;Baird MA;Davidson MW;Xu P;Betzig E
  • 通讯作者:
    Betzig E
Extending the spatiotemporal resolution of super-resolution microscopies using photomodulatable fluorescent proteins
使用光调制荧光蛋白扩展超分辨率显微镜的时空分辨率
  • DOI:
    10.1142/s1793545816300093
  • 发表时间:
    2016-05
  • 期刊:
    Journal of Innovative Optical Health Sciences
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Zhang Mingshu;Fu Zhifei;Xu Pingyong
  • 通讯作者:
    Xu Pingyong
Bayesian localization microscopy based on intensity distribution of fluorophores.
基于荧光团强度分布的贝叶斯定位显微镜
  • DOI:
    10.1007/s13238-015-0133-9
  • 发表时间:
    2015-03
  • 期刊:
    PROTEIN & CELL
  • 影响因子:
    21.1
  • 作者:
    Xu, Fan;Zhang, Mingshu;Liu, Zhiyong;Xu, Pingyong;Zhang, Fa
  • 通讯作者:
    Zhang, Fa
Development of a Reversibly Switchable Fluorescent Protein for Super-Resolution Optical Fluctuation Imaging (SOFI)
开发用于超分辨率光学波动成像 (SOFI) 的可逆可切换荧光蛋白。
  • DOI:
    10.1021/nn5064387
  • 发表时间:
    2015-03-01
  • 期刊:
    ACS NANO
  • 影响因子:
    17.1
  • 作者:
    Zhang, Xi;Chen, Xuanze;Xu, Pingyong
  • 通讯作者:
    Xu, Pingyong
Live cell single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy.
活细胞单分子引导贝叶斯定位超分辨率显微镜
  • DOI:
    10.1038/cr.2016.160
  • 发表时间:
    2017-05
  • 期刊:
    Cell research
  • 影响因子:
    44.1
  • 作者:
    Xu F;Zhang M;He W;Han R;Xue F;Liu Z;Zhang F;Lippincott-Schwartz J;Xu P
  • 通讯作者:
    Xu P

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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