食管癌中高甲基化linc00466的生物学效应及其在早期无创筛查诊断中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902148
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The incidence of esophageal cancer in China ranks among the top one in the world. The mechanism of esophageal cancer development is still unclear, what’s more, there is no effective early diagnosis technique. Our study showed that Linc00466 was significantly hypermethylated in esophageal cancer tissues, and the diagnostic index AUC was 0.85.This gene may serve as a potential diagnostic marker for esophageal cancer. Subsequent series of experiments confirmed that Linc00466 is a methylation-regulated tumor suppressor gene and can bind to miR-346, but the detailed mechanism remains to be further elucidated. We will elucidate the mechanism of Linc00466 promoter hypermethylation leading to its low expression by DNA pull down and EMSA techniques, and explore the mechanism of action of Linc00466-miR-346-FBXL2 signal axis in the development of esophageal cancer. In addition, we plan to look for the interaction protein of Linc00466 , which will combine with the ceRNA regulatory network to mime the signaling pathways involved in the development of esophageal cancer that result from Linc00466. Analyzing the difference in promoter methylation degree of Linc00466 in plasma free DNA between esophageal cancer patients and normal people to esta blish an early diagnosis model for esophageal cancer, and obtain a diagnostic strategy with independent intellectual property rights in early serological diagnosis of esophageal cancer.
我国食管癌的发病率位居世界前列,其发生发展机制尚不明确,且缺乏有效早期诊断技术。我们研究表明Linc00466在食管癌组织中呈显著高甲基化,诊断指标AUC值为0.85,提示该基因可能作为一个潜在的食管癌诊断标志物。后续系列实验确认该长非编码RNA是一个受甲基化调控的抑癌基因且可与miR-346结合。本课题组欲通过DNA pull down及EMSA等技术阐明Linc00466启动子高甲基化导致其低表达的机制,探索研究Linc00466-miR-346-FBXL2信号轴在食管癌的发生发展中的作用机制,同时寻找Linc00466的互作蛋白,结合ceRNA调控网络,深入挖掘Linc00466在食管癌的发展过程中参与的信号通路。分析食管癌患者和正常人血浆游离DNA中Linc00466的启动子甲基化程度差异,建立其与食管癌早期诊断模型,欲在食管癌早期血清学诊断方面获得一项具有自主知识产权的诊断策略。

结项摘要

作为一种常见的消化道恶性肿瘤,食管癌不仅生存率低,复发率高,还具有很强的侵袭性。食管癌按病理类型主要分为鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC)和腺癌(Esophageal Adenocarcinoma, EAC)。近年来随着人们对表观遗传学认识的不断深入,DNA甲基化逐渐成为肿瘤研究的热点。为了确定Linc00466在ESCC中的作用及其作为生物标志物的潜在价值,我们研究了Linc00466的启动子甲基化状态和Linc00466在ESCC肿瘤和癌旁组织中的表达水平,发现Linc00466在ESCC中呈高甲基化低表达。.利用慢病毒包装并筛选稳定过表达细胞株,进一步拓展Linc00466对多种ESCC细胞系(CAES-17、Eca-109)的体外生物学影响,发现Linc00466的过表达对体外ESCC细胞系的增殖,迁移,侵袭均存在明显抑制作用,而对ESCC细胞的凋亡存在促进作用。但目前关于Linc00466在食管癌中发挥作用的相关调控机制未见报道。为探究Linc00466发挥抑制ESCC发生发展的具体调控机制,我们通过生物信息学方法分析得到两条可能信号轴通路:Linc00466/miR146b-5p/CELF2,Linc00466/miR-23b-3p/DUSP5。相关分子生物学实验结果表明,miR-146b-5p并不能靶向降低CELF2的表达,Linc00466以ceRNA方式海绵吸附miR-23b-3p,通过Linc00466/miR-23b-3p/DUSP5信号轴调控抑癌基因DUSP5的表达,进而影响食管鳞癌发生发展,并确定了相关分子生物学机制。这些结果为Linc00466作为食管鳞癌诊治靶标,丰富了理论依据。.受该基金资助,我们研究了TCIRG1基因突变致婴儿恶性型骨硬化症的临床表现及家系分析。分析TCIRG1基因与遗传性疾病骨硬化症之间的关联。探究骨硬化症患儿的临床特点及遗传学病因,为硬骨症的早期诊断提供新的思路和方法。我们还发现了史密斯-金斯莫综合征患儿MTOR基因位点的新突变,并进行了遗传学分析,扩展了MTOR相关疾病的遗传谱,为遗传咨询和生育指导提供了有力的理论支持。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
与发育癫痫性脑病 9 型相关的一种新型 PCDH19 变 体
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    临床检验杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尚丽娜;熊学艳;蒋益;戴标;王春来;毛旭华
  • 通讯作者:
    毛旭华
TCIRG1基因突变致婴儿恶性型骨硬化症的临床表现及家系分析
  • DOI:
    10.13602/j.cnki.jcls.2022.03.14
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    临床检验杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尚丽娜;张欢欢;蒋益;毛旭华
  • 通讯作者:
    毛旭华
MTOR基因位点新突变致史密斯-金斯莫综合征患儿的遗传学分析
  • DOI:
    10.19460/j.cnki.0253-3685.2022.11.027
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    江苏医药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尚丽娜;熊学艳;蒋益;毛旭华
  • 通讯作者:
    毛旭华
Tuberculosis reinfection and relapse in eastern China: a prospective study using whole-genome sequencing
中国东部地区结核病再感染和复发:利用全基因组测序进行的前瞻性研究
  • DOI:
    10.1016/j.cmi.2022.05.019
  • 发表时间:
    2022-10-21
  • 期刊:
    CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION
  • 影响因子:
    14.2
  • 作者:
    Liu, Qiao;Qiu, Beibei;Lu, Wei
  • 通讯作者:
    Lu, Wei
Bifidobacterium longum CCFM1077 Ameliorated Neurotransmitter Disorder and Neuroinflammation Closely Linked to Regulation in the Kynurenine Pathway of Autistic-like Rats.
长双歧杆菌 CCFM1077 改善神经递质紊乱和神经炎症,与自闭症样大鼠的犬尿氨酸途径的调节密切相关
  • DOI:
    10.3390/nu14081615
  • 发表时间:
    2022-04-13
  • 期刊:
    NUTRIENTS
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Kong, Qingmin;Chen, Qian;Mao, Xuhua;Wang, Gang;Zhao, Jianxin;Zhang, Hao;Chen, Wei
  • 通讯作者:
    Chen, Wei

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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