中国肌萎缩侧索硬化患者DIAPH3基因筛查及其遗传、细胞损伤机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81601105
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0912.神经退行性变及相关疾病
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a kind of fatal neurodegenerative disease. The cytoskeletal abnormalities are reported to correlated with pathogenesis of ALS. DIAPH3 gene plays an important role in the formation of cytoskeleton, including filaments and microtubules, and regulates the expression of multiple ALS causative genes. The applicant identified several ALS patients, including familial and sporadic cases, carrying possibly damaging mutations in DIAPH3. However, direct correlations and related mechanism between DIAPH3 and ALS are blurred. Therefore the presented study intends to explore the role of DIAPH3 gene in the pathogenesis of ALS: by using the next generation sequencing technology, this study is about to identify the prevalence and clinical features of DIAPH3 mutation carriers; by using the genetic burden test, the study will explore genetic statistical correlation between the DIAPH3 and ALS, especially for the genetic variants in the specific pathways, such as genes related to formation or functional regulation of the cytoskeleton; by observing motor neuron cell lines with DIAPH3 mutations expressed, the study is going to verify the possible cellular mechanism of DIAPH3 in ALS pathogenesis. This study will provide important insights for the future genetic diagnosis and treatment of ALS. The research team has rich experience in genetic study and related molecular mechanisms especially for ALS. It is expected that this study could achieved advanced and outstanding results even in the worldwide.
肌萎缩侧索硬化(ALS)是一种致死性的神经变性病。细胞骨架异常与ALS发病密切关联。DIAPH3对细胞骨架中微丝及微管形成有重要影响,调控多个ALS致病基因表达。申请人已发现数个携带DIAPH3致病突变的中国ALS家系及散发病例,高度提示该基因与ALS相关。但DIAPH3与ALS直接关联不明确且发病机制研究空缺。故本研究拟系统探讨DIAPH3基因与ALS发病的直接关系和机制:用二代测序方法,明确DIAPH3在中国ALS发病人群中的基因频率、突变携带患者的临床特点;对DIAPH3和与细胞骨架功能、ALS相关的多基因变量进行变异负担分析,明确DIAPH3突变与ALS发病的遗传相关性;观察DIAPH3突变在运动神经元细胞株VSC4.1表达对细胞活性及对细胞骨架、泛素化蛋白影响,印证发病机制。本研究将对ALS的基因诊断和治疗提供重要指导意义。申请人研究经验丰富、条件成熟,预期成果能具备先进水平。

结项摘要

肌萎缩侧索硬化(ALS)是一种致死性的神经变性病。细胞骨架异常与ALS发病密切关联。DIAPH3对细胞骨架中微丝及微管形成有重要影响,调控多个ALS致病基因表达。但DIAPH3与ALS直接关联不明确且发病机制研究空缺。. 故本研究利用遗传学及分子生物学方法系统探讨DIAPH3基因与ALS发病的直接关系和机制:用二代测序方法,明确了DIAPH3在中国ALS发病人群中的基因频率、突变携带患者的临床特点。并对DIAPH3和与细胞骨架功能、ALS相关的多基因变量进行变异负担分析,明确DIAPH3突变与ALS发病的遗传相关性。在VSC4.1细胞系表达hDIAPH3WT及hDIAPH3突变型,初步探索DIAPH3在ALS发病中的可能机制和运动神经元细胞改变,观察DIAPH3突变在运动神经元细胞株VSC4.1表达对细胞活性及对细胞骨架、泛素化蛋白影响,印证发病机制。. 本课题目前已建立和补充、完善ALS的数据库和遗传资料库,3年内新增纳入约1000例ALS患者数据,建立大样本队列(完善患者近600例全外显子测序数据),掌握ALS常见致病类型的流行病学资料,追踪自然病史,分析中国汉族人群与欧美国家流行病学的异同,为发病机制、量表及治疗的研究搭建良好的平台(包括研究性网络平台,www.chalsr.net)。完善了部分样本全基因组外显子测序及筛查,对部分患者进行神经、肌肉病理的检测。. 课题奠定了一定基础,确立及改良了部分高通量分析方法、通路分析等关键技术,明确了进一步研究的可行性。本课题发表系列SCI期刊文章6篇,核心期刊2篇。课题主持人以第一作者、责任作者身份分别发表工作于《Nature Communications》,《Journal of Neurology, Neurosurgery, and Psychiatry》,《Neurobiology Aging》等较高水平期刊,同时课题协同发布一项开源软件(https://github.com/gc5k/GEAR),成果水平良好。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CHCHD10 mutations in patients with amyotrophic lateral sclerosis in Mainland China
中国大陆肌萎缩侧索硬化症患者CHCHD10突变
  • DOI:
    10.1016/j.neurobiolaging.2017.02.011
  • 发表时间:
    2017-06-01
  • 期刊:
    NEUROBIOLOGY OF AGING
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Shen, Shen;He, Ji;Fan, Dongsheng
  • 通讯作者:
    Fan, Dongsheng
Whole-exome sequencing in amyotrophic lateral sclerosis suggests NEK1 is a risk gene in Chinese.
肌萎缩侧索硬化症的全外显子组测序表明 NEK1 是中国人的一个风险基因。
  • DOI:
    10.1186/s13073-017-0487-0
  • 发表时间:
    2017-11-17
  • 期刊:
    Genome medicine
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Gratten J;Zhao Q;Benyamin B;Garton F;He J;Leo PJ;Mangelsdorf M;Anderson L;Zhang ZH;Chen L;Chen XD;Cremin K;Deng HW;Edson J;Han YY;Harris J;Henders AK;Jin ZB;Li Z;Lin Y;Liu X;Marshall M;Mowry BJ;Ran S;Reutens DC;Song S;Tan LJ;Tang L;Wallace RH;Wheeler L;Wu J;Yang J;Xu H;Visscher PM;Bartlett PF;Brown MA;Wray NR;Fan D
  • 通讯作者:
    Fan D
Whole-exome sequencing identified novel KIF5A mutations in Chinese patients with amyotrophic lateral sclerosis and Charcot-Marie-Tooth type 2.
全外显子组测序在中国肌萎缩侧索硬化症和腓骨肌萎缩症 2 型患者中发现了新的 KIF5A 突变。
  • DOI:
    10.1136/jnnp-2019-320483
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    J Neurol Neurosurg Psychiatry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    He Jing;Liu Xiaoxuan;Tang Lu;Zhao Chen;He Ji;Fan Dongsheng
  • 通讯作者:
    Fan Dongsheng
Two rare variants of the ANXA11 gene identified in Chinese patients with amyotrophic lateral sclerosis
在中国肌萎缩侧索硬化症患者中发现了 ANXA11 基因的两种罕见变异。
  • DOI:
    10.1016/j.neurobiolaging.2018.09.020
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    NEUROBIOLOGY OF AGING
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Liu, Xiangyi;Wu, Chujun;Fan, Dongsheng
  • 通讯作者:
    Fan, Dongsheng
脑表达的X连锁基因1在神经系统疾病中的研究进展
  • DOI:
    10.15932/j.0253-9713.2019.05.016
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    北京医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马新然;何及;樊东升
  • 通讯作者:
    樊东升

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其他文献

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何及的其他基金

TNIP1基因功能缺失在肌萎缩侧索硬化中致病作用的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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