油菜耐湿主效QTL qWR9-2的精细定位与候选基因克隆

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31601334
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    王晓东
  • 依托单位：
    江苏省农业科学院
  • 学科分类：
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份：
    2019
  • 批准年份：
    2016
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Waterlogging is one of the most serious factors limiting the rapeseed production, especially along the middle and lower reaches of the Yangtze which was the main producing area of Brassica napus in China. Therefore, study on the genetic control of the waterlogging tolerance has an important scientific significance and application value. Fine mapping of the major QTL for waterlogging tolerance is the first step to reveal candidate genes, however, to our knowledge, few QTL associated with waterlogging tolerance was fine mapping in B. napus. QTL qWR9-2 was the major QTL for waterlogging tolerance in our previous study, which was identified in a F2:3 population containing 188 lines. This QTL could be repeatedly detected in two experiments and explained 47.58% and 23.57% of the phenotypic variation, respectively. In this research, we will confirm the qWR9-2 based on bulked-segregant analysis (BSA) method combined with next-generation sequencing (NGS) technology. In addition, a BC4F2 population will be constructed and used for fine mapping qWR9-2 within 1.0 cM. Finally, gene expression analysis will be carried out through quantitative RT-PCR. The completion of this research can provide useful clues to extrapolate the molecular mechanism of waterlogging tolerance, and establish the foundation of marker assisted selection of breeding in rapeseed.
湿害是影响我国油菜生产的最大限制因素之一，尤其对长江中下游油菜主产区造成显著影响。研究油菜耐湿性的遗传机制和分子机理具有重要的科学意义和应用价值。精细定位耐湿主效QTL是揭示耐湿相关基因的首要步骤，但目前对油菜耐湿QTL进行精细定位的报道还很少。前期项目组利用包含188个株系的F2:3家系群体对油菜苗期耐湿性进行QTL定位，发现了控制耐湿性的主效QTL位点qWR9-2，两年分别解释表型变异的47.58%和23.57%。本项目拟以该群体为基础，利用全基因组测序的BSA方法，对该主效QTL位点做进一步的鉴定；同时构建用于qWR9-2精细定位的BC4F2群体，将qWR9-2精细定位于1.0 cM内；根据基因功能确定候选基因，并对候选基因进行表达分析。研究结果可为揭示油菜耐湿性的调控机制及通过分子设计方法培育耐湿性的油菜品种奠定基础。

结项摘要

湿害是影响我国油菜生产的最大限制因素之一，尤其对长江中下游油菜主产区造成显著影响。研究油菜耐湿性的遗传机制和分子机理具有重要的科学意义和应用价值。甘蓝型油菜耐湿性的强弱受基因型控制，遗传差异较大，并且缺少高耐湿种质资源。本项目基于已构建的高密度SNP遗传图谱，对包含189个家系的RIL群体的耐湿性进行QTL定位。在5个环境中共检测到17个与耐湿性相关的QTL，其中QTL cqWT.C3-2，cqWT.C8-1和cqWT.C8-2能在两个环境中重复检测到。QTL cqWT.C3-2在两个环境中分别解释表型变异的10.3%和23.3%，是本研究中检测到的耐湿性主效QTL位点。此外，基于油菜的60 K SNP芯片，通过对520个甘蓝型油菜品种/品系构成的自然群体进行耐湿性状的关联分析，在两个环境中共获得80个与油菜耐湿性状相关的SNP。将连锁与关联分析的结果进行比较分析，发现两种定位方法没有定位到共同的位点。本项目将连锁分析与关联分析及生物信息学等想结合，在研究方法上有一定的创新性，研究成果为油菜耐渍基因的图位克隆奠定了基础。本研究获得的耐渍性材料，为油菜耐渍新品种的选育提供了新的种质资源。

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Identification and physical mapping of QTLs associated with flowering time in Brassica napus L.
甘蓝型油菜开花时间相关QTL的鉴定和物理定位。
  • DOI：
    10.1007/s10681-019-2480-8
  • 发表时间：
    2019-09
  • 期刊：
    Euphytica
  • 影响因子：
    1.9
  • 作者：
    Yu Kunjiang;Wang Xiaodong;Li Wenjing;Sun Lijie;Peng Qi;Chen Feng;Zhang Wei;Guan Rongzhan;Zhang Jiefu
  • 通讯作者：
    Zhang Jiefu
Dissecting the genetic mechanisms of waterlogging tolerance in Brassica napus through linkage mapping and a genome-wide association study
通过连锁图谱和全基因组关联研究剖析甘蓝型油菜耐涝的遗传机制
  • DOI：
    10.1016/j.indcrop.2020.112269
  • 发表时间：
    2020-05
  • 期刊：
    Industrial Crops & Products
  • 影响因子：
    5.9
  • 作者：
    Xiaodong Wang;Lijie Sun;Wenjing Li;Menlu Peng;Feng Chen;Wei Zhang;Chengming Sun;Song Chen;Wei Hua;Jiefu Zhang
  • 通讯作者：
    Jiefu Zhang
Unconditional and conditional QTL analyses of seed fatty acid composition in Brassica napus L.
甘蓝型油菜种子脂肪酸组成的非条件和条件QTL分析。
  • DOI：
    10.1186/s12870-018-1268-7
  • 发表时间：
    2018-03-23
  • 期刊：
    BMC plant biology
  • 影响因子：
    5.3
  • 作者：
    Chen F;Zhang W;Yu K;Sun L;Gao J;Zhou X;Peng Q;Fu S;Hu M;Long W;Pu H;Chen S;Wang X;Zhang J
  • 通讯作者：
    Zhang J
Quantitative Trait Transcripts Mapping Coupled with Expression Quantitative Trait Loci Mapping Reveal the Molecular Network Regulating the Apetalous Characteristic in Brassica napus L.
数量性状转录本作图与表达数量性状位点作图结合揭示了调节甘蓝型油菜无花瓣特征的分子网络。
  • DOI：
    10.3389/fpls.2018.00089
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    Frontiers in plant science
  • 影响因子：
    5.6
  • 作者：
    Yu K;Wang X;Chen F;Peng Q;Chen S;Li H;Zhang W;Fu S;Hu M;Long W;Chu P;Guan R;Zhang J
  • 通讯作者：
    Zhang J

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

夹持输送式残膜捡拾机气力脱膜机理研究
  • DOI：
    10.13733/j.jcam.issn.2095-5553.2016.07.001
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    中国农机化学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    明光;毕新胜;王晓东;胡凯;汤智辉;何以川
  • 通讯作者：
    何以川
High quality metal-quantum dot-metal structure fabricated with a highly compatible self-aligned process
采用高度兼容的自对准工艺制造的高质量金属-量子点-金属结构
  • DOI：
    10.1088/1674-4926/36/12/123004
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    Journal of Semiconductors
  • 影响因子：
    5.1
  • 作者：
    付英春;王晓峰;马刘红;周亚玲;杨香;王晓东;杨富华
  • 通讯作者：
    杨富华
Robust extraction for low-contrast liver tumors using modified adaptive likelihood estimation
使用改进的自适应似然估计稳健提取低对比度肝脏肿瘤
  • DOI：
    10.1007/s11548-018-1820-9
  • 发表时间：
    2018-07
  • 期刊：
    International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    黄青;丁辉;王晓东;王广志
  • 通讯作者：
    王广志
基于循环频谱相干和DCNN的隔膜泵单向阀故障诊断方法研究
  • DOI：
    10.13465/j.cnki.jvs.2021.14.031
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
    振动与冲击
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    冯泽仲;熊新;王晓东
  • 通讯作者：
    王晓东
基于PQF的30MnCr22无缝钢管TMCP的实验研究
  • DOI：
    10.13289/j.issn.1009-6264.2015.s2.011
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    材料热处理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王晓东;郭锋;包喜荣;王宝峰
  • 通讯作者：
    王宝峰

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

王晓东的其他基金

油菜BnDCA1基因调控矮杆紧凑株型的分子机理及应用研究
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2021
  • 资助金额：
    58 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码