基于介体烟粉虱的宏基因组学方法研究双生病毒种群多样性

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31171814
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1401.植物病理学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

由烟粉虱传播的双生病毒(WTG)已在世界范围内引起多种作物的严重病害。受研究方法和技术的限制,目前WTG的研究仅限于引起作物产生严重病害、经济损失大的一类病毒,但对WTG的种群结构没有研究。本项目拟采集食性杂、具迁飞能力的传毒介体烟粉虱,从烟粉虱体内分离病毒DNA基因组,利用宏基因组学方法(Metagenomics),研究我国WTG种群多样性和变异进化规律,完善我国双生病毒种群数据库;鉴定WTG新种和新类型DNA分子;构建病毒新种和新类型DNA分子的侵染性克隆,明确其在病毒致病和病害传播中的作用;评估新病害发生流行的潜在风险。项目的开展有助于我们全面了解我国粉虱传双生病毒的种群结构、挖掘病毒新种、弄清病毒变异进化规律,同时深入开展病毒的致病性及病害流行研究,为全面预防和控制这类病毒病打下基础。

结项摘要

由烟粉虱传播的双生病毒(WTG)已在世界范围内引起多种作物的严重病害。本项目采集传毒介体烟粉虱,从烟粉虱体内分离病毒DNA基因组,利用宏基因组学方法搜索疑似双生病毒,PCR扩增病毒基因组全序列,研究我国WTG种群多样性和变异进化规律。在云南省的烟粉虱中共发现11种双生病毒,5种betasatellites,2种alphasatellites及各类缺陷型DNA小分子。双生病毒为云南烟草曲叶病毒、丁香黄脉病毒、越南丁香黄脉病毒、云南赛葵黄脉病毒、甘薯曲叶病毒、番茄黄曲叶病毒、中国番木瓜曲叶病毒、巴豆黄脉花叶病毒、中国番茄黄曲叶病毒、中国胜红蓟黄脉病毒、中国辣椒黄曲叶病毒。广西省烟粉虱中共检测9种双生病毒,2种betasatellites。分别为中国番木瓜曲叶病毒、中国胜红蓟黄脉病毒、中国番茄曲叶病毒、广西番茄曲叶病毒和巴豆黄脉花叶病毒、雾水葛金色花叶病毒、云南赛葵黄脉病毒、中国南瓜曲叶病毒、甘薯曲叶病毒,海南省烟粉虱共检测到4种病毒:中国南瓜曲叶病毒、黄花稔曲叶病毒、甘薯曲叶病毒和越南丁香黄脉病毒。浙江省烟粉虱共发现4种病毒:番茄黄曲叶病毒、甘薯曲叶病毒、乔治亚甘薯曲叶病毒、河南甘薯曲叶病毒。山东省只发现番茄黄曲叶病毒。在云南和广西的烟粉虱样品中发现一个单组份双生病毒新种,其与巴豆黄脉花叶病毒的全序列同源性最高(87%),将其命名为中国巴豆黄脉花叶病毒(Croton yellow vein mosaic China virus, CYVMCNV)。在云南和海南的烟粉虱样品中还分离到越南丁香黄脉病毒分离物,这是越南丁香黄脉病毒在我国的首次发现。病毒全基因组序列同源性比较、核酸多态性变异分析及系统进化分析发现,与植物上分离的病毒相比,烟粉虱所携带病毒的同源性较高,变异率相对较小。发现一类不编码ORF的新型缺陷型DNA小分子,全长为738nt,含有保守的茎环结构和九核苷酸TAATATTAC,互补链上还含有一个与alphasatellite类似的茎环结构和九核苷酸TAGTATTAC。序列分析发现这是一种由alphasatellite和betasatellite重组形成的新型缺陷性DNA分子,这类卫星分子在双生病毒感染的烟粉虱中普遍存在。构建了中国巴豆黄脉花叶病毒、越南丁香黄脉病毒及乔治亚甘薯曲叶病毒的侵染性克隆。研究结果丰富了我国粉虱传双生病毒的种群。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Highly sensitive serological methods for detecting tomato yellow leaf curl virus in tomato plants and whiteflies.
用于检测番茄植株和粉虱中番茄黄曲叶病毒的高灵敏血清学方法
  • DOI:
    10.1186/1743-422x-10-142
  • 发表时间:
    2013-05-06
  • 期刊:
    Virology journal
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Xie Y;Jiao X;Zhou X;Liu H;Ni Y;Wu J
  • 通讯作者:
    Wu J
A naturally occuring defective DNA satellite associated with a monopartite begomovirus:Evidence for recombination between alphasatellite and betasatellite
与单部分 Begomovirus 相关的天然存在的缺陷 DNA 卫星:α 卫星和 β 卫星之间重组的证据
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Viruses 5: 2116-218
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yan Xie;Liling Zhao;He Ren;Zhenghe Li
  • 通讯作者:
    Zhenghe Li
不同番茄品种对5种植物双生病毒的抗病性鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    矫晓阳;周雪平;杨悦俭;谢 艳
  • 通讯作者:
    谢 艳
A naturally occurring defective DNA satellite associated with a monopartite begomovirus: evidence for recombination between alphasatellite and betasatellite.
与单部分 Begomovirus 相关的天然存在的缺陷 DNA 卫星:α 卫星和 Beta 卫星之间重组的证据
  • DOI:
    10.3390/v5092116
  • 发表时间:
    2013-09-06
  • 期刊:
    Viruses
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Huang C;Xie Y;Zhao L;Ren H;Li Z
  • 通讯作者:
    Li Z

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    谢艳

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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