基于实体-属性-值的电子病历构建冠心病反事实疗效因果推断模式的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81703938
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3303.中西医结合研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The TCM intervention is complex and multi-dimensional, how to evaluate the effectiveness of the complex interventions based on causal inference and then to guide the clinical practice should be solved urgently. Electronic medical record (EMR) have massive retrospective clinical practice data, but they have are not widely used in the effectiveness study because the date are hard to reach and the traditional statistical method are appropriate to do the causal inference. To solve these problems, we urgently need to have the innovation in data utilization and analysis methods. Our previous studies have created the algorithms to extract Chinese text in EMR, based on these, we first use the EAV (Entity - Attribute - value) model to establish an medical data warehouse with highly integrated structure; Secondly we establish a multi-stage causal inference model based on the directed acyclic graph and instrumental variable approach in according with.counterfactual theory; Finally we build an causal inference research model in medical records. This model can provide a reference for the use of retrospective medical record data in scientific research and give the guidelines for clinical practice.
中医临床干预具有复杂性、多维性的特点,如何对复杂干预进行疗效的因果推断是中医学科亟需解决的一个问题。电子病历含有丰富的临床实践数据,但是由于信息提取困难和受到传统分析方法的限制,目前其并未用在疗效评价的研究中。为了能充分的利用电子病历数据进行中医干预的疗效评价并用于指导临床实践,我们迫切需要对电子病历数据的利用模式和疗效评价方法上进行创新。课题组前期的研究初步挖据了电子病历的科研价值,本研究在此基础上以冠心病为载体,首先借鉴信息学上E-A-V(实体-属性-值)技术,建立结构化的电子病历数据仓库,做到数据的高效整合与利用;其次应用有向无环图和工具变量法建立回顾性数据的多阶段反事实疗效因果推断模型,突破了回顾性研究无法进行准确因果推断的限制;最后构建高效利用电子病历数据做因果推断的研究模式。这种模式可为利用回顾性病历数据做疗效评价提供参考,用于更好的指导临床实践。

结项摘要

基于临床实践的电子病历虽然数据量大,内容丰富,但由于数据的非结构化和存在大量偏倚,目前的研究并没有充分的利用此类数据进行中医药的干预疗效评估。.本研究首先采用实体-属性-值的方法,对电子病历数据进行结构化,开发了Dynamic text categorization with machine learning algorithms(DTCA)可以快速和准确的标准化文本数据,最终形成结构化的电子病历数据仓库,包含57558条诊次,病例42863例,为利用电子病历数据进行分析提供数据和平台支持。. 其次通过大量的文献研究和专家咨询,提出了在中医药病历数据研究中采用工具变量的方法。该方法以模拟随机化的进行,校正已测量的和未测量的混杂因素。根据工具变量的前提假设条件,结合文献资料,我们提出了2个潜在的工具变量:病人就诊偏好和日历时间,并总结了在中医药领域使用和报告工具变量的流程。. 最后通过数据验证工具变量的合理性和有效性。本研究从数据仓库中导出9240例心脑血管疾病合并感染的病人,评价使用活血化瘀类与清热解毒类中成药是否能改善其住院结局及远期预后。本数据仓库与疾病预防控制中心的死因数据库进行匹配,获得病人远期预后结果。研究首先建立了有向无环图DAG,为后续的多因素分析和工具变量回归提供因果推断思路。然后采用经典的多因素生存分析、基于虚拟事实模型的工具变量法和倾向评分匹配的方法分析数据。结果在所有的结局指标中,三种方法估计的结果方向相同,而且其点估计值和置信区间的宽度均较为一致。经过检验病人就诊偏好是合理的工具变量且不是弱工具变量。接着通过10000个样本的1000次重复抽样模拟研究得出工具变量强度在中等以上时,估计的效应值和真实值的差异较小。最后研究构建和总结了在中医药回顾性数据中进行因果推断的模式。. 总之,该因果推断模式不仅可以用于电子病历数据的分析,也可以用于其它回顾性及前瞻性数据的研究中,这将极大的拓宽中医药疗效高质量循证证据的来源,为中医药的科研现代化提供方法学参考。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
中国登记研究的现状分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中国循证医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周莉;欧阳文伟;李庚;刘澳林;温泽淮
  • 通讯作者:
    温泽淮
中医领域病例对照研究方法学质量与报告质量的相关性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中医杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘澳林;周莉;韩如雪;欧阳文伟;温泽淮
  • 通讯作者:
    温泽淮

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其他文献

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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