自驱微生物-聚合物混合溶液中流体力学相互作用的数值与理论研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11904320
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A2012.液态、准晶与非晶态物理
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Mixture of self-propelled microorganisms and polymers is ubiquitous in nature and laboratory. The hydrodynamic interaction dominates many properties of the mixture. At present, a lot of experimental observation, numerical simulation and theoretical analysis have been carried out for the mixed system of microorganism and small particles in academia. However, there is still a lack of reliable numerical simulation and theoretical models for more complex polymer systems with internal multi-degree of freedom. In order to reveal the key role of hydrodynamic interaction in structure and dynamics of the mixture, the project will develop numerical simulation method and theory on polymer and self-propelled microorganism. We mainly focus on two key properties of the mixture: 1) morphological transformation and dynamic properties of polymers, including buckling, reversal, migration and diffusion. 2) The movement of self-propelled microorganisms in polymer suspension, including acceleration, deceleration and tumbling. Methodologically, this project intends to develop Stokeslets method and the application of Brownian dynamics simulation with hydrodynamic interaction. We aim to construct kinetic equation about mixing and transport of microorganism and the statistical mechanics of chain molecules and derive the analytical expression of polymer distribution function and diffusivity and develop the simplified model of bacterium swimming in complex suspension. We search for the fundamental fluid mechanics and statistical physics underlying these phenomena. Furthermore, this project will discuss the design, control and application of micro-nano smart devices.
自驱微生物与聚合物的混合溶液广泛存在于自然界与实验室中。其流体力学相互作用主导了溶液诸多性质。当前学术界针对微生物与小颗粒混合体系进行了大量的实验观察、数值模拟与理论分析,然而对更复杂的、具有内部多自由度的聚合物体系,尚缺乏可靠的数值模拟与理论模型。本项目拟针对此混合溶液开展数值研究与理论分析,力图揭示流体力学相互作用对体系结构与动力学演化的重要意义。我们将重点研究混合溶液的两个关键性质:1)聚合物分子的形态转变与动力学性质。包括其在溶液中的屈曲、翻转、迁移与扩散。2)自驱微生物在聚合物溶液中的运动。包括加速、减速以及转向。方法上,本项目拟发展斯托克斯点力方法和含流体的布朗动力学模拟在此系统中的应用。并建立链分子的随机混合输运方程,推导聚合物分布函数和扩散率的解析表达,发展在复杂溶液中的细菌的运动简化模型。挖掘更深层次的流体力学与非平衡统计物理规律,并探讨微纳智能器件的设计、控制和应用。

结项摘要

本项目的主要研究对象是以细菌为主体的活性物质和链状聚合物体系。我们围绕着这个主题展开研究工作。我们主要致力于对细菌溶液描述的改进,利用斯托克斯点力的方法研究了在近场流体物理下,提出了普适的自驱细菌模型。从物理上,该模型能自洽的解释诸多细菌的新奇实验,如流体阱、团簇等现象。在计算上,该模型能用于模拟大量细菌组成的溶液中的群体行为。在聚合物输运理论方面,我们利用模耦合理论和非线性朗之万方程,推导了长链聚合物在球状粒子溶液中扩散的具体表达式。该表达式统一地处理了粒子密度、聚合物长度以及相互作用势对于扩散的影响,并在硬球模型下给出了与模拟和实验一致的结果,预测了聚合物扩散长链的标度行为。进一步,我们利用Marko-Siggia DNA模型和棒状聚合物模型,对聚合物在细菌流体中的行为进行建模。利用混合输运理论,进一步揭示了其构象和扩散系数在不同细菌参数下的行为,同时也发现了在集体流场中不同纵横比的棒状聚合物的扩散行为。我们的结果展示了复杂流体环境和复杂分子结构相互作用下,丰富的流体输运行为,为相关微流体和活性物质的应用提供了理论基础。本项目部分成果发表于PNAS, Macromolecules, Soft Matter, EPL等期刊,另有两篇尚在撰写分析中。总之,本项目广泛地研究了自驱动微生物和聚合物系统的相关物理特征,在理论模拟取得了相应的成果。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
An effective and efficient model of the near-field hydrodynamic interactions for active suspensions of bacteria.
细菌活性悬浮液近场流体动力相互作用的有效模型
  • DOI:
    10.1073/pnas.2100145118
  • 发表时间:
    2021-07-13
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Zhang B;Leishangthem P;Ding Y;Xu X
  • 通讯作者:
    Xu X
胶体聚合物弹性模量的微观理论:键长的效应
  • DOI:
    10.7498/aps.70.20210128
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    物理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张博凯
  • 通讯作者:
    张博凯
Effect of chain length on structure and dynamics in a melt of semiflexible rings
链长对半柔性环熔体结构和动力学的影响
  • DOI:
    10.1209/0295-5075/130/56001
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Europhysics Letters
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李健;张博凯
  • 通讯作者:
    张博凯
Theory of polymer diffusion in polymer–nanoparticle mixtures: effect of nanoparticle concentration and polymer length
聚合物纳米颗粒混合物中的聚合物扩散理论:纳米颗粒浓度和聚合物长度的影响
  • DOI:
    10.1039/d1sm00226k
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Soft Matter
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Bokai Zhang;Jian Li;Juanmei Hu;Lei Liu
  • 通讯作者:
    Lei Liu
Glass Formation in Mechanically Interlocked Ring Polymers: The Role of Induced Chain Stiffness
机械互锁环聚合物中的玻璃形成:诱导链刚度的作用
  • DOI:
    10.1021/acs.macromol.2c01368
  • 发表时间:
    2023-01
  • 期刊:
    Macromolecules
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Jian Li;Bokai Zhang;Yushan Li
  • 通讯作者:
    Yushan Li

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其他文献

不同有机肥对矿区复垦土壤氮素矿化的影响
  • DOI:
    10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.09004
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    应用与环境生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    薛玉晨;郝鲜俊;韩阳;张若扬;吕鉴于;张博凯
  • 通讯作者:
    张博凯
有机无机不同用量配施对煤矿复垦土壤氮素利用及矿质氮含量的影响
  • DOI:
    10.13870/j.cnki.stbcxb.2019.05.042
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    水土保持学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张若扬;郝鲜俊;吕鉴于;高文俊;张博凯;薛玉晨
  • 通讯作者:
    薛玉晨
芪苈强心胶囊中黄芪甲苷、毛蕊异黄酮葡萄糖苷和芒柄花素在大鼠体内药动学研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中草药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张瑜;张富赓;张博凯;朱明丹;张少强;杜武勋;肖学凤
  • 通讯作者:
    肖学凤

其他文献

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张博凯的其他基金

集体运动的细菌溶液中混合输运性质研究
  • 批准号:
    12374218
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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