hES及hiPS X染色体倾斜性失活与基因组失衡关联研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31171229
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    60.0万
  • 负责人：
    孙筱放
  • 依托单位：
    广州医科大学
  • 学科分类：
    C0607.基因组学
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

X染色体失活(XCI)是人类表观遗传研究的重要内容，其倾斜性失活机制仍不明确。研究证实，人胚胎干细胞(hESC)与某些基因组失衡且表观异常疾病（如X染色体连锁智力发育迟缓类疾病）具有相似的极度倾斜性XCI现象，我们前期课题（NSFC:30871378）发现，倾斜性XCI的hESC存在DNMT、Nanog等基因区域微小基因组失衡。我们推断，除了DNA甲基化及组蛋白修饰外，基因组水平的微小失衡与hESC倾斜性XCI也高度相关。.本课题拟以hESC和先天表观异常的hiPS为对象，结合基因组和表达谱芯片等方法，在全基因组内寻找与倾斜性XCI高度关联的拷贝数变异（CNV）、杂合性丢失（LOH）等区域并明确其基因调控网络和信号通路，筛选出候选基因并在随机失活干细胞中进行转染高表达或RNA干扰验证，明确基因组失衡影响X染色体倾斜性失活机制，阐明异常失活调控通路，丰富干细胞表观遗传调控理论

结项摘要

X 染色体失活(XCI) 是人类表观遗传研究的重要内容，其倾斜性失活机制仍不明确。我们前期课题（ NSFC:30871378）发现，倾斜性 XCI 的 hESC 存在 DNMT、 Nanog 等基因区域微小基因组失衡。我们推断，除了DNA 甲基化及组蛋白修饰外，基因组水平的微小失衡与 hESC 倾斜性 XCI 也高度相关。.本课题以 hESC 和先天表观异常的 hiPS 为对象，结合基因组和表达谱芯片等方法，证明基因组的拷贝数变异（ CNV）、杂合性丢失（ LOH）与倾斜性 XCI 高度关联,并明确其基因调控网络和信号通路，筛选出候选基因并在随机失活干细胞中进行转染高表达证明该基因与XCI的相关性。从而明确基因组失衡影响 X 染色体倾斜性失活机制，阐明异常失活调控通路，丰富干细胞表观遗传调控理论。

项目成果

期刊论文数量（63）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
应用双胎羊水多能干细胞建立诱导分化的内对照模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Chinese Journal of Medical Genetics
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    ZHENG Yu-hong;ZHENG Yu-hong;SUN Xiao-fang;SUN Xiao-fang
  • 通讯作者：
    SUN Xiao-fang
诱导多能干细胞在血液系统疾病中研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国组织工程研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    范荻;孙筱放;范荻;孙筱放
  • 通讯作者：
    孙筱放
HIGHER COPY NUMBER VARIATION AND DIVERSE X CHROMOSOME INACTIVATION IN PARTHENOTE-DERIVED HUMAN EMBRYONIC STEM CELL
孤雌生殖人胚胎干细胞中较高的拷贝数变异和多样化的 X 染色体失活
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Journal of Reproduction and Development
  • 影响因子：
    1.8
  • 作者：
    LIU WQ;GUO LY;HE WZ;LI Q;SUN XF
  • 通讯作者：
    SUN XF
X染色体倾斜失活人胚胎干细胞的拷贝数变异
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中国组织工程研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李洁亮;郭丽媛;黎青;孙筱放
  • 通讯作者：
    孙筱放
Improved hematopoietic differentiation efficiency of gene-corrected beta-thalassemia induced pluripotent stem cells by CRISPR/Cas9 system.
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  • DOI：
    10.1089/scd.2014.0347
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    Stem Cells Dev
  • 影响因子：
    4
  • 作者：
    Luo M;Luo M;Sun X;Sun X
  • 通讯作者：
    Sun X

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Establishment of peripheral blood mononuclear cell-derived humanized lung cancer mouse models for studying efficacy of PD-L1/PD-1 targeted immunotherapy
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  • 通讯作者：
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    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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    --
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  • 通讯作者：
    孙筱放
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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    --
  • 作者：
    范勇;骆玉梅;陈欣洁;孙筱放
  • 通讯作者：
    孙筱放
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  • 发表时间：
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    --
  • 作者：
    孔舒;骆玉梅;李少英;黄盛昌;蒋永华;银益飞;郑育红;刘维强;孙筱放
  • 通讯作者：
    孙筱放

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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