转录调控中起作用的细胞周期激酶的鉴定及其作用机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30970625
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万
  • 负责人：
    李沁桐
  • 依托单位：
    四川大学
  • 学科分类：
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

在高等真核生物中，所有编码蛋白质的基因以及多种非编码RNA都是由RNA聚合酶II转录的。 所生成的前体RNA通常需要经过多步的RNA处理（RNA processing）过程才最后产生有生物活性的RNA。 在细胞内，转录和RNA处理这两个过程不仅紧密耦合而且受细胞周期激酶(cyclin-dependent kinase)的高度调控。 异常调控是导致多种人类疾病的原因。我们以前的研究表明cyclin K (CCNK)对这两个过程有调控作用。本项目的目的是进一步阐明CCNK的作用机理。 我们将利用蛋白质组学（proteomics）的手段鉴定和CCNK结合的蛋白。这将提示我们CCNK的作用机制。我们还将利用小鼠knock-out模型近一步理解CCNK在生物体内的功能。鉴定调控转录和RNA处理这两个过程的激酶及理解其作用机制不仅将加深我们对转录调控机制的理解，而且也将提供新型治疗疾病的药物靶向。

结项摘要

在高等真核生物中，所有编码蛋白质的基因以及多种非编码RNA都是由RNA聚合酶II转录的。 所生成的前体RNA通常需要经过多步的RNA处理（RNA processing）过程才最后产生有生物活性的RNA。P-TEFb （由CDK9和cyclin T组成）在这些过程中起关键调控作用。P-TEFb 激酶活性受以7SK 非编码RNA 为骨架的蛋白/核酸复合体(ribonucleoprotein, RNP)精密调控。通过本项基金的支持，我们发现了PKC蛋白激酶在调节P-TEFb和7SK RNP相互结合的作用机制和对基因转录的影响。此项发现发表在Nucleic Acids Research（影响因子：8）。长期以来，cyclin K 一直被认为是CDK9 的调控亚基，但我的实验室在前期研究中，意外发现cyclin K 在细胞内并不和CDK9 相互结合。利用蛋白质组学的手段，我们鉴定了和其结合的激酶是CDK12和CDK13。我们进一步发现CDK12/CycK 和CDK13/CycK 对维持胚胎干细胞的自我更新起重要作用。此项发现发表在Journal of Biological Chemistry（影响因子：5）。我们计划对这两个CDKs 的功能及其和人类疾病的相关性进行进一步研究。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Cyclin K-containing Kinase Complexes Maintain Self-renewal in Murine Embryonic Stem Cells
含细胞周期蛋白 K 的激酶复合物维持小鼠胚胎干细胞的自我更新
  • DOI：
    10.1074/jbc.m111.321760
  • 发表时间：
    2012-07-20
  • 期刊：
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子：
    4.8
  • 作者：
    Dai, Qian;Lei, Tingjun;Li, Qintong
  • 通讯作者：
    Li, Qintong
PKC phosphorylates HEXIM1 and regulates P-TEFb activity
PKC 磷酸化 HEXIM1 并调节 P-TEFb 活性
  • DOI：
    10.1093/nar/gks682
  • 发表时间：
    2012-10-01
  • 期刊：
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH
  • 影响因子：
    14.9
  • 作者：
    Fujinaga, Koh;Barboric, Matjaz;Peterlin, B. Matija
  • 通讯作者：
    Peterlin, B. Matija

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其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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