DNA光修复酶和隐色素作用机理异同的分子水平研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30900243
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

DNA光修复酶(DNA photolyase)可利用300-500nm波长的光能修复紫外线造成的DNA损伤。目前普遍认为DNA光修复酶通过光诱发的电子传递反应进行修复。但其反应的有些细节如底物的电子回传路径尚未确切阐明。隐色素(Cryptochrome)是较近发现的一类蛋白,在动植物(包括人类)及一些微生物中均有发现,其序列和结构与DNA光修复酶高度同源,但不具有或只具有很低的修复功能。研究表明隐色素是一种重要的光受体,在调整生物节律中起作用。隐色素在植物中参与控制光形态建成以及开花时间;在动物体内其不仅被认为与生物节律有关,最近还推测其可能是鸟类和昆虫的磁场感受器,起生物罗盘作用。但隐色素的具体作用机理目前并不十分清楚。本项目拟通过对这两类蛋白的序列分析,寻找与它们作用机理相关的保守以及相异的残基,以DNA光修复酶为基础,通过构建突变克隆并表达重组蛋白,在分子水平研究两者作用机理的异同。

结项摘要

DNA 光修复酶可利用光能修复紫外线造成的DNA 损伤。隐色素是光修复酶的同源蛋白,但不具有修复活性,目前认为隐色素是一类生物钟蛋白,在调控生物节律方面起作用。本项目以大肠杆菌光修复酶为基础,利用生物信息学方法比对分析与其同源蛋白隐色素的序列,寻找与他们作用机理相关的保守或不同的残基,通过分子生物学方法构建突变克隆并表达重组突变蛋白,以在分子水平研究两者作用机理的异同。自项目开展以来,工作主要从两方面开展。其一是继续研究大肠杆菌光修复酶在细胞内外的性质,为进一步寻找和隐色素作用机制异同点打下基础。其二是根据现有文献以及我们的实验结果和预测,选择了若干位点进行突变研究,尝试表达突变蛋白并分析其性质。在第一个方面,我们经过研究发现,大肠杆菌光修复酶基因的mRNA表达水平和培养温度等外界因素影响不大,但光修复酶蛋白及其活性随培养温度上升而显著下降,这种下降可能和光修复酶的热稳定性较差有关。在第二个方面,我们通过四引物法成功构建了光修复酶基因Met345位,Ala377位和Asn378位的15个点突变,并对突变蛋白的表达纯化条件作了探索,得到了一套高效的表达、纯化突变蛋白的方法。通过对突变蛋白的性质进行分析,我们发现根据Ala377位隐色素同源序列设计的大部分的突变蛋白仍然具有和野生型类似的活性;突变蛋白均具有MTHF辅酶;突变蛋白的FAD辅酶氧化还原性质和野生型类似,纯化后也均存在自由基状态,但Ala377Ser突变在空气中氧化速度变慢,而Ala377Cys, Ala377Val, Ala377Ile突变氧化速度则略有加快。在强蓝色光光照条件下,我们发现Ala377Cys, Ala377Val, Ala377Ile突变蛋白存在FAD辅酶脱落的现象,有可能是光照导致蛋白构象发生改变;而野生型和Ala377Ser突变在强蓝色光光照下稳定,无辅酶脱落现象。这可能与拟南芥隐色素Cry1和Cry2的不同特性有关:Cry1在强光下发挥作用,而Cry2在弱光下发挥作用,并且在强光下迅速降解;而拟南芥Cry1和Cry2的在Ala377同源位点恰好分别是Ser和Cys。我们推测FAD辅酶脱落可能是Cry2强光下降解的起始步骤之一。这个发现可能对深入认识隐色素的进化过程以及其在不同条件调控生物钟的作用机理有所帮助。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
弥散性血管内凝血的新认识及实验诊断进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    检验医学与临床
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陆晓华;程礼敏;李伟;丁敏;王国光;徐蕾
  • 通讯作者:
    徐蕾
The Roles of Several Residues of Escherichia coli DNA Photolyase in the Highly Efficient Photo-Repair of Cyclobutane Pyrimidine Dimers
大肠杆菌DNA光解酶的几个残基在环丁烷嘧啶二聚体高效光修复中的作用
  • DOI:
    10.4061/2010/794782
  • 发表时间:
    2010-08
  • 期刊:
    Journal of Nucleic Acids
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Xu, Lei;Zhu, Guoping
  • 通讯作者:
    Zhu, Guoping
Altered nucleic acid partitioning during phenol extraction or silica adsorption by guanidinium and potassium salts
胍盐和钾盐在苯酚提取或二氧化硅吸附过程中改变核酸分配。
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2011.08.047
  • 发表时间:
    2011-12-15
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Xu, Lei;Lv, Jun;Zhu, Guoping
  • 通讯作者:
    Zhu, Guoping
Expression and identification of a thermostable malate dehydrogenase from multicellular prokaryote Streptomyces avermitilis MA-4680
多细胞原核生物阿维链霉菌 MA-4680 耐热苹果酸脱氢酶的表达和鉴定
  • DOI:
    10.1007/s11033-010-0273-1
  • 发表时间:
    2011-03-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Wang, Zong-Da;Wang, Bao-Juan;Zhu, Guo-Ping
  • 通讯作者:
    Zhu, Guo-Ping
生物化学与分子生物学实验教学中经典论文的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    基础医学教育
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐蕾;陆阳洋;吴明彩;吕俊;陈祥攀;凌烈峰
  • 通讯作者:
    凌烈峰

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    --
  • 作者:
    徐蕾
  • 通讯作者:
    徐蕾

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果蝇隐色素异常荧光性质与其光感受功能之间关系的研究
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果蝇隐色素异常荧光性质与其光感受功能之间关系的研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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