基于人类蛋白质组芯片的早期鼻咽癌自身抗体发现及生物标记物研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81673040
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1826.肿瘤学研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

As a poorly differentiated and highly metastatic cancer, nasopharyngeal carcinoma is one of the most malignant tumors in the south of China. Discovery of low-invasive biomarkers that can be used for the early screening, therapeutics and prognosis prediction of nasopharyngeal carcinoma will significantly improve the therapeutic treatment and long survival rate. In previous years, the accumulated evidence indicates that the serological autoantibodies may have great value in nasopharyngeal carcinoma detection. However, due to the limits of analytical technologies, only a few tumor autoantibodies were studied to date. In this project, we will build the first large-scale autoantibody discovery and biomarker study platform for nasopharyngeal carcinoma through a Nucleic Acid Programmable Protein Arrays (NAPPA) technology. With early nasopharyngeal carcinoma as a model, we will fabricate human proteome microarrays containing 10,000 human full-length proteins, screen sera from nasopharyngeal carcinoma patients and identify novel autoantibody biomarkers with diagnostics capability. The successful implementation of this project will be extended to the metastasis, recurrence, prognosis and therapeutic response of nasopharyngeal carcinoma, and provide a proteomics approach for the precision medicine of nasopharyngeal carcinoma.
鼻咽癌作为一种低分化、高转移性恶性肿瘤,在我国南方的发病率位居耳鼻咽喉肿瘤之首。发现可用于鼻咽癌早期筛查、疗效预测和预后判断的低侵袭性特异性生物标记物分子将大大有助于提高鼻咽癌患者的治疗效果和生存率。近几年不断有证据表明自身抗体对于鼻咽癌的检测具有重要价值,但是受分析技术的限制,只发现和研究了少数几种自身抗体。在本项目中,我们将采用核酸可编程蛋白质芯片技术(Nucleic Acid Programmable Protein Arrays,NAPPA)建立首个大规模鼻咽癌的血清自身抗体发现和生物标记物研究技术平台。我们将以早期鼻咽癌肿瘤为研究模式,制备包含有10,000个人源全长蛋白的人类蛋白质组芯片、鉴定鼻咽癌血清自身抗体和研究具有诊断价值的新型自身抗体标记物分子。成功实施该项目可进一步扩展到鼻咽癌肿瘤的迁移、复发和预后等不同阶段,为鼻咽癌的精准诊治研究提供一种有力的蛋白质组学技术手段。

结项摘要

鼻咽癌作为一种低分化、高转移性恶性肿瘤,在我国南方的发病率位居耳鼻咽喉肿瘤之首。发现可用于鼻咽癌早期筛查、疗效预测和预后判断的低侵袭性特异性生物标记物分子将大大有助于提高鼻咽癌患者的治疗效果和生存率。近几年不断有证据表明自身抗体对于鼻咽癌的检测具有重要价值,但是受分析技术的限制,只发现和研究了少数几种自身抗体。在本项目中,我们采用核酸可编程蛋白质芯片技术(NAPPA)建立了首个大规模鼻咽癌的血清自身抗体发现和生物标记物研究技术平台。我们以鼻咽癌肿瘤为研究模式,制备了包含有8000个人源全长蛋白的人类蛋白质组芯片,实验结果显示该芯片具有较高的蛋白表达成功率和重复性。利用该芯片我们对鼻咽癌患者血清的中的自身抗体进行了检测,发现了多个具有鼻咽癌诊断的价值的候选标记物分子,并绘制了鼻咽癌在自身免疫变化方面的生物学图谱。利用目前临床普遍使用的ELISA方法,我们对这些候选标记物进一步进行了验证,发现自身抗体PCNA IgG和hsp70 IgG两个有效区分鼻咽癌患者和健康人的标记物分子。该研究为今后开展不同阶段和不同亚型的鼻咽癌肿瘤诊断和治疗用生物标记物以及相应的转化医学研究提供蛋白质组学新技术新方法。同时为下一步开展实验室内和实验室间的大规模临床样本验证、鼻咽癌血清诊断试剂的研发和个性化诊治奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Multiplexed Nucleic Acid Programmable Protein Arrays.
多重核酸可编程蛋白质阵列。
  • DOI:
    10.7150/thno.20151
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Theranostics
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Yu X;Song L;Petritis B;Bian X;Wang H;Viloria J;Park J;Bui H;Li H;Wang J;Liu L;Yang L;Duan H;McMurray DN;Achkar JM;Magee M;Qiu J;LaBaer J
  • 通讯作者:
    LaBaer J
Development of RBC Membrane Antigen Arrays for Validating Blood Grouping Reagents
开发用于验证血型试剂的红细胞膜抗原阵列
  • DOI:
    10.1021/acs.jproteome.8b00370
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    J Proteome Res
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lu Yang;Xiaobo Yu
  • 通讯作者:
    Xiaobo Yu
基于抗体芯片的肝癌血清蛋白表达图谱分析和应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    军事医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    许萌;王红叶;代佳宇;赵晓航;牟劲松;刘伟;孙薇;许丹科;于晓波
  • 通讯作者:
    于晓波
Serum Protein Profiling Reveals a Landscape of Inflammation and Immune Signaling in Early-stage COVID-19 Infection.
血清蛋白分析揭示了早期 COVID-19 感染中的炎症和免疫信号传导情况
  • DOI:
    10.1074/mcp.rp120.002128
  • 发表时间:
    2020-11
  • 期刊:
    Molecular & cellular proteomics : MCP
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Hou X;Zhang X;Wu X;Lu M;Wang D;Xu M;Wang H;Liang T;Dai J;Duan H;Xu Y;Yu X;Li Y
  • 通讯作者:
    Li Y
In-depth serum proteomics reveals biomarkers of psoriasis severity and response to traditional Chinese medicine
深入的血清蛋白质组学揭示了银屑病严重程度和对中药反应的生物标志物
  • DOI:
    10.7150/thno.31144
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    THERANOSTICS
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Xu, Meng;Deng, Jingwen;Yu, Xiaobo
  • 通讯作者:
    Yu, Xiaobo

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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Organometallics
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    于晓波;王晶晶;郭为杰;田昀;王建辉
  • 通讯作者:
    王建辉
小耳畸形心理弹性的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中国美容整形外科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    潘博;蒋海越;于晓波
  • 通讯作者:
    于晓波
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    煤炭工程
  • 影响因子:
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  • 作者:
    郗朋;张振阳;于晓波;蒋武学
  • 通讯作者:
    蒋武学

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人类自身抗原的分子组成规律及转化应用研究
  • 批准号:
    31870823
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    59.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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