药用真菌猪苓菌丝形成菌核差异基因及功能的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31201666
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1510.食用真菌学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Polyporus umbellatus is one of the most widely used and precious medicinal fungi, which has been used to treat many diseases such as edema and acute nephritis for more than two thousand years. However, wild sclerotia of P. umbellatus are almost in danger of extinction due to unrestricted commercial harvesting, ineffective protection, and severe habitat destruction. .This study is conducted to analyze expressed sequence tags (ESTs) data based on suppressive subtractive hybridization cDNA library of P. umbellatus sclerotia and hyphae which has been successfully constructed. Then gene expression of oxidative stress and signal pathways which are probably associated with P. umbellatus sclerotia forming from hyphae will be detected by real-time quantitative fluorescence polymerase chain reaction (PCR). Full-length genes will be cloned by means of RACE. At last, Fuctional verification of genes associated with P. umbellatus sclerotial formation will be conducted..This study will provide us for gene expression characteristics in uncovering growth and development in P. umbellatus. On the other hand, it will help us to understand mechanisms of sclerotial formation and serve as a basis for implementing mass production of P. umbellatus.
猪苓是一种珍贵的药用真菌,其菌核入药,猪苓菌核在我国用药已达两千多年的历史。然而,随着猪苓菌核药用范围和用量的扩大,加上野生猪苓菌核资源的商业采挖以及缺乏有效的保护,使得猪苓菌核的生境遭受严重破坏,野生的猪苓菌核资源濒临枯竭。.本项目研究内容包括:通过成功构建的猪苓菌丝形成菌核抑制差减杂交cDNA文库,对表达序列标签进行数据分析;利用实时荧光定量PCR技术分析与氧化应激、信号转导途径等相关基因响应猪苓菌丝形成菌核过程中的基因表达分析;利用RACE技术克隆全长基因,并对猪苓菌核形成相关基因进行初步的功能验证。.上述研究工作的开展,不仅为揭示猪苓菌生长发育规律的基因表达特征奠定基础,同时为解析猪苓菌核形成及对药用真菌猪苓菌核的人工栽培工作提供理论依据。此项工作不仅具有重要的理论意义,而且具有潜在的应用价值。

结项摘要

猪苓是一种珍贵的药用真菌。然而,猪苓菌核目前处于濒危状态,猪苓菌丝形成菌核关键技术及形成机理成为制约猪苓菌核人工栽培技术的主要瓶颈。本项目通过成功构建的猪苓菌丝形成菌核抑制差减杂交cDNA文库,对表达序列标签进行数据分析;利用实时荧光定量PCR技术分析与氧化应激、信号转导途径等相关基因响应猪苓菌丝形成菌核过程中的基因表达分析;利用RACE技术克隆全长基因,并对猪苓菌核形成相关基因进行初步的功能验证。研究发现,在成功构建容量为1314个克隆的猪苓菌丝形成菌核的差减杂交cDNA文库基础上,共获得大于100bp的有效序列1202个。利用Cap3进行聚类拼接后,共获得746个一致序列,包括222个contigs和524个singletons。从文库中鉴定到丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)、GTP结合蛋白、依赖于钙调素的蛋白激酶等参与信号传导的基因、NADPH氧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶、半胱氨酸过氧化物酶的相关序列,以及细胞凋亡抑制因子等相关序列。在猪苓菌丝形成菌核的SSH文库中选取了55个候选基因,采用SYBR Green I荧光定量PCR方法对候选基因进行了表达验证。其中表达上调的基因序列46个,下调表达的9个,上调表达序列中大于2倍的36个。对氧化应激相关基因在菌丝形成菌核过程中的转录水平进行分析,菌核中氧化酶相关基因的表达量远高于菌丝组织,而过氧化物酶基因在菌核中低表达。细胞信号相关基因在菌核中的转录水平均高于未形成菌核的菌丝组织,这些基因分别编码G蛋白、small GTPase类、蛋白激酶等。从猪苓中克隆得到新的NADPH氧化酶、乙二醛氧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶和半胱氨酸过氧化物酶全长cDNA、 MAPK基因、4个小G蛋白基因、溶血素全长cDNA以及3个新的编码疏水蛋白的全长基因。NADPH氧化酶特异性抑制剂不仅使猪苓菌丝生长明显减缓,且不能成功诱导菌核形成,同时明显抑制猪苓菌丝细胞内ROS含量。草酸作为抗氧化剂能够抑制猪苓菌核的形成。MAPK抑制剂(PD98059)或Ras抑制剂FTI-277的应用能够明显抑制猪苓菌丝形成菌核,qRT-PCR分析显示MAPK或Ras基因的表达量与不使用抑制剂的对照组相比明显降低。上述研究结果为揭示猪苓生长发育的基因表达特征以及猪苓菌丝形成菌核的分子机理奠定基础,同时为猪苓菌核的栽培工作提供理论依据。

项目成果

期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
ESTs analysis of putative genes engaged in Polyporus umbellatus sclerotial development.
猪苓菌核发育相关基因的 EST 分析
  • DOI:
    10.3390/ijms150915951
  • 发表时间:
    2014-09-10
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Song C;Liu M;Xing Y;Guo S
  • 通讯作者:
    Guo S
Oxalic acid and sclerotial differentiation of Polyporus umbellatus.
草酸与猪苓菌核分化
  • DOI:
    10.1038/srep10759
  • 发表时间:
    2015-06-01
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Xing YM;Yin WQ;Liu MM;Wang CL;Guo SX
  • 通讯作者:
    Guo SX
Transcriptome analysis of genes involved in defence response in Polyporus umbellatus with Armillaria mellea infection.
蜜环菌感染猪苓防御反应相关基因的转录组分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015-11-03
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Liu MM;Xing YM;Zhang DW;Guo SX
  • 通讯作者:
    Guo SX
猪苓菌丝体的化学成分研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国现代中药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈晓梅;周微微;王春兰;郭顺星
  • 通讯作者:
    郭顺星
药用真菌猪苓共生的蜜环菌种类研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国药学杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    刘蒙蒙;邢咏梅;郭顺星
  • 通讯作者:
    郭顺星

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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